More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2047 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4790  SSS sodium solute transporter superfamily  74.64 
 
 
563 aa  768    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1177  Na+/solute symporter  71.4 
 
 
559 aa  750    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2047  Na+/solute symporter  100 
 
 
548 aa  1085    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.91078  normal  0.880017 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3406  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  76.61 
 
 
560 aa  828    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210868 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4040  putative sodium symporter protein  68.36 
 
 
551 aa  712    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.824873  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2479  putative sodium symporter protein  56.04 
 
 
593 aa  631  1e-180  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.025526 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1298  SSS sodium solute transporter superfamily  59.67 
 
 
575 aa  617  1e-175  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.883366 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0555  Na+/solute symporter  54.59 
 
 
591 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0630  sodium:solute symporter family protein  53.81 
 
 
591 aa  568  1e-160  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0525  Na+/solute symporter  51.99 
 
 
573 aa  556  1e-157  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1651  Na+/solute symporter  53.75 
 
 
590 aa  550  1e-155  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.466603  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1771  Na+/solute symporter  53.78 
 
 
589 aa  550  1e-155  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.509872 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0486  sodium:solute symporter family protein  53.9 
 
 
594 aa  547  1e-154  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.355483  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1794  Na+/solute symporter  53.55 
 
 
594 aa  543  1e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0136163  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00721  Na+/solute symporter, Ssf family protein  53.19 
 
 
568 aa  536  1e-151  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2371  Na+/solute symporter  52.08 
 
 
572 aa  533  1e-150  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000181178 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2278  putative sodium/solute symporter  53.45 
 
 
567 aa  529  1e-149  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2857  sodium/solute symporter family protein  52.15 
 
 
578 aa  527  1e-148  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2828  putative sodium/solute symporter  52.19 
 
 
567 aa  528  1e-148  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1514  Na+/solute symporter  52.24 
 
 
578 aa  525  1e-148  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0136717 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2050  Na+/solute symporter  48.78 
 
 
593 aa  527  1e-148  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.500291 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1547  Na+/solute symporter  52.36 
 
 
572 aa  526  1e-148  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1523  sodium/solute symporter family protein  51.72 
 
 
572 aa  526  1e-148  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0263  Na+/solute symporter  51.27 
 
 
572 aa  525  1e-148  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169809  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1711  Na+/solute symporter  51.98 
 
 
578 aa  522  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.18634  hitchhiker  0.000000238348 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2358  Na+/solute symporter  51.71 
 
 
578 aa  523  1e-147  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2838  Na+/solute symporter  51.27 
 
 
572 aa  522  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149628 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3832  symporter  51.42 
 
 
586 aa  525  1e-147  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.539605 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1746  Na+/solute symporter  51.27 
 
 
572 aa  522  1e-147  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000905196 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1581  Na+/solute symporter  52.34 
 
 
578 aa  525  1e-147  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.292931  normal  0.0106381 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1575  Na+/solute symporter  52.06 
 
 
578 aa  523  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000206657 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1696  Na+/solute symporter  51.27 
 
 
572 aa  523  1e-147  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2673  Na+/solute symporter  51.98 
 
 
578 aa  521  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2638  Na+/solute symporter  51.98 
 
 
578 aa  521  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2752  Na+/solute symporter  51.98 
 
 
578 aa  521  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1865  putative sodium symporter protein  48.25 
 
 
592 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151601  normal  0.340772 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0319  Na+/solute symporter  50.54 
 
 
566 aa  518  1.0000000000000001e-145  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0989062  normal  0.0129001 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1496  Na+/solute symporter  52.4 
 
 
558 aa  513  1e-144  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.289055  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1042  Na+/solute symporter  48.22 
 
 
609 aa  503  1e-141  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.972047  normal  0.384314 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5743  putative sodium symporter protein  50.59 
 
 
619 aa  500  1e-140  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1439  Na+ symporter  48.33 
 
 
588 aa  493  9.999999999999999e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002207  acetate permease ActP (cation/acetate symporter)  49.55 
 
 
575 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00160  sodium/solute symporter  49.37 
 
 
575 aa  491  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1960  SSS family Na(+)/solute symporter  45.81 
 
 
622 aa  482  1e-135  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.753241 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0088  sodium:solute symporter family protein  48.63 
 
 
604 aa  481  1e-134  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.208798 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2254  Na+/solute symporter  45.16 
 
 
622 aa  479  1e-134  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.61978  normal  0.0640181 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0900  Na+/solute symporter  48.34 
 
 
588 aa  477  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3155  ribonuclease E and G  48.09 
 
 
589 aa  478  1e-133  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0279  Na+/solute symporter  45.08 
 
 
622 aa  477  1e-133  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0772633  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4101  Na+/solute symporter  47.22 
 
 
589 aa  473  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3696  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  49.02 
 
 
582 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4952  sodium/solute symporter family protein  46.06 
 
 
596 aa  466  9.999999999999999e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0871  Na+/solute symporter  47.21 
 
 
593 aa  467  9.999999999999999e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3754  SSS sodium solute transporter superfamily  49.2 
 
 
582 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.40696  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1263  Na+/solute symporter  44.35 
 
 
618 aa  464  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625499  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3837  SSS sodium solute transporter superfamily  49.02 
 
 
582 aa  461  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4552  Na+/solute symporter  44.96 
 
 
603 aa  460  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3556  sodium/solute symporter family protein  46.31 
 
 
598 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0507  Na+/solute symporter  48.55 
 
 
605 aa  445  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.318357  normal  0.0591632 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2229  Na+/solute symporter  47.1 
 
 
605 aa  435  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.164942  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0576  Na+/solute symporter  47.1 
 
 
605 aa  435  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3666  Na+/solute symporter  44.12 
 
 
594 aa  431  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0245  SSS sodium solute transporter superfamily  42.83 
 
 
729 aa  410  1e-113  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3139  Na+ symporter  38.05 
 
 
637 aa  395  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1628  Na+/solute symporter  37.85 
 
 
722 aa  377  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413609  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0351  Na+/solute symporter  40.52 
 
 
759 aa  374  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.572111  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0112  Na+/solute symporter  40.73 
 
 
760 aa  361  2e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2264  Na+/solute symporter  38.1 
 
 
722 aa  358  9.999999999999999e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000152914 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1022  SSF family Na(+)/solute symporter  37.46 
 
 
614 aa  345  1e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12655  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3462  Na+/solute symporter  35.34 
 
 
719 aa  326  8.000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0141049  normal  0.192987 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0518  sodium/solute symporter family protein  33.33 
 
 
507 aa  265  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0973  Na+/solute symporter  32.32 
 
 
509 aa  256  9e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3031  Na+/solute symporter  33.02 
 
 
509 aa  248  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000436384  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2702  Na+/solute symporter  32.95 
 
 
506 aa  239  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000021967 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0974  putative sodium symporter protein  31.86 
 
 
560 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1514  Na+/solute symporter  32.45 
 
 
506 aa  229  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1223  Na+/solute symporter  31.58 
 
 
562 aa  224  2e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.704891  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3165  putative sodium symporter protein  31.88 
 
 
553 aa  215  9.999999999999999e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2908  Na+/solute symporter  31.17 
 
 
509 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1308  Na+/solute symporter  30.86 
 
 
586 aa  214  2.9999999999999995e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2647  SSS sodium solute transporter superfamily  40.25 
 
 
681 aa  200  6e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.81017  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3039  Na+/solute symporter  44.89 
 
 
703 aa  197  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1525  putative membrane transport protein  45.09 
 
 
713 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.11543 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4144  Na+/solute symporter  45.28 
 
 
705 aa  189  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.269765  normal  0.051822 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1637  Na+/solute symporter  36.94 
 
 
678 aa  188  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.75635 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2396  Na+/solute symporter  41.96 
 
 
726 aa  185  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.79359 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1951  solute:Na+ symporter permease transmembrane protein  35.15 
 
 
688 aa  178  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.788395  normal  0.806133 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1774  Na+/solute symporter  34.85 
 
 
687 aa  177  6e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0866  putative membrane transport protein  43.6 
 
 
699 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.201818  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2098  SSS sodium solute transporter superfamily  34.85 
 
 
687 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.275416 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1936  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  44.85 
 
 
672 aa  171  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2015  sodium:solute symporter family protein  36.72 
 
 
671 aa  170  6e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168656  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1418  Na+/solute symporter  36.07 
 
 
672 aa  170  7e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.181341 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2107  Na+/solute symporter  37.05 
 
 
671 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.911895  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2831  Na+/solute symporter  36.68 
 
 
703 aa  168  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1087  Na+/solute symporter  35.45 
 
 
671 aa  168  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.215072  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3111  solute/Na+ symporter  35.41 
 
 
672 aa  167  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392033  decreased coverage  0.0000204813 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2228  Na+/solute symporter  36.72 
 
 
671 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1792  sodium:solute symporter family protein  36.72 
 
 
671 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.415447  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0630  solute/sodium symporter (SSS) family protein  36.72 
 
 
671 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449761  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>