More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_04060 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_14290  SSS sodium solute transporter  66.37 
 
 		 566 aa  654    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04060  SSS sodium solute transporter  100 
 
 		 565 aa  1121    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0993  SSS sodium solute transporter superfamily  66.61 
 
 		 569 aa  717    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0554078  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0990  SSS sodium solute transporter superfamily  67.79 
 
 		 560 aa  691    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6118  SSS sodium solute transporter superfamily  64.96 
 
 		 562 aa  679    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4407  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  68.85 
 
 		 613 aa  765    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0343463  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3709  SSS sodium solute transporter superfamily  51.42 
 
 		 564 aa  552  1e-156  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174317  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  47.15 
 
 		 537 aa  471  1.0000000000000001e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1671  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  45.22 
 
 		 593 aa  469  1.0000000000000001e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302135 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2048  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  43.72 
 
 		 550 aa  434  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  42.1 
 
 		 567 aa  430  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  27.98 
 
 		 557 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  27.98 
 
 		 557 aa  183  7e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  26.54 
 
 		 551 aa  182  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.05 
 
 		 565 aa  180  4.999999999999999e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.74 
 
 		 522 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4728  SSS sodium solute transporter superfamily  28.6 
 
 		 549 aa  173  6.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  hitchhiker  0.00040203 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.63 
 
 		 523 aa  172  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1152  SSS sodium solute transporter superfamily  28.39 
 
 		 562 aa  171  4e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0742973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5244  SSS sodium solute transporter superfamily  27.87 
 
 		 545 aa  170  7e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3635  SSS sodium solute transporter superfamily  29.72 
 
 		 565 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.85975  normal  0.450055 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.14 
 
 		 522 aa  167  5e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  28 
 
 		 592 aa  166  1.0000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1927  SSS sodium solute transporter superfamily  27.78 
 
 		 568 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0029053  normal  0.303256 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  27.96 
 
 		 520 aa  164  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.11 
 
 		 520 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  28.73 
 
 		 523 aa  164  5.0000000000000005e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  28.87 
 
 		 520 aa  163  6e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  28.41 
 
 		 509 aa  162  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.85 
 
 		 520 aa  162  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.87 
 
 		 519 aa  158  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  27.78 
 
 		 520 aa  158  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.85 
 
 		 548 aa  157  6e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.43 
 
 		 522 aa  157  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3116  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.32 
 
 		 522 aa  156  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  27.29 
 
 		 561 aa  156  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.45 
 
 		 561 aa  155  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3072  SSS sodium solute transporter superfamily  26.81 
 
 		 539 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00704051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.9 
 
 		 526 aa  152  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1859  SSS sodium solute transporter superfamily  25.21 
 
 		 551 aa  151  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.31 
 
 		 542 aa  150  8e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.31 
 
 		 533 aa  145  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2732  SSS sodium solute transporter superfamily  27.86 
 
 		 561 aa  140  7e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  24.68 
 
 		 530 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.26 
 
 		 526 aa  131  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0592432  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  27.08 
 
 		 598 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3621  SSS sodium solute transporter superfamily  27.15 
 
 		 596 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.434287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2774  SSS sodium solute transporter superfamily  25.44 
 
 		 529 aa  127  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00224729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  24.62 
 
 		 472 aa  127  7e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0609  sodium/solute symporter  23.31 
 
 		 513 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.952879  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5697  SSS sodium solute transporter superfamily  25.55 
 
 		 536 aa  117  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.479819 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4044  putative symporter YidK  25.15 
 
 		 571 aa  114  7.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.978949 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4187  putative symporter YidK  24.19 
 
 		 571 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03563  predicted transporter  24.95 
 
 		 571 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0024  SSS sodium solute transporter superfamily  24.95 
 
 		 571 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03506  hypothetical protein  24.95 
 
 		 571 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5111  putative symporter YidK  24.95 
 
 		 571 aa  112  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.393136 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0087  putative symporter YidK  24.84 
 
 		 529 aa  111  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  26.48 
 
 		 474 aa  104  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04816  alkaline phosphatase synthesis sensor protein phoR  22.46 
 
 		 513 aa  104  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3355  Na+/solute symporter  25.54 
 
 		 517 aa  104  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0610  putative symporter YidK  25 
 
 		 551 aa  103  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.266517  normal  0.0320256 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2201  putative symporter YidK  22.66 
 
 		 530 aa  101  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03377  sodium:solute symporter family protein  23.09 
 
 		 523 aa  101  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02564  hypothetical protein  23.87 
 
 		 581 aa  101  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3541  Na+/solute symporter  21.85 
 
 		 597 aa  100  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165749  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0303  Na+/solute symporter  24.9 
 
 		 596 aa  98.2  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2466  SSS sodium solute transporter superfamily  22.91 
 
 		 509 aa  98.6  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4963400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  24.14 
 
 		 483 aa  97.8  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1380  SSS sodium solute transporter superfamily  22.76 
 
 		 562 aa  97.1  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.366294 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0171  SSS sodium solute transporter superfamily  23.42 
 
 		 520 aa  96.3  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0745729 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3022  SSS sodium solute transporter superfamily  24.53 
 
 		 883 aa  95.1  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.61129  normal  0.844759 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0578  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.26 
 
 		 473 aa  91.3  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.493945  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3587  Na+/solute symporter  22.82 
 
 		 556 aa  90.9  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0129  Na+/solute symporter  24.23 
 
 		 596 aa  90.5  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  24.63 
 
 		 483 aa  89.7  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1283  putative symporter YidK  23.33 
 
 		 531 aa  89.4  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0338  putative symporter YidK  23.76 
 
 		 562 aa  87.4  5e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000369581  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  22.16 
 
 		 500 aa  87.4  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4019  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.15 
 
 		 474 aa  87  8e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000206243 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  23.33 
 
 		 483 aa  86.3  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0970  SSS sodium solute transporter superfamily  24.71 
 
 		 765 aa  86.3  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000363528  normal  0.258421 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0638  Na+/solute symporter  24.45 
 
 		 538 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3270  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.31 
 
 		 474 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.291687  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  21.46 
 
 		 526 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495731  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2416  Na+/solute symporter  24.33 
 
 		 575 aa  84  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.664159  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  22.67 
 
 		 463 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5478  Na+/solute symporter  22.45 
 
 		 568 aa  82.8  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0650513 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4170  Na+/solute symporter  21.9 
 
 		 526 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0688566  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5643  putative symporter YidK  24.3 
 
 		 532 aa  82.4  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0528726  normal  0.86029 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  22.86 
 
 		 463 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1384  sodium:solute symporter family protein  22.99 
 
 		 588 aa  81.3  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2608  SSS sodium solute transporter superfamily  23.83 
 
 		 570 aa  81.3  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  22.91 
 
 		 492 aa  80.9  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1653  sodium/proline symporter  23.86 
 
 		 511 aa  80.5  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2962  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.47 
 
 		 574 aa  80.5  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.324391  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  23.3 
 
 		 492 aa  80.5  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09590  Na+/proline symporter  23.06 
 
 		 501 aa  80.5  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0974546  normal  0.236374 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  22.74 
 
 		 492 aa  80.1  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  22.74 
 
 		 492 aa  80.1  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>