More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0871 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_2638  Na+/solute symporter  57.97 
 
 		 578 aa  635    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4101  Na+/solute symporter  77.42 
 
 		 589 aa  906    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4952  sodium/solute symporter family protein  62.63 
 
 		 596 aa  685    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2278  putative sodium/solute symporter  60.07 
 
 		 567 aa  654    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1439  Na+ symporter  78.22 
 
 		 588 aa  912    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1865  putative sodium symporter protein  63.8 
 
 		 592 aa  740    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151601  normal  0.340772 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1960  SSS family Na(+)/solute symporter  72.42 
 
 		 622 aa  872    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.753241 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00160  sodium/solute symporter  65.82 
 
 		 575 aa  733    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0088  sodium:solute symporter family protein  62.91 
 
 		 604 aa  688    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.208798 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1651  Na+/solute symporter  59.27 
 
 		 590 aa  646    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.466603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00721  Na+/solute symporter, Ssf family protein  60.68 
 
 		 568 aa  682    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0576  Na+/solute symporter  69.42 
 
 		 605 aa  772    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002207  acetate permease ActP (cation/acetate symporter)  66.16 
 
 		 575 aa  731    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1696  Na+/solute symporter  57.34 
 
 		 572 aa  645    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2828  putative sodium/solute symporter  58.46 
 
 		 567 aa  651    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2838  Na+/solute symporter  56.83 
 
 		 572 aa  638    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149628 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1794  Na+/solute symporter  59.11 
 
 		 594 aa  645    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0136163  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3155  ribonuclease E and G  67.7 
 
 		 589 aa  756    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0871  Na+/solute symporter  100 
 
 		 593 aa  1181    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2254  Na+/solute symporter  72.9 
 
 		 622 aa  875    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.61978  normal  0.0640181 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3666  Na+/solute symporter  69.95 
 
 		 594 aa  782    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1746  Na+/solute symporter  56.44 
 
 		 572 aa  635    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000905196 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2371  Na+/solute symporter  57.8 
 
 		 572 aa  643    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000181178 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0525  Na+/solute symporter  60.68 
 
 		 573 aa  697    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2050  Na+/solute symporter  62.39 
 
 		 593 aa  724    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.500291 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1547  Na+/solute symporter  57.63 
 
 		 572 aa  643    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2229  Na+/solute symporter  69.42 
 
 		 605 aa  772    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.164942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1263  Na+/solute symporter  63.76 
 
 		 618 aa  723    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625499  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3556  sodium/solute symporter family protein  69.65 
 
 		 598 aa  782    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1042  Na+/solute symporter  57.65 
 
 		 609 aa  655    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.972047  normal  0.384314 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2673  Na+/solute symporter  57.97 
 
 		 578 aa  635    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4552  Na+/solute symporter  68.33 
 
 		 603 aa  801    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0279  Na+/solute symporter  73.22 
 
 		 622 aa  881    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0772633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0900  Na+/solute symporter  82.41 
 
 		 588 aa  935    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0507  Na+/solute symporter  69.59 
 
 		 605 aa  776    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.318357  normal  0.0591632 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1711  Na+/solute symporter  57.19 
 
 		 578 aa  633  1e-180  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.18634  hitchhiker  0.000000238348 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2857  sodium/solute symporter family protein  58.38 
 
 		 578 aa  632  1e-180  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1771  Na+/solute symporter  58.77 
 
 		 589 aa  631  1e-180  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.509872 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2752  Na+/solute symporter  57.26 
 
 		 578 aa  632  1e-180  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0486  sodium:solute symporter family protein  58.65 
 
 		 594 aa  633  1e-180  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.355483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2358  Na+/solute symporter  57.63 
 
 		 578 aa  630  1e-179  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1575  Na+/solute symporter  58.04 
 
 		 578 aa  630  1e-179  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000206657 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1514  Na+/solute symporter  57.53 
 
 		 578 aa  625  1e-178  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136717 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1523  sodium/solute symporter family protein  56.76 
 
 		 572 aa  627  1e-178  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0263  Na+/solute symporter  54.93 
 
 		 572 aa  625  1e-178  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1581  Na+/solute symporter  57.36 
 
 		 578 aa  624  1e-177  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.292931  normal  0.0106381 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0319  Na+/solute symporter  58.3 
 
 		 566 aa  622  1e-177  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0989062  normal  0.0129001 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2479  putative sodium symporter protein  53.92 
 
 		 593 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.025526 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3832  symporter  56.29 
 
 		 586 aa  611  1e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.539605 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0555  Na+/solute symporter  52.3 
 
 		 591 aa  553  1e-156  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0630  sodium:solute symporter family protein  51.13 
 
 		 591 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3696  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  52.36 
 
 		 582 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1177  Na+/solute symporter  53.36 
 
 		 559 aa  533  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3837  SSS sodium solute transporter superfamily  52.53 
 
 		 582 aa  533  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3754  SSS sodium solute transporter superfamily  52.69 
 
 		 582 aa  532  1e-150  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.40696  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1298  SSS sodium solute transporter superfamily  52.69 
 
 		 575 aa  528  1e-148  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.883366 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3406  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  51.28 
 
 		 560 aa  528  1e-148  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.210868 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4040  putative sodium symporter protein  51.98 
 
 		 551 aa  517  1.0000000000000001e-145  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.824873  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4790  SSS sodium solute transporter superfamily  50.68 
 
 		 563 aa  500  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5743  putative sodium symporter protein  48.9 
 
 		 619 aa  485  1e-135  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1496  Na+/solute symporter  48.74 
 
 		 558 aa  484  1e-135  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.289055  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2047  Na+/solute symporter  47.21 
 
 		 548 aa  422  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.91078  normal  0.880017 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3139  Na+ symporter  37.73 
 
 		 637 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0245  SSS sodium solute transporter superfamily  39.63 
 
 		 729 aa  378  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0351  Na+/solute symporter  38.72 
 
 		 759 aa  354  2.9999999999999997e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.572111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3462  Na+/solute symporter  38.83 
 
 		 719 aa  346  7e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0141049  normal  0.192987 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1022  SSF family Na(+)/solute symporter  38.14 
 
 		 614 aa  346  7e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12655  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0112  Na+/solute symporter  39.39 
 
 		 760 aa  334  3e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0518  sodium/solute symporter family protein  31.9 
 
 		 507 aa  252  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0974  putative sodium symporter protein  33.22 
 
 		 560 aa  248  2e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1223  Na+/solute symporter  31.65 
 
 		 562 aa  234  4.0000000000000004e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.704891  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2702  Na+/solute symporter  33.4 
 
 		 506 aa  234  5e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000021967 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1308  Na+/solute symporter  32.57 
 
 		 586 aa  229  1e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3165  putative sodium symporter protein  30.46 
 
 		 553 aa  227  5.0000000000000005e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1628  Na+/solute symporter  38.56 
 
 		 722 aa  213  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2908  Na+/solute symporter  32.36 
 
 		 509 aa  211  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2264  Na+/solute symporter  51.92 
 
 		 722 aa  211  4e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000152914 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0973  Na+/solute symporter  39.87 
 
 		 509 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2647  SSS sodium solute transporter superfamily  41.67 
 
 		 681 aa  196  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.81017  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1525  putative membrane transport protein  47.76 
 
 		 713 aa  192  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.11543 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4144  Na+/solute symporter  38.79 
 
 		 705 aa  191  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.269765  normal  0.051822 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2396  Na+/solute symporter  46.12 
 
 		 726 aa  189  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.79359 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3039  Na+/solute symporter  45.67 
 
 		 703 aa  189  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1951  solute:Na+ symporter permease transmembrane protein  37.21 
 
 		 688 aa  178  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.788395  normal  0.806133 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1637  Na+/solute symporter  45.07 
 
 		 678 aa  179  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.75635 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1760  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.26 
 
 		 530 aa  176  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.983666  normal  0.122546 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1542  SSS sodium solute transporter superfamily  29.45 
 
 		 577 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000862893  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0866  putative membrane transport protein  43.43 
 
 		 699 aa  171  4e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.201818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1774  Na+/solute symporter  36.05 
 
 		 687 aa  170  7e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2098  SSS sodium solute transporter superfamily  36.05 
 
 		 687 aa  169  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.275416 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2052  Na+/solute symporter  40.09 
 
 		 702 aa  167  5.9999999999999996e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.698797  normal  0.324787 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2192  Na+/solute symporter  42.51 
 
 		 769 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.560167  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1514  Na+/solute symporter  37.58 
 
 		 506 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2831  Na+/solute symporter  35.65 
 
 		 703 aa  165  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1936  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  43.75 
 
 		 672 aa  164  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1940  sodium:solute symporter family protein  41.79 
 
 		 807 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2015  sodium:solute symporter family protein  41.79 
 
 		 671 aa  162  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168656  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0630  solute/sodium symporter (SSS) family protein  41.79 
 
 		 671 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449761  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0532  solute/sodium symporter (SSS) family protein  41.79 
 
 		 671 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1792  sodium:solute symporter family protein  41.79 
 
 		 671 aa  162  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.415447  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>