More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2753 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  100 
 
 		 472 aa  936    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  43.54 
 
 		 461 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  43.76 
 
 		 461 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  44.49 
 
 		 479 aa  374  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  40.81 
 
 		 483 aa  367  1e-100  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2906  Na+/solute symporter  45.69 
 
 		 463 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  43.21 
 
 		 463 aa  361  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  42.76 
 
 		 463 aa  358  8e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  40.81 
 
 		 459 aa  342  7e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  40.81 
 
 		 459 aa  342  7e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1620  Na+/solute symporter  43.51 
 
 		 460 aa  342  7e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0163738 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  40.13 
 
 		 459 aa  338  8e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  39.6 
 
 		 462 aa  335  1e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  41.2 
 
 		 459 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  41.46 
 
 		 459 aa  329  6e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0964  Na+/solute symporter  39.3 
 
 		 508 aa  305  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0846  Na+/solute symporter  38.45 
 
 		 507 aa  303  6.000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  37.5 
 
 		 500 aa  298  1e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04330  Na+/proline symporter  37.73 
 
 		 497 aa  274  3e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.723621  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  33.17 
 
 		 474 aa  225  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  27.37 
 
 		 476 aa  189  8e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  25.68 
 
 		 483 aa  188  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  28.05 
 
 		 537 aa  167  5e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  27.74 
 
 		 461 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2710  Na+/solute symporter  27.51 
 
 		 462 aa  162  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.308556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  27.87 
 
 		 482 aa  158  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1817  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.3 
 
 		 484 aa  153  5e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3448  Na+/solute symporter  26.33 
 
 		 495 aa  153  5.9999999999999996e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  28.25 
 
 		 487 aa  153  7e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0190  Na+/solute symporter  28.1 
 
 		 471 aa  153  7e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0470055  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  27.48 
 
 		 483 aa  153  7e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  28.07 
 
 		 486 aa  152  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0695  Na+/solute symporter  27.44 
 
 		 492 aa  151  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.921144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  27.25 
 
 		 482 aa  151  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0924  twin-arginine translocation pathway signal  26.76 
 
 		 452 aa  150  6e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.839391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  28.76 
 
 		 460 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0718  Na+/solute symporter  27.47 
 
 		 486 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0436  Na+/solute symporter  27.45 
 
 		 478 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  26.19 
 
 		 483 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0353  Na+/solute symporter  26.78 
 
 		 479 aa  147  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  27.73 
 
 		 479 aa  147  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4407  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.35 
 
 		 613 aa  147  6e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0343463  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.01 
 
 		 526 aa  146  8.000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0375  Na+/solute symporter  27.27 
 
 		 478 aa  146  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197469 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0041  sodium/pantothenate symporter  27.74 
 
 		 468 aa  146  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.3030600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3709  SSS sodium solute transporter superfamily  26.58 
 
 		 564 aa  143  6e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174317  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0338  Na+/solute symporter  25.65 
 
 		 479 aa  143  7e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4206  Na+/solute symporter  29.05 
 
 		 490 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153775  normal  0.0109856 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0463  sodium/solute symporter transmembrane protein  26.13 
 
 		 479 aa  140  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5240  Na+/solute symporter  26.91 
 
 		 460 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4155  Na+/solute symporter  26.58 
 
 		 515 aa  135  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.128874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0864  hypothetical protein  27.49 
 
 		 524 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.983965  normal  0.0488094 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0993  SSS sodium solute transporter superfamily  25.48 
 
 		 569 aa  132  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0554078  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6118  SSS sodium solute transporter superfamily  25.87 
 
 		 562 aa  131  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0122  Na+/solute symporter  27.41 
 
 		 449 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00309864  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1333  Na+/solute symporter  25.58 
 
 		 466 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000174463  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.82 
 
 		 567 aa  130  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  25.74 
 
 		 464 aa  130  5.0000000000000004e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04060  SSS sodium solute transporter  23.97 
 
 		 565 aa  127  5e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0309  Na+/solute symporter  27.31 
 
 		 510 aa  127  5e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1671  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.89 
 
 		 593 aa  123  7e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302135 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0212  sodium/solute symporter  26.14 
 
 		 475 aa  121  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.200787 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0154  Na+/solute symporter  24.7 
 
 		 531 aa  121  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.535073  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.55 
 
 		 523 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2048  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.42 
 
 		 550 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4721  Na+/solute symporter  25.06 
 
 		 463 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1525  Na+/solute symporter  23.62 
 
 		 475 aa  120  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  25.41 
 
 		 493 aa  119  9e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4843  SSS sodium solute transporter superfamily  25 
 
 		 544 aa  119  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.61 
 
 		 533 aa  119  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0990  SSS sodium solute transporter superfamily  26.52 
 
 		 560 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05410  Sodium:solute symporter  25.49 
 
 		 542 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000184365  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0367  Na+/solute symporter  26.95 
 
 		 446 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.101074  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  26.22 
 
 		 492 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3541  Na+/solute symporter  25.23 
 
 		 597 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165749  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1911  Na+/solute symporter  25.93 
 
 		 460 aa  117  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.504205  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  24.9 
 
 		 551 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  23.31 
 
 		 506 aa  116  6.9999999999999995e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0355  Na+/solute symporter  22.44 
 
 		 492 aa  116  8.999999999999998e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1298  Na+/solute symporter  25.2 
 
 		 472 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.537823 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2635  sodium/solute transporter family urea transporter  27.32 
 
 		 476 aa  113  8.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.451328 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1444  hypothetical protein  24.3 
 
 		 1170 aa  113  8.000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14290  SSS sodium solute transporter  25.66 
 
 		 566 aa  113  8.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1859  SSS sodium solute transporter superfamily  26.17 
 
 		 551 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2163  Na+/solute symporter  23.83 
 
 		 459 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233045 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3090  Na+/solute symporter  26.54 
 
 		 508 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000664536  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  23.71 
 
 		 500 aa  111  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  24.49 
 
 		 492 aa  111  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3294  Na+/solute symporter  25.76 
 
 		 469 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241683  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  24.75 
 
 		 513 aa  110  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6434  Na+/solute symporter  23.38 
 
 		 473 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00922487 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0422  Na+/solute symporter  28.09 
 
 		 476 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273483  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  25.25 
 
 		 492 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  25.26 
 
 		 492 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8130  Na+/solute symporter  27.15 
 
 		 474 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.580887  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  24.75 
 
 		 492 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  24.75 
 
 		 492 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  24.75 
 
 		 492 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  24.75 
 
 		 492 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2325  Na+/solute symporter  28.08 
 
 		 489 aa  108  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00258865  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>