More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2994 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2994  Na+/solute symporter  100 
 
 		 632 aa  1221    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.77047  normal  0.396474 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5018  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  57.61 
 
 		 557 aa  565  1e-160  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000399279 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4508  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  57.61 
 
 		 557 aa  567  1e-160  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4127  SSS sodium solute transporter superfamily  56.02 
 
 		 561 aa  560  1e-158  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1161  SSS sodium solute transporter superfamily  55.62 
 
 		 568 aa  550  1e-155  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.710493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3167  SSS sodium solute transporter superfamily  57.75 
 
 		 536 aa  545  1e-154  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0572213  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1538  SSS sodium solute transporter superfamily protein  55.88 
 
 		 551 aa  528  1e-149  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.535704  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2129  SSS sodium solute transporter superfamily protein  54.86 
 
 		 537 aa  525  1e-148  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.896322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3815  Na+/solute symporter  56.92 
 
 		 584 aa  514  1e-144  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00808534 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6314  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  54.31 
 
 		 536 aa  503  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.267295  normal  0.199401 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0347  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  54.5 
 
 		 534 aa  489  1e-137  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06910  SSS sodium solute transporter  49.91 
 
 		 540 aa  470  1.0000000000000001e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1967  SSS sodium solute transporter superfamily  50.18 
 
 		 552 aa  460  9.999999999999999e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.732438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3373  SSS sodium solute transporter superfamily  49.72 
 
 		 536 aa  457  1e-127  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.346982  normal  0.514599 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0071  SSS sodium solute transporter superfamily  49.64 
 
 		 528 aa  453  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13340  SSS sodium solute transporter  49.09 
 
 		 556 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0683463  normal  0.0921974 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12100  SSS sodium solute transporter  48.91 
 
 		 532 aa  449  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1378  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  47.64 
 
 		 538 aa  447  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3659  SSS sodium solute transporter superfamily  49.81 
 
 		 542 aa  440  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.641913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1396  SSS sodium solute transporter superfamily  47.36 
 
 		 538 aa  436  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000408051 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2139  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  47.3 
 
 		 543 aa  436  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.301041 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4564  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  48.21 
 
 		 543 aa  438  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.252386  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1726  sodium/solute symporter family protein  43.67 
 
 		 516 aa  434  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1480  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  43.67 
 
 		 516 aa  432  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4284  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  47.04 
 
 		 541 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.231008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4055  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  47.22 
 
 		 541 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.647451  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0694  SSS sodium solute transporter superfamily  47.01 
 
 		 543 aa  434  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4130  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  47.22 
 
 		 541 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.502613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1777  sodium/solute symporter family protein  43.67 
 
 		 516 aa  432  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1518  sodium/solute symporter family protein  43.67 
 
 		 516 aa  431  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.782594  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1490  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  43.49 
 
 		 516 aa  429  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0960795  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1672  sodium/solute symporter family protein  43.85 
 
 		 516 aa  432  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.206426  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1703  sodium/solute symporter family protein  43.67 
 
 		 516 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1635  sodium/solute symporter family protein  43.67 
 
 		 516 aa  431  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1523  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  43.67 
 
 		 516 aa  432  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.292925  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0219  SSS sodium solute transporter superfamily  47.99 
 
 		 552 aa  429  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3672  sodium/solute symporter family protein  43.67 
 
 		 516 aa  431  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0653794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2862  Na+/solute symporter  47.6 
 
 		 537 aa  429  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0827  SSS sodium solute transporter superfamily  44.42 
 
 		 513 aa  426  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03080  SSS sodium solute transporter  47.92 
 
 		 528 aa  427  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1330  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  43.3 
 
 		 516 aa  424  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.892115  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1760  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  45.21 
 
 		 530 aa  424  1e-117  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.983666  normal  0.122546 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1075  SSS sodium solute transporter superfamily  49.17 
 
 		 546 aa  419  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.099805  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1718  SSS sodium solute transporter superfamily  43.72 
 
 		 511 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1814  SSS sodium solute transporter superfamily  46.51 
 
 		 545 aa  409  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1420  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  39.7 
 
 		 659 aa  397  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140042  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1021  SSS sodium solute transporter superfamily  40.39 
 
 		 515 aa  398  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.359049  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5174  SSS sodium solute transporter superfamily  45.29 
 
 		 525 aa  394  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2490  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  41.28 
 
 		 515 aa  392  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1070  sodium/solute symporter family protein  39.56 
 
 		 584 aa  387  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00394385  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3836  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  40.98 
 
 		 539 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.808948 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1397  SSS sodium solute transporter superfamily  38.2 
 
 		 665 aa  382  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000364072  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0315  SSS sodium solute transporter superfamily  40.81 
 
 		 519 aa  385  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.721086 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2352  sodium/solute symporter family protein  38.92 
 
 		 584 aa  381  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0739  Na+/solute symporter  38.02 
 
 		 584 aa  380  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000119238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3703  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  40.69 
 
 		 541 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2699  SSS sodium solute transporter superfamily  39.15 
 
 		 665 aa  375  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000107835 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3760  SSS sodium solute transporter superfamily  40.69 
 
 		 541 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3843  SSS sodium solute transporter superfamily  40.69 
 
 		 541 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1850  SSS sodium solute transporter superfamily  40.51 
 
 		 513 aa  369  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1399  SSS sodium solute transporter superfamily  38.73 
 
 		 661 aa  372  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00201971  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1517  SSS sodium solute transporter superfamily  39.15 
 
 		 664 aa  371  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000116414  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1068  sodium/solute symporter family protein  40.17 
 
 		 584 aa  366  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272224  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5210  SSS sodium solute transporter superfamily  42.22 
 
 		 563 aa  367  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4785  SSS sodium solute transporter superfamily  42.22 
 
 		 563 aa  367  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.782319  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5596  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  41.27 
 
 		 560 aa  367  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0635  acetate permease  39.1 
 
 		 559 aa  362  8e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.953483  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2856  SSS sodium solute transporter superfamily  37.13 
 
 		 657 aa  355  1e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1542  SSS sodium solute transporter superfamily  37.71 
 
 		 577 aa  355  1e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000862893  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1424  SSS sodium solute transporter superfamily  37.4 
 
 		 659 aa  355  1e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5873  acetate permease  39.51 
 
 		 553 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2623  acetate permease  38.74 
 
 		 563 aa  352  1e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0375  acetate permease  39.23 
 
 		 553 aa  351  2e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3288  Na+/solute symporter  40.1 
 
 		 655 aa  350  3e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5783  acetate permease  39.48 
 
 		 553 aa  350  4e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.061822 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2787  SSS sodium solute transporter superfamily  39.17 
 
 		 561 aa  350  5e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2564  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  39.17 
 
 		 561 aa  350  5e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.868226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2496  SSS sodium solute transporter superfamily  39.17 
 
 		 561 aa  350  6e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.342861 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0556  acetate permease  39.52 
 
 		 572 aa  349  7e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1624  sodium:solute symporter family protein  36.68 
 
 		 552 aa  348  2e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.484288  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0295  acetate permease  37.5 
 
 		 550 aa  348  2e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510607  hitchhiker  0.000229004 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0143  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  42.2 
 
 		 524 aa  347  3e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1373  SSS sodium solute transporter superfamily  37.52 
 
 		 662 aa  347  3e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174329 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2382  Na+/solute symporter  40.96 
 
 		 528 aa  347  5e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1891  acetate permease  37.25 
 
 		 551 aa  346  6e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.45053  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22350  acetate permease  37.25 
 
 		 551 aa  346  8e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000316225 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2624  acetate permease  39.57 
 
 		 520 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.332014  normal  0.410104 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0887  SSS sodium solute transporter superfamily  38.04 
 
 		 553 aa  345  1e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1379  acetate permease  39.36 
 
 		 574 aa  345  1e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.644113  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3756  acetate permease  36.51 
 
 		 552 aa  345  2e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.574544  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1980  Na+/solute symporter  39.25 
 
 		 576 aa  345  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0970  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  37.25 
 
 		 516 aa  344  2e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0531  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  41.35 
 
 		 508 aa  345  2e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2954  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  39.86 
 
 		 563 aa  345  2e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2840  SSS sodium solute transporter superfamily  37.75 
 
 		 661 aa  344  2.9999999999999997e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1608  acetate permease  37.36 
 
 		 552 aa  343  4e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409391 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2637  acetate permease  39.89 
 
 		 520 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0134816  normal  0.110643 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0004  acetate permease  36.09 
 
 		 548 aa  343  4e-93  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.415194  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3160  SSS sodium solute transporter superfamily  42.86 
 
 		 554 aa  343  5e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261717  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5185  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  41.35 
 
 		 508 aa  343  5.999999999999999e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.204616 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>