249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3683 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  100 
 
 		 486 aa  979    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4098  Na+/solute symporter  58.65 
 
 		 486 aa  559  1e-158  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0584341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4019  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  57.57 
 
 		 474 aa  556  1e-157  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000206243 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0578  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  55.74 
 
 		 473 aa  552  1e-156  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.493945  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3270  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  56.25 
 
 		 474 aa  545  1e-154  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.291687  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1283  putative symporter YidK  35.58 
 
 		 531 aa  247  4e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4044  putative symporter YidK  32.78 
 
 		 571 aa  239  8e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.978949 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5111  putative symporter YidK  32.78 
 
 		 571 aa  238  1e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.393136 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0338  putative symporter YidK  36.19 
 
 		 562 aa  238  2e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000369581  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4187  putative symporter YidK  32.37 
 
 		 571 aa  238  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03563  predicted transporter  32.37 
 
 		 571 aa  237  3e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0024  SSS sodium solute transporter superfamily  32.37 
 
 		 571 aa  237  3e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03506  hypothetical protein  32.37 
 
 		 571 aa  237  3e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0087  putative symporter YidK  33.55 
 
 		 529 aa  222  9e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0610  putative symporter YidK  32.67 
 
 		 551 aa  212  1e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.266517  normal  0.0320256 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2201  putative symporter YidK  31.57 
 
 		 530 aa  205  2e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5643  putative symporter YidK  29.85 
 
 		 532 aa  203  5e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0528726  normal  0.86029 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.83 
 
 		 523 aa  193  6e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  30.97 
 
 		 509 aa  192  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  30.56 
 
 		 520 aa  187  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.52 
 
 		 522 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.6 
 
 		 522 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.19 
 
 		 520 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  29.19 
 
 		 520 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  30.14 
 
 		 520 aa  167  4e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  28.48 
 
 		 592 aa  164  5.0000000000000005e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.06 
 
 		 519 aa  163  7e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.39 
 
 		 522 aa  163  8.000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.08 
 
 		 520 aa  162  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.23 
 
 		 548 aa  161  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.35 
 
 		 526 aa  160  5e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3072  SSS sodium solute transporter superfamily  27.03 
 
 		 539 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00704051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3116  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.17 
 
 		 522 aa  152  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5244  SSS sodium solute transporter superfamily  25.66 
 
 		 545 aa  150  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.7 
 
 		 565 aa  150  5e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1927  SSS sodium solute transporter superfamily  27.22 
 
 		 568 aa  147  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0029053  normal  0.303256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1152  SSS sodium solute transporter superfamily  27.15 
 
 		 562 aa  148  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0742973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  27.13 
 
 		 557 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.48 
 
 		 533 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  28.42 
 
 		 523 aa  146  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  28.91 
 
 		 551 aa  145  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  26.7 
 
 		 557 aa  144  5e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.71 
 
 		 561 aa  142  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4728  SSS sodium solute transporter superfamily  26.24 
 
 		 549 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  hitchhiker  0.00040203 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  25.42 
 
 		 561 aa  136  9e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3635  SSS sodium solute transporter superfamily  25.75 
 
 		 565 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.85975  normal  0.450055 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  27.04 
 
 		 598 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1859  SSS sodium solute transporter superfamily  26.71 
 
 		 551 aa  131  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0970  SSS sodium solute transporter superfamily  30.09 
 
 		 765 aa  117  6e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000363528  normal  0.258421 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2732  SSS sodium solute transporter superfamily  25.11 
 
 		 561 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.7 
 
 		 526 aa  114  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0592432  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3621  SSS sodium solute transporter superfamily  27.35 
 
 		 596 aa  114  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.434287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5697  SSS sodium solute transporter superfamily  24.69 
 
 		 536 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.479819 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2774  SSS sodium solute transporter superfamily  21.98 
 
 		 529 aa  94  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00224729  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2466  SSS sodium solute transporter superfamily  26.14 
 
 		 509 aa  92.8  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4963400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2070  Na+/solute symporter  26.61 
 
 		 489 aa  89.4  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.23 
 
 		 542 aa  88.2  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0176  sodium:solute transporter  22.86 
 
 		 505 aa  86.7  9e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0179  sodium/solute symporter family protein  22.86 
 
 		 505 aa  85.1  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.3 
 
 		 567 aa  83.2  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1893  Na+/myo-inositol cotransporter  28.57 
 
 		 234 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0549999  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4170  Na+/solute symporter  25.05 
 
 		 526 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0688566  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  23.58 
 
 		 474 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03377  sodium:solute symporter family protein  25.75 
 
 		 523 aa  79.7  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3567  sodium/panthothenate symporter  26.82 
 
 		 477 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3311  sodium/panthothenate symporter  26.82 
 
 		 479 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3560  sodium/panthothenate symporter  26.82 
 
 		 479 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000874922 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  21.51 
 
 		 537 aa  77.8  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0297  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.74 
 
 		 510 aa  77.8  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.977217  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0304  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.74 
 
 		 510 aa  77.8  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3261  sodium/panthothenate symporter  27.07 
 
 		 479 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0182263  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3570  sodium/panthothenate symporter  27.07 
 
 		 477 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2962  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.76 
 
 		 574 aa  77.4  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.324391  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3660  sodium/panthothenate symporter  26.8 
 
 		 477 aa  77  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6118  SSS sodium solute transporter superfamily  24.77 
 
 		 562 aa  76.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3346  sodium/panthothenate symporter  26.61 
 
 		 479 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000197319  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3607  sodium/panthothenate symporter  26.61 
 
 		 479 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.258245  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1657  sodium/panthothenate symporter  26.58 
 
 		 477 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343419 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2227  sodium/panthothenate symporter  26.59 
 
 		 477 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0585956  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2866  sodium-solute symporter  27.74 
 
 		 581 aa  72.4  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297174 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14290  SSS sodium solute transporter  23.46 
 
 		 566 aa  72  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2763  Na+/solute symporter  24.11 
 
 		 472 aa  71.6  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3587  Na+/solute symporter  25.81 
 
 		 556 aa  71.6  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  25.59 
 
 		 483 aa  70.5  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4407  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.05 
 
 		 613 aa  69.7  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0343463  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0993  SSS sodium solute transporter superfamily  22.25 
 
 		 569 aa  69.3  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0554078  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02564  hypothetical protein  24.44 
 
 		 581 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0990  SSS sodium solute transporter superfamily  24.49 
 
 		 560 aa  68.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3255  sodium/panthothenate symporter  26.53 
 
 		 477 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.344037  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  23.95 
 
 		 530 aa  68.6  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0609  sodium/solute symporter  24.88 
 
 		 513 aa  67.8  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.952879  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1380  SSS sodium solute transporter superfamily  25.17 
 
 		 562 aa  67  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.366294 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  24.32 
 
 		 487 aa  67  0.0000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.15 
 
 		 526 aa  66.6  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495731  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1640  SSS sodium solute transporter superfamily  24.03 
 
 		 566 aa  66.6  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3029  Na+/solute symporter  23.13 
 
 		 492 aa  66.2  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934608 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1083  Na+/solute symporter  25.32 
 
 		 588 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0991073  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2358  Na+/solute symporter  22.31 
 
 		 472 aa  65.1  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.552943  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000913  sodium-solute symporter putative  22.68 
 
 		 590 aa  65.1  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0232  Na+/solute symporter  22.29 
 
 		 467 aa  64.3  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>