More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0525 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0555  Na+/solute symporter  59.57 
 
 		 591 aa  666    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1263  Na+/solute symporter  58.17 
 
 		 618 aa  662    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625499  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2828  putative sodium/solute symporter  74.17 
 
 		 567 aa  861    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1794  Na+/solute symporter  68.65 
 
 		 594 aa  809    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0136163  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00160  sodium/solute symporter  62.99 
 
 		 575 aa  706    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0279  Na+/solute symporter  56.52 
 
 		 622 aa  649    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0772633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2371  Na+/solute symporter  75.91 
 
 		 572 aa  892    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000181178 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4952  sodium/solute symporter family protein  56.93 
 
 		 596 aa  648    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2857  sodium/solute symporter family protein  73.93 
 
 		 578 aa  855    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1711  Na+/solute symporter  74.1 
 
 		 578 aa  861    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.18634  hitchhiker  0.000000238348 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2752  Na+/solute symporter  74.27 
 
 		 578 aa  865    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2838  Na+/solute symporter  75.04 
 
 		 572 aa  881    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149628 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0088  sodium:solute symporter family protein  64.25 
 
 		 604 aa  728    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.208798 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2638  Na+/solute symporter  74.27 
 
 		 578 aa  863    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2278  putative sodium/solute symporter  74.52 
 
 		 567 aa  846    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2673  Na+/solute symporter  74.27 
 
 		 578 aa  863    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0486  sodium:solute symporter family protein  67.33 
 
 		 594 aa  766    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.355483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0630  sodium:solute symporter family protein  59.54 
 
 		 591 aa  655    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1696  Na+/solute symporter  75.39 
 
 		 572 aa  889    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3155  ribonuclease E and G  62.18 
 
 		 589 aa  689    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0871  Na+/solute symporter  60.68 
 
 		 593 aa  662    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00721  Na+/solute symporter, Ssf family protein  87.43 
 
 		 568 aa  1002    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1439  Na+ symporter  60.27 
 
 		 588 aa  667    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0525  Na+/solute symporter  100 
 
 		 573 aa  1157    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1514  Na+/solute symporter  75.99 
 
 		 578 aa  871    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136717 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1581  Na+/solute symporter  75.81 
 
 		 578 aa  870    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.292931  normal  0.0106381 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2050  Na+/solute symporter  57.89 
 
 		 593 aa  675    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.500291 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1547  Na+/solute symporter  76.95 
 
 		 572 aa  907    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0319  Na+/solute symporter  64.14 
 
 		 566 aa  691    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0989062  normal  0.0129001 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002207  acetate permease ActP (cation/acetate symporter)  63.34 
 
 		 575 aa  707    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1651  Na+/solute symporter  69.88 
 
 		 590 aa  806    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.466603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3832  symporter  66.78 
 
 		 586 aa  758    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.539605 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4101  Na+/solute symporter  58.08 
 
 		 589 aa  648    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1865  putative sodium symporter protein  60.34 
 
 		 592 aa  696    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151601  normal  0.340772 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2479  putative sodium symporter protein  61.12 
 
 		 593 aa  723    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.025526 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1042  Na+/solute symporter  64.72 
 
 		 609 aa  754    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.972047  normal  0.384314 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1575  Na+/solute symporter  75.64 
 
 		 578 aa  868    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000206657 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2358  Na+/solute symporter  74.27 
 
 		 578 aa  860    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1746  Na+/solute symporter  74.87 
 
 		 572 aa  884    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000905196 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4552  Na+/solute symporter  58.43 
 
 		 603 aa  655    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1771  Na+/solute symporter  68.39 
 
 		 589 aa  788    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.509872 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1523  sodium/solute symporter family protein  76.78 
 
 		 572 aa  884    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0263  Na+/solute symporter  75.56 
 
 		 572 aa  887    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0900  Na+/solute symporter  60.31 
 
 		 588 aa  655    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3556  sodium/solute symporter family protein  57.64 
 
 		 598 aa  632  1e-180  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3696  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  58.27 
 
 		 582 aa  631  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3754  SSS sodium solute transporter superfamily  58.63 
 
 		 582 aa  622  1e-177  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.40696  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3837  SSS sodium solute transporter superfamily  58.45 
 
 		 582 aa  623  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2254  Na+/solute symporter  55.56 
 
 		 622 aa  624  1e-177  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.61978  normal  0.0640181 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3666  Na+/solute symporter  57.96 
 
 		 594 aa  621  1e-177  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1960  SSS family Na(+)/solute symporter  54.27 
 
 		 622 aa  620  1e-176  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.753241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1177  Na+/solute symporter  60.39 
 
 		 559 aa  620  1e-176  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3406  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  59.08 
 
 		 560 aa  612  9.999999999999999e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.210868 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0507  Na+/solute symporter  56.74 
 
 		 605 aa  608  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.318357  normal  0.0591632 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0576  Na+/solute symporter  56.53 
 
 		 605 aa  598  1e-170  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4040  putative sodium symporter protein  58.98 
 
 		 551 aa  599  1e-170  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.824873  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2229  Na+/solute symporter  56.53 
 
 		 605 aa  598  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.164942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4790  SSS sodium solute transporter superfamily  57.96 
 
 		 563 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1298  SSS sodium solute transporter superfamily  54.68 
 
 		 575 aa  575  1.0000000000000001e-163  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.883366 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5743  putative sodium symporter protein  55.48 
 
 		 619 aa  567  1e-160  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1496  Na+/solute symporter  55.99 
 
 		 558 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.289055  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2047  Na+/solute symporter  51.99 
 
 		 548 aa  464  1e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.91078  normal  0.880017 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0245  SSS sodium solute transporter superfamily  42.78 
 
 		 729 aa  429  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1628  Na+/solute symporter  39.23 
 
 		 722 aa  414  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3139  Na+ symporter  39.15 
 
 		 637 aa  398  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2264  Na+/solute symporter  38.04 
 
 		 722 aa  387  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000152914 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0351  Na+/solute symporter  37.9 
 
 		 759 aa  375  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.572111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3462  Na+/solute symporter  37.37 
 
 		 719 aa  372  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0141049  normal  0.192987 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0112  Na+/solute symporter  37.86 
 
 		 760 aa  355  1e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1022  SSF family Na(+)/solute symporter  38.2 
 
 		 614 aa  343  5e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12655  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0518  sodium/solute symporter family protein  33.39 
 
 		 507 aa  283  7.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0973  Na+/solute symporter  34.17 
 
 		 509 aa  272  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0974  putative sodium symporter protein  33.27 
 
 		 560 aa  253  9.000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3031  Na+/solute symporter  32.21 
 
 		 509 aa  252  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000436384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2702  Na+/solute symporter  34.26 
 
 		 506 aa  248  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000021967 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1514  Na+/solute symporter  34.46 
 
 		 506 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2908  Na+/solute symporter  32.94 
 
 		 509 aa  233  9e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3165  putative sodium symporter protein  29.08 
 
 		 553 aa  231  2e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1308  Na+/solute symporter  31.16 
 
 		 586 aa  230  6e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1223  Na+/solute symporter  32.19 
 
 		 562 aa  222  1.9999999999999999e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.704891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2647  SSS sodium solute transporter superfamily  47.25 
 
 		 681 aa  207  4e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.81017  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1525  putative membrane transport protein  48.79 
 
 		 713 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.11543 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4144  Na+/solute symporter  45.58 
 
 		 705 aa  199  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.269765  normal  0.051822 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3039  Na+/solute symporter  43.33 
 
 		 703 aa  197  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2396  Na+/solute symporter  46.41 
 
 		 726 aa  193  7e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.79359 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1637  Na+/solute symporter  49.26 
 
 		 678 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.75635 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0866  putative membrane transport protein  48.11 
 
 		 699 aa  189  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.201818  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1951  solute:Na+ symporter permease transmembrane protein  36.88 
 
 		 688 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.788395  normal  0.806133 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1774  Na+/solute symporter  36.88 
 
 		 687 aa  184  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1936  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  40.66 
 
 		 672 aa  183  7e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2269  Na+/solute symporter  42.99 
 
 		 683 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0596593  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2098  SSS sodium solute transporter superfamily  35.94 
 
 		 687 aa  179  9e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.275416 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1418  Na+/solute symporter  39.85 
 
 		 672 aa  179  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.181341 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2015  sodium:solute symporter family protein  37.3 
 
 		 671 aa  178  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168656  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3111  solute/Na+ symporter  40.22 
 
 		 672 aa  177  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392033  decreased coverage  0.0000204813 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2228  Na+/solute symporter  40.76 
 
 		 683 aa  177  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2831  Na+/solute symporter  49.04 
 
 		 703 aa  176  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2052  solute/sodium symporter (SSS) family protein  36.33 
 
 		 671 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.483179  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1792  sodium:solute symporter family protein  36.33 
 
 		 671 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.415447  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0786  solute/sodium symporter (SSS) family protein  36.33 
 
 		 671 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>