More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1927 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1152  SSS sodium solute transporter superfamily  72.2 
 
 		 562 aa  818    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0742973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3072  SSS sodium solute transporter superfamily  64.27 
 
 		 539 aa  722    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00704051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  66.2 
 
 		 561 aa  755    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4728  SSS sodium solute transporter superfamily  62.23 
 
 		 549 aa  688    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  hitchhiker  0.00040203 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1927  SSS sodium solute transporter superfamily  100 
 
 		 568 aa  1132    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0029053  normal  0.303256 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5244  SSS sodium solute transporter superfamily  59.07 
 
 		 545 aa  649    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3116  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  60.22 
 
 		 522 aa  639    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3635  SSS sodium solute transporter superfamily  57.07 
 
 		 565 aa  631  1e-179  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.85975  normal  0.450055 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5697  SSS sodium solute transporter superfamily  59.29 
 
 		 536 aa  615  1e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.479819 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2732  SSS sodium solute transporter superfamily  56.97 
 
 		 561 aa  585  1e-166  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  53.7 
 
 		 561 aa  584  1.0000000000000001e-165  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  45.61 
 
 		 523 aa  487  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  46.92 
 
 		 520 aa  484  1e-135  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  47.62 
 
 		 522 aa  473  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  46.91 
 
 		 592 aa  474  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  44.76 
 
 		 522 aa  474  1e-132  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  46.38 
 
 		 519 aa  473  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  46.48 
 
 		 520 aa  470  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  46.06 
 
 		 522 aa  464  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  46.53 
 
 		 520 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  46.53 
 
 		 520 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  44.31 
 
 		 548 aa  452  1.0000000000000001e-126  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  43.66 
 
 		 520 aa  449  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  39.22 
 
 		 509 aa  321  3e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  33.21 
 
 		 523 aa  265  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  34.72 
 
 		 551 aa  243  9e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.97 
 
 		 565 aa  239  1e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  33.12 
 
 		 533 aa  215  9.999999999999999e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  32.14 
 
 		 557 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  32.12 
 
 		 557 aa  213  7e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0087  putative symporter YidK  33.47 
 
 		 529 aa  213  9e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0610  putative symporter YidK  33.69 
 
 		 551 aa  212  2e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.266517  normal  0.0320256 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.97 
 
 		 526 aa  207  3e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4187  putative symporter YidK  31.29 
 
 		 571 aa  202  9e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03563  predicted transporter  31.29 
 
 		 571 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0024  SSS sodium solute transporter superfamily  31.29 
 
 		 571 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03506  hypothetical protein  31.29 
 
 		 571 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4044  putative symporter YidK  31.08 
 
 		 571 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.978949 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  31.22 
 
 		 598 aa  201  3.9999999999999996e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5111  putative symporter YidK  31.08 
 
 		 571 aa  200  6e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.393136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1859  SSS sodium solute transporter superfamily  29.59 
 
 		 551 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.32 
 
 		 526 aa  197  5.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0592432  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2774  SSS sodium solute transporter superfamily  31.26 
 
 		 529 aa  192  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00224729  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2201  putative symporter YidK  27.54 
 
 		 530 aa  186  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0338  putative symporter YidK  31.68 
 
 		 562 aa  185  2.0000000000000003e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000369581  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0970  SSS sodium solute transporter superfamily  34.1 
 
 		 765 aa  185  2.0000000000000003e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000363528  normal  0.258421 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1283  putative symporter YidK  30 
 
 		 531 aa  182  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4407  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.72 
 
 		 613 aa  179  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0343463  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1671  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.73 
 
 		 593 aa  178  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302135 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0578  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.86 
 
 		 473 aa  177  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.493945  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  28.63 
 
 		 537 aa  177  5e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4019  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.61 
 
 		 474 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000206243 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3270  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.21 
 
 		 474 aa  172  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.291687  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3621  SSS sodium solute transporter superfamily  27.6 
 
 		 596 aa  169  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.434287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04060  SSS sodium solute transporter  28.54 
 
 		 565 aa  166  8e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5643  putative symporter YidK  27.46 
 
 		 532 aa  163  7e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0528726  normal  0.86029 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0993  SSS sodium solute transporter superfamily  26.62 
 
 		 569 aa  161  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0554078  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6118  SSS sodium solute transporter superfamily  28.9 
 
 		 562 aa  160  8e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3709  SSS sodium solute transporter superfamily  25.84 
 
 		 564 aa  158  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174317  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14290  SSS sodium solute transporter  28.7 
 
 		 566 aa  155  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.44 
 
 		 567 aa  150  6e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0990  SSS sodium solute transporter superfamily  28.09 
 
 		 560 aa  145  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.22 
 
 		 486 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2048  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.22 
 
 		 550 aa  130  8.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4098  Na+/solute symporter  29.17 
 
 		 486 aa  115  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0584341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0525  SSS sodium solute transporter superfamily  25.59 
 
 		 522 aa  114  7.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.692758  unclonable  0.0000000000137784 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0176  sodium:solute transporter  25.58 
 
 		 505 aa  107  6e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02564  hypothetical protein  22.45 
 
 		 581 aa  105  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3985  SSS sodium solute transporter superfamily  25.66 
 
 		 527 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000567258  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0179  sodium/solute symporter family protein  25.47 
 
 		 505 aa  104  6e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2070  Na+/solute symporter  25.36 
 
 		 489 aa  103  9e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0171  SSS sodium solute transporter superfamily  24.4 
 
 		 520 aa  100  7e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0745729 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2466  SSS sodium solute transporter superfamily  23.45 
 
 		 509 aa  99.4  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4963400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.34 
 
 		 542 aa  99  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1893  Na+/myo-inositol cotransporter  32.88 
 
 		 234 aa  99  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0549999  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3355  Na+/solute symporter  27.31 
 
 		 517 aa  98.6  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4170  Na+/solute symporter  22.89 
 
 		 526 aa  97.4  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0688566  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0297  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.54 
 
 		 510 aa  96.3  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.977217  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0304  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.54 
 
 		 510 aa  96.3  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1640  SSS sodium solute transporter superfamily  28.01 
 
 		 566 aa  94.7  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2962  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25 
 
 		 574 aa  92.4  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.324391  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04816  alkaline phosphatase synthesis sensor protein phoR  24.02 
 
 		 513 aa  92.4  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2815  SSS sodium solute transporter superfamily  24.35 
 
 		 527 aa  92.4  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13128  sodium/glucose cotransporter  23.08 
 
 		 575 aa  91.3  5e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.194229  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  25.92 
 
 		 530 aa  90.1  8e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1193  sodium-glucose/galactose cotransporter  24.19 
 
 		 498 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0641857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1223  sodium-glucose/galactose cotransporter  24.19 
 
 		 498 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.532882 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1203  sodium-glucose/galactose cotransporter  24.19 
 
 		 498 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.410205 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1238  sodium-glucose/galactose cotransporter  24.19 
 
 		 498 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.425742 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0350  Na+/solute symporter  23.55 
 
 		 489 aa  88.6  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12043  sodium iodide symporter  25 
 
 		 547 aa  87.4  7e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  25.86 
 
 		 483 aa  86.7  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  24.4 
 
 		 472 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3022  SSS sodium solute transporter superfamily  23.97 
 
 		 883 aa  86.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.61129  normal  0.844759 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1380  SSS sodium solute transporter superfamily  24.84 
 
 		 562 aa  85.1  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.366294 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  22.62 
 
 		 474 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1081  sodium/proline symporter  26.35 
 
 		 498 aa  85.1  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000772394  unclonable  0.00000000000701401 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0416  sodium/solute symporter family protein  24.59 
 
 		 570 aa  84.7  0.000000000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.951118  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6588  SSS sodium solute transporter superfamily  24.57 
 
 		 529 aa  82  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2672  Na+/solute symporter  22.29 
 
 		 599 aa  81.6  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>