More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1814 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3659  SSS sodium solute transporter superfamily  67.96 
 
 		 542 aa  635    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.641913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06910  SSS sodium solute transporter  67.49 
 
 		 540 aa  640    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13340  SSS sodium solute transporter  70.79 
 
 		 556 aa  661    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0683463  normal  0.0921974 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4284  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  69.32 
 
 		 541 aa  664    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.231008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2139  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  69.38 
 
 		 543 aa  656    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.301041 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4055  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  69.5 
 
 		 541 aa  665    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.647451  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0694  SSS sodium solute transporter superfamily  70.6 
 
 		 543 aa  653    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1378  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  69.14 
 
 		 538 aa  635    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1814  SSS sodium solute transporter superfamily  100 
 
 		 545 aa  1066    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4130  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  69.5 
 
 		 541 aa  665    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.502613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4564  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  70.11 
 
 		 543 aa  667    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.252386  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1967  SSS sodium solute transporter superfamily  68.52 
 
 		 552 aa  642    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.732438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1396  SSS sodium solute transporter superfamily  70.29 
 
 		 538 aa  628  1e-179  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000408051 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03080  SSS sodium solute transporter  66.48 
 
 		 528 aa  627  1e-178  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3373  SSS sodium solute transporter superfamily  66.85 
 
 		 536 aa  626  1e-178  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.346982  normal  0.514599 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0071  SSS sodium solute transporter superfamily  68.31 
 
 		 528 aa  625  1e-178  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1075  SSS sodium solute transporter superfamily  69.89 
 
 		 546 aa  621  1e-177  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.099805  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12100  SSS sodium solute transporter  68.79 
 
 		 532 aa  622  1e-177  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2862  Na+/solute symporter  66.73 
 
 		 537 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0219  SSS sodium solute transporter superfamily  64.81 
 
 		 552 aa  599  1e-170  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5174  SSS sodium solute transporter superfamily  61.58 
 
 		 525 aa  585  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1161  SSS sodium solute transporter superfamily  61.82 
 
 		 568 aa  580  1e-164  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.710493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3167  SSS sodium solute transporter superfamily  61.8 
 
 		 536 aa  571  1e-161  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0572213  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6314  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  62.06 
 
 		 536 aa  562  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.267295  normal  0.199401 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4508  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  60.66 
 
 		 557 aa  561  1.0000000000000001e-159  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5018  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  59.67 
 
 		 557 aa  556  1e-157  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000399279 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2129  SSS sodium solute transporter superfamily protein  60.23 
 
 		 537 aa  550  1e-155  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.896322  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4127  SSS sodium solute transporter superfamily  55.54 
 
 		 561 aa  533  1e-150  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1538  SSS sodium solute transporter superfamily protein  58.87 
 
 		 551 aa  530  1e-149  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.535704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0347  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  57.81 
 
 		 534 aa  530  1e-149  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3815  Na+/solute symporter  56.2 
 
 		 584 aa  510  1e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00808534 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1760  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  50.85 
 
 		 530 aa  491  9.999999999999999e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.983666  normal  0.122546 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1330  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  52.76 
 
 		 516 aa  487  1e-136  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.892115  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1726  sodium/solute symporter family protein  51.61 
 
 		 516 aa  483  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1518  sodium/solute symporter family protein  51.61 
 
 		 516 aa  480  1e-134  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.782594  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1480  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  51.61 
 
 		 516 aa  481  1e-134  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1635  sodium/solute symporter family protein  51.61 
 
 		 516 aa  480  1e-134  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1672  sodium/solute symporter family protein  51.8 
 
 		 516 aa  481  1e-134  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.206426  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1777  sodium/solute symporter family protein  51.61 
 
 		 516 aa  481  1e-134  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1703  sodium/solute symporter family protein  51.61 
 
 		 516 aa  480  1e-134  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1523  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  51.8 
 
 		 516 aa  480  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.292925  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3672  sodium/solute symporter family protein  51.8 
 
 		 516 aa  480  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0653794  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1490  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  51.42 
 
 		 516 aa  478  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0960795  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2352  sodium/solute symporter family protein  46.11 
 
 		 584 aa  455  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0827  SSS sodium solute transporter superfamily  49.42 
 
 		 513 aa  457  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1021  SSS sodium solute transporter superfamily  48.55 
 
 		 515 aa  450  1e-125  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.359049  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1397  SSS sodium solute transporter superfamily  46.15 
 
 		 665 aa  451  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000364072  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0315  SSS sodium solute transporter superfamily  47.88 
 
 		 519 aa  451  1e-125  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.721086 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1718  SSS sodium solute transporter superfamily  48.93 
 
 		 511 aa  449  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1420  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  45.04 
 
 		 659 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140042  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2490  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  46.82 
 
 		 515 aa  444  1e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1850  SSS sodium solute transporter superfamily  48.77 
 
 		 513 aa  441  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1399  SSS sodium solute transporter superfamily  44.55 
 
 		 661 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00201971  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1070  sodium/solute symporter family protein  45.44 
 
 		 584 aa  436  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00394385  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1608  acetate permease  47.29 
 
 		 552 aa  435  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409391 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0295  acetate permease  47.18 
 
 		 550 aa  438  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510607  hitchhiker  0.000229004 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1624  sodium:solute symporter family protein  46.87 
 
 		 552 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.484288  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3756  acetate permease  47.06 
 
 		 552 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.574544  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0739  Na+/solute symporter  44.76 
 
 		 584 aa  434  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000119238  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3377  acetate permease  45.52 
 
 		 552 aa  431  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0784287  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4529  acetate permease  46.14 
 
 		 549 aa  429  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03939  acetate permease  45.76 
 
 		 549 aa  426  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.68156  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3925  cation/acetate symporter ActP  45.76 
 
 		 549 aa  426  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1068  sodium/solute symporter family protein  46.11 
 
 		 584 aa  426  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272224  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1891  acetate permease  45.73 
 
 		 551 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.45053  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0465  SSS sodium solute transporter superfamily  45.7 
 
 		 576 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4622  acetate permease  45.95 
 
 		 549 aa  428  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0375  acetate permease  47.81 
 
 		 553 aa  426  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3960  acetate permease  45.95 
 
 		 549 aa  428  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.221467 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5572  acetate permease  45.95 
 
 		 549 aa  427  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3949  acetate permease  46.3 
 
 		 551 aa  426  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.739246 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03899  hypothetical protein  45.76 
 
 		 549 aa  426  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.790578  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0635  acetate permease  46.04 
 
 		 559 aa  426  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.953483  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4311  acetate permease  45.95 
 
 		 549 aa  428  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0449  SSS sodium solute transporter superfamily  45.7 
 
 		 576 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.254616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3923  acetate permease  46.3 
 
 		 551 aa  425  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281224  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1743  acetate permease  45.92 
 
 		 554 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0912  acetate permease  45.2 
 
 		 552 aa  424  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0683  acetate permease  45.2 
 
 		 552 aa  422  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3976  acetate permease  46.11 
 
 		 554 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.900001  normal  0.864966 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4533  acetate permease  45.57 
 
 		 549 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.612121  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1980  Na+/solute symporter  45.2 
 
 		 576 aa  424  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5783  acetate permease  47.62 
 
 		 553 aa  424  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.061822 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1542  SSS sodium solute transporter superfamily  44.76 
 
 		 577 aa  425  1e-117  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000862893  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4668  acetate permease  45.76 
 
 		 549 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.962936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4619  acetate permease  45.76 
 
 		 549 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22350  acetate permease  45.73 
 
 		 551 aa  425  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000316225 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1335  acetate permease  45.92 
 
 		 554 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.384462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3836  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  46.11 
 
 		 539 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.808948 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3837  acetate permease  46.3 
 
 		 551 aa  425  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0353587  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4526  acetate permease  45.57 
 
 		 549 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4586  acetate permease  45.76 
 
 		 549 aa  425  1e-117  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781469  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4617  acetate permease  45.57 
 
 		 549 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.825598  normal  0.309264 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1293  acetate permease  45.54 
 
 		 554 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2431  acetate permease  46.04 
 
 		 577 aa  419  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.157146  normal  0.21776 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3262  acetate permease  44.26 
 
 		 552 aa  419  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1517  SSS sodium solute transporter superfamily  44.56 
 
 		 664 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000116414  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5873  acetate permease  45.45 
 
 		 553 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0958  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  45.22 
 
 		 570 aa  416  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.483778 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1340  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  43.99 
 
 		 655 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>