More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3406 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1794  Na+/solute symporter  60.95 
 
 
594 aa  641    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0136163  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4790  SSS sodium solute transporter superfamily  83.21 
 
 
563 aa  872    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1651  Na+/solute symporter  61.6 
 
 
590 aa  651    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.466603  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1177  Na+/solute symporter  79.79 
 
 
559 aa  863    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2479  putative sodium symporter protein  63.05 
 
 
593 aa  733    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.025526 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0486  sodium:solute symporter family protein  61.63 
 
 
594 aa  645    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.355483  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0630  sodium:solute symporter family protein  62.44 
 
 
591 aa  675    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1771  Na+/solute symporter  61.03 
 
 
589 aa  640    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.509872 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1298  SSS sodium solute transporter superfamily  66.78 
 
 
575 aa  703    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.883366 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0525  Na+/solute symporter  59.08 
 
 
573 aa  645    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2047  Na+/solute symporter  76.61 
 
 
548 aa  761    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.91078  normal  0.880017 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3406  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  100 
 
 
560 aa  1112    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210868 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4040  putative sodium symporter protein  78.43 
 
 
551 aa  834    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.824873  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0555  Na+/solute symporter  61.99 
 
 
591 aa  669    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00721  Na+/solute symporter, Ssf family protein  59.79 
 
 
568 aa  628  1e-179  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1496  Na+/solute symporter  60.72 
 
 
558 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.289055  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0263  Na+/solute symporter  57.6 
 
 
572 aa  608  1e-173  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169809  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3832  symporter  58.12 
 
 
586 aa  607  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.539605 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2828  putative sodium/solute symporter  58.29 
 
 
567 aa  605  9.999999999999999e-173  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2278  putative sodium/solute symporter  58.47 
 
 
567 aa  606  9.999999999999999e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2371  Na+/solute symporter  57.42 
 
 
572 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000181178 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2857  sodium/solute symporter family protein  58.32 
 
 
578 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1547  Na+/solute symporter  57.95 
 
 
572 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1746  Na+/solute symporter  56.89 
 
 
572 aa  600  1e-170  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000905196 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1696  Na+/solute symporter  57.07 
 
 
572 aa  600  1e-170  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2838  Na+/solute symporter  57.42 
 
 
572 aa  598  1e-170  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149628 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2358  Na+/solute symporter  57.79 
 
 
578 aa  597  1e-169  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1514  Na+/solute symporter  58.22 
 
 
578 aa  597  1e-169  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0136717 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1581  Na+/solute symporter  58.22 
 
 
578 aa  597  1e-169  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.292931  normal  0.0106381 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1575  Na+/solute symporter  58.39 
 
 
578 aa  597  1e-169  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000206657 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2752  Na+/solute symporter  58.04 
 
 
578 aa  595  1e-169  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2638  Na+/solute symporter  57.52 
 
 
578 aa  593  1e-168  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1711  Na+/solute symporter  57.69 
 
 
578 aa  592  1e-168  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.18634  hitchhiker  0.000000238348 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2673  Na+/solute symporter  57.52 
 
 
578 aa  593  1e-168  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1042  Na+/solute symporter  53.82 
 
 
609 aa  589  1e-167  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.972047  normal  0.384314 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1523  sodium/solute symporter family protein  57.6 
 
 
572 aa  590  1e-167  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0319  Na+/solute symporter  56.23 
 
 
566 aa  587  1e-166  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0989062  normal  0.0129001 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5743  putative sodium symporter protein  54.82 
 
 
619 aa  581  1e-164  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0088  sodium:solute symporter family protein  55.78 
 
 
604 aa  578  1.0000000000000001e-163  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.208798 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2050  Na+/solute symporter  51.1 
 
 
593 aa  572  1.0000000000000001e-162  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.500291 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1865  putative sodium symporter protein  51.88 
 
 
592 aa  570  1e-161  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151601  normal  0.340772 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00160  sodium/solute symporter  53.97 
 
 
575 aa  559  1e-158  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002207  acetate permease ActP (cation/acetate symporter)  54.05 
 
 
575 aa  558  1e-158  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1439  Na+ symporter  52.78 
 
 
588 aa  543  1e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3696  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  54.32 
 
 
582 aa  538  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3155  ribonuclease E and G  52.23 
 
 
589 aa  539  9.999999999999999e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0900  Na+/solute symporter  53.36 
 
 
588 aa  540  9.999999999999999e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1960  SSS family Na(+)/solute symporter  49.68 
 
 
622 aa  538  1e-151  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.753241 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2254  Na+/solute symporter  49.35 
 
 
622 aa  536  1e-151  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.61978  normal  0.0640181 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0279  Na+/solute symporter  50 
 
 
622 aa  537  1e-151  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0772633  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4952  sodium/solute symporter family protein  51.37 
 
 
596 aa  531  1e-149  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3754  SSS sodium solute transporter superfamily  54.32 
 
 
582 aa  528  1e-149  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.40696  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3837  SSS sodium solute transporter superfamily  54.32 
 
 
582 aa  530  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0871  Na+/solute symporter  51.28 
 
 
593 aa  526  1e-148  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4552  Na+/solute symporter  49.16 
 
 
603 aa  525  1e-148  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4101  Na+/solute symporter  50.6 
 
 
589 aa  525  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1263  Na+/solute symporter  47.78 
 
 
618 aa  518  1e-146  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625499  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2229  Na+/solute symporter  51.01 
 
 
605 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.164942  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0576  Na+/solute symporter  51.01 
 
 
605 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3556  sodium/solute symporter family protein  49.41 
 
 
598 aa  493  9.999999999999999e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3666  Na+/solute symporter  48.55 
 
 
594 aa  489  1e-137  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0507  Na+/solute symporter  50.68 
 
 
605 aa  488  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.318357  normal  0.0591632 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0245  SSS sodium solute transporter superfamily  43.93 
 
 
729 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3139  Na+ symporter  42.26 
 
 
637 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1628  Na+/solute symporter  41.36 
 
 
722 aa  429  1e-119  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413609  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0351  Na+/solute symporter  43.55 
 
 
759 aa  417  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.572111  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0112  Na+/solute symporter  43 
 
 
760 aa  407  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3462  Na+/solute symporter  39.97 
 
 
719 aa  400  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0141049  normal  0.192987 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1022  SSF family Na(+)/solute symporter  41.03 
 
 
614 aa  383  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12655  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2264  Na+/solute symporter  38.01 
 
 
722 aa  325  9e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000152914 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0518  sodium/solute symporter family protein  34.93 
 
 
507 aa  300  3e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0973  Na+/solute symporter  34.73 
 
 
509 aa  300  4e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2702  Na+/solute symporter  35.23 
 
 
506 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000021967 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3031  Na+/solute symporter  33.03 
 
 
509 aa  276  7e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000436384  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0974  putative sodium symporter protein  33.39 
 
 
560 aa  275  2.0000000000000002e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1514  Na+/solute symporter  34 
 
 
506 aa  274  3e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1223  Na+/solute symporter  33.69 
 
 
562 aa  258  2e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.704891  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1308  Na+/solute symporter  33.15 
 
 
586 aa  256  8e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3165  putative sodium symporter protein  34.12 
 
 
553 aa  253  5.000000000000001e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2908  Na+/solute symporter  31.28 
 
 
509 aa  237  5.0000000000000005e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2647  SSS sodium solute transporter superfamily  52.17 
 
 
681 aa  220  5e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.81017  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1525  putative membrane transport protein  47.41 
 
 
713 aa  218  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.11543 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3039  Na+/solute symporter  46.43 
 
 
703 aa  215  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4144  Na+/solute symporter  48.4 
 
 
705 aa  215  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.269765  normal  0.051822 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2396  Na+/solute symporter  43.78 
 
 
726 aa  208  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.79359 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1637  Na+/solute symporter  38.99 
 
 
678 aa  205  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.75635 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0866  putative membrane transport protein  47.14 
 
 
699 aa  196  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.201818  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1936  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  45.12 
 
 
672 aa  192  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1951  solute:Na+ symporter permease transmembrane protein  39.64 
 
 
688 aa  190  7e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.788395  normal  0.806133 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1774  Na+/solute symporter  37.62 
 
 
687 aa  186  7e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0630  solute/sodium symporter (SSS) family protein  48.02 
 
 
671 aa  186  8e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449761  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1940  sodium:solute symporter family protein  48.02 
 
 
807 aa  186  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2015  sodium:solute symporter family protein  48.02 
 
 
671 aa  186  8e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168656  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2098  SSS sodium solute transporter superfamily  37.93 
 
 
687 aa  186  8e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.275416 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0532  solute/sodium symporter (SSS) family protein  48.02 
 
 
671 aa  186  9e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1792  sodium:solute symporter family protein  48.02 
 
 
671 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.415447  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2052  solute/sodium symporter (SSS) family protein  48.02 
 
 
671 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.483179  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3111  solute/Na+ symporter  46.51 
 
 
672 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392033  decreased coverage  0.0000204813 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0786  solute/sodium symporter (SSS) family protein  48.02 
 
 
671 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1079  sodium:solute symporter family protein  48.02 
 
 
671 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>