More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3165 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_0974  putative sodium symporter protein  62.59 
 
 		 560 aa  649    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3165  putative sodium symporter protein  100 
 
 		 553 aa  1092    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1308  Na+/solute symporter  59.53 
 
 		 586 aa  615  1e-175  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1223  Na+/solute symporter  59.2 
 
 		 562 aa  612  9.999999999999999e-175  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.704891  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0518  sodium/solute symporter family protein  44.4 
 
 		 507 aa  402  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0973  Na+/solute symporter  44.47 
 
 		 509 aa  390  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3031  Na+/solute symporter  42.08 
 
 		 509 aa  367  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000436384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2702  Na+/solute symporter  43.31 
 
 		 506 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000021967 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1514  Na+/solute symporter  43.14 
 
 		 506 aa  345  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2908  Na+/solute symporter  39.73 
 
 		 509 aa  342  1e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1496  Na+/solute symporter  36.61 
 
 		 558 aa  291  1e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.289055  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0319  Na+/solute symporter  33.45 
 
 		 566 aa  283  4.0000000000000003e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0989062  normal  0.0129001 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2479  putative sodium symporter protein  32.43 
 
 		 593 aa  280  4e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.025526 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1865  putative sodium symporter protein  32.42 
 
 		 592 aa  280  7e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151601  normal  0.340772 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0245  SSS sodium solute transporter superfamily  34.93 
 
 		 729 aa  269  8e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0525  Na+/solute symporter  29.71 
 
 		 573 aa  264  3e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3832  symporter  32.52 
 
 		 586 aa  264  4e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.539605 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4101  Na+/solute symporter  32.87 
 
 		 589 aa  263  4e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2828  putative sodium/solute symporter  31.99 
 
 		 567 aa  264  4e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3406  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  34.18 
 
 		 560 aa  261  3e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.210868 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0555  Na+/solute symporter  32.43 
 
 		 591 aa  260  6e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1177  Na+/solute symporter  33.15 
 
 		 559 aa  257  3e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2371  Na+/solute symporter  31.8 
 
 		 572 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000181178 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2358  Na+/solute symporter  32.81 
 
 		 578 aa  253  9.000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1746  Na+/solute symporter  32.1 
 
 		 572 aa  252  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000905196 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1547  Na+/solute symporter  31.39 
 
 		 572 aa  251  3e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1696  Na+/solute symporter  30.47 
 
 		 572 aa  250  5e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2638  Na+/solute symporter  33.16 
 
 		 578 aa  249  7e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2673  Na+/solute symporter  33.16 
 
 		 578 aa  249  7e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2278  putative sodium/solute symporter  31.67 
 
 		 567 aa  249  7e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2838  Na+/solute symporter  31.75 
 
 		 572 aa  249  8e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149628 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1575  Na+/solute symporter  32.47 
 
 		 578 aa  249  8e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000206657 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3155  ribonuclease E and G  30.49 
 
 		 589 aa  248  1e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002207  acetate permease ActP (cation/acetate symporter)  32.98 
 
 		 575 aa  248  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1711  Na+/solute symporter  32.81 
 
 		 578 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.18634  hitchhiker  0.000000238348 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2752  Na+/solute symporter  32.81 
 
 		 578 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00160  sodium/solute symporter  31.92 
 
 		 575 aa  247  4.9999999999999997e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00721  Na+/solute symporter, Ssf family protein  31.14 
 
 		 568 aa  246  8e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2857  sodium/solute symporter family protein  31.99 
 
 		 578 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1514  Na+/solute symporter  32.34 
 
 		 578 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136717 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1581  Na+/solute symporter  32.34 
 
 		 578 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.292931  normal  0.0106381 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1523  sodium/solute symporter family protein  31.94 
 
 		 572 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1439  Na+ symporter  32.36 
 
 		 588 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0263  Na+/solute symporter  31.56 
 
 		 572 aa  245  1.9999999999999999e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169809  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4040  putative sodium symporter protein  33.27 
 
 		 551 aa  244  3e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.824873  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3666  Na+/solute symporter  32.76 
 
 		 594 aa  243  6e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4790  SSS sodium solute transporter superfamily  33.04 
 
 		 563 aa  242  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3696  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  33.39 
 
 		 582 aa  236  6e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1794  Na+/solute symporter  30.41 
 
 		 594 aa  236  7e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0136163  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0871  Na+/solute symporter  31.15 
 
 		 593 aa  234  3e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3556  sodium/solute symporter family protein  30.02 
 
 		 598 aa  233  9e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0900  Na+/solute symporter  31.08 
 
 		 588 aa  232  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3837  SSS sodium solute transporter superfamily  33.62 
 
 		 582 aa  227  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3754  SSS sodium solute transporter superfamily  33.39 
 
 		 582 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.40696  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4952  sodium/solute symporter family protein  30.78 
 
 		 596 aa  224  3e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1022  SSF family Na(+)/solute symporter  29.23 
 
 		 614 aa  204  4e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12655  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0827  SSS sodium solute transporter superfamily  32.68 
 
 		 513 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1850  SSS sodium solute transporter superfamily  31.87 
 
 		 513 aa  192  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4529  acetate permease  30.02 
 
 		 549 aa  192  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5572  acetate permease  30.2 
 
 		 549 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0887  SSS sodium solute transporter superfamily  30.87 
 
 		 553 aa  191  4e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1330  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  32.17 
 
 		 516 aa  191  4e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.892115  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4311  acetate permease  30.02 
 
 		 549 aa  191  4e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03939  acetate permease  30.2 
 
 		 549 aa  190  5e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.68156  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03899  hypothetical protein  30.2 
 
 		 549 aa  190  5e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.790578  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3925  cation/acetate symporter ActP  30.2 
 
 		 549 aa  190  5.999999999999999e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4622  acetate permease  30.2 
 
 		 549 aa  190  5.999999999999999e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3960  acetate permease  30.2 
 
 		 549 aa  190  5.999999999999999e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.221467 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1277  acetate permease  29.29 
 
 		 537 aa  190  5.999999999999999e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1518  sodium/solute symporter family protein  31 
 
 		 516 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.782594  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1490  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  31 
 
 		 516 aa  189  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0960795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1480  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  31 
 
 		 516 aa  189  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1703  sodium/solute symporter family protein  31 
 
 		 516 aa  189  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0739  Na+/solute symporter  30.79 
 
 		 584 aa  189  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000119238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1635  sodium/solute symporter family protein  31 
 
 		 516 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3672  sodium/solute symporter family protein  31.24 
 
 		 516 aa  189  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0653794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1777  sodium/solute symporter family protein  31 
 
 		 516 aa  188  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1726  sodium/solute symporter family protein  31 
 
 		 516 aa  188  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1672  sodium/solute symporter family protein  31.24 
 
 		 516 aa  188  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.206426  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1523  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.47 
 
 		 516 aa  188  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.292925  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4586  acetate permease  29.6 
 
 		 549 aa  187  3e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781469  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1718  SSS sodium solute transporter superfamily  32.41 
 
 		 511 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2352  sodium/solute symporter family protein  31.58 
 
 		 584 aa  187  6e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1070  sodium/solute symporter family protein  30.37 
 
 		 584 aa  186  7e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00394385  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3272  acetate permease  32.79 
 
 		 520 aa  186  8e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1397  SSS sodium solute transporter superfamily  30.17 
 
 		 665 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000364072  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0428  Na+/solute symporter  29.77 
 
 		 559 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00400759  decreased coverage  0.0000917486 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3377  acetate permease  31.02 
 
 		 552 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0784287  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4617  acetate permease  29.6 
 
 		 549 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.825598  normal  0.309264 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2487  acetate permease  32.79 
 
 		 520 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.869989  normal  0.753083 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4526  acetate permease  29.6 
 
 		 549 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1379  acetate permease  31.32 
 
 		 574 aa  186  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.644113  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4668  acetate permease  29.6 
 
 		 549 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.962936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2047  Na+/solute symporter  32.06 
 
 		 548 aa  186  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.91078  normal  0.880017 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4619  acetate permease  29.6 
 
 		 549 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4533  acetate permease  29.6 
 
 		 549 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.612121  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2624  acetate permease  32.79 
 
 		 520 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.332014  normal  0.410104 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1980  Na+/solute symporter  28.89 
 
 		 576 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1118  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.11 
 
 		 552 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.191913  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1760  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  34.52 
 
 		 530 aa  185  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.983666  normal  0.122546 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>