More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_0304 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_0304  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  100 
 
 
510 aa  1015    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0297  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  100 
 
 
510 aa  1015    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.977217  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0416  sodium/solute symporter family protein  43.05 
 
 
570 aa  366  1e-100  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.951118  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1193  sodium-glucose/galactose cotransporter  44.22 
 
 
498 aa  362  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0641857  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1203  sodium-glucose/galactose cotransporter  44.22 
 
 
498 aa  362  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.410205 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1223  sodium-glucose/galactose cotransporter  44.22 
 
 
498 aa  362  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.532882 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1238  sodium-glucose/galactose cotransporter  44.22 
 
 
498 aa  362  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.425742 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2466  SSS sodium solute transporter superfamily  39.19 
 
 
509 aa  328  1.0000000000000001e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4963400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1518  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  35.32 
 
 
892 aa  293  4e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0179  sodium/solute symporter family protein  32.5 
 
 
505 aa  260  4e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0176  sodium:solute transporter  32.27 
 
 
505 aa  259  8e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3022  SSS sodium solute transporter superfamily  31.71 
 
 
883 aa  259  1e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.61129  normal  0.844759 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3985  SSS sodium solute transporter superfamily  30.33 
 
 
527 aa  204  4e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000567258  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2815  SSS sodium solute transporter superfamily  28.42 
 
 
527 aa  202  9e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6588  SSS sodium solute transporter superfamily  29 
 
 
529 aa  202  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0525  SSS sodium solute transporter superfamily  28.67 
 
 
522 aa  196  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.692758  unclonable  0.0000000000137784 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.73 
 
 
542 aa  189  7e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3352  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.71 
 
 
479 aa  157  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4170  Na+/solute symporter  25.96 
 
 
526 aa  147  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0688566  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04816  alkaline phosphatase synthesis sensor protein phoR  29.4 
 
 
513 aa  138  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0609  sodium/solute symporter  27.93 
 
 
513 aa  137  5e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.952879  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0171  SSS sodium solute transporter superfamily  27.92 
 
 
520 aa  134  3e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0745729 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  27.08 
 
 
530 aa  134  5e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02564  hypothetical protein  27.34 
 
 
581 aa  125  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  25.25 
 
 
523 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09590  Na+/proline symporter  27.39 
 
 
501 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0974546  normal  0.236374 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.81 
 
 
526 aa  120  7e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495731  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2763  Na+/solute symporter  27.86 
 
 
472 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2358  Na+/solute symporter  27.2 
 
 
472 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.552943  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2070  Na+/solute symporter  26.67 
 
 
489 aa  116  7.999999999999999e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  23.44 
 
 
551 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0195  sodium:solute symporter family protein  27.53 
 
 
468 aa  114  3e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4728  SSS sodium solute transporter superfamily  26.02 
 
 
549 aa  114  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  hitchhiker  0.00040203 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.37 
 
 
523 aa  113  9e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1825  SSS sodium solute transporter superfamily  27.73 
 
 
533 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.915648  normal  0.529366 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  25.65 
 
 
509 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.95 
 
 
561 aa  112  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.3 
 
 
533 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1380  SSS sodium solute transporter superfamily  26.49 
 
 
562 aa  109  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.366294 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0206  Na+/solute symporter  28.27 
 
 
470 aa  109  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5643  putative symporter YidK  24.78 
 
 
532 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0528726  normal  0.86029 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2009  sodium:solute symporter family protein  29.69 
 
 
473 aa  108  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  21.33 
 
 
592 aa  107  7e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5478  Na+/solute symporter  26.23 
 
 
568 aa  106  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0650513 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4044  putative symporter YidK  24.16 
 
 
571 aa  106  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.978949 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03563  predicted transporter  23.95 
 
 
571 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0024  SSS sodium solute transporter superfamily  23.95 
 
 
571 aa  105  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4187  putative symporter YidK  23.95 
 
 
571 aa  105  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03506  hypothetical protein  23.95 
 
 
571 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3072  SSS sodium solute transporter superfamily  23.94 
 
 
539 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00704051  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0087  putative symporter YidK  24.85 
 
 
529 aa  105  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03377  sodium:solute symporter family protein  28.71 
 
 
523 aa  104  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0261  Na+/solute symporter  26.38 
 
 
468 aa  104  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.728087  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5111  putative symporter YidK  23.95 
 
 
571 aa  104  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.393136 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0338  putative symporter YidK  24.48 
 
 
562 aa  104  5e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000369581  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1101  sodium:solute symporter family protein  23.31 
 
 
486 aa  103  7e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.465096 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.97 
 
 
522 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.46 
 
 
522 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  24.36 
 
 
598 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  21.43 
 
 
565 aa  101  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12043  sodium iodide symporter  28.33 
 
 
547 aa  101  4e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  24.67 
 
 
520 aa  100  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0232  Na+/solute symporter  26.92 
 
 
467 aa  100  5e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1640  SSS sodium solute transporter superfamily  26.54 
 
 
566 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171262  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.94 
 
 
520 aa  99.8  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.85 
 
 
519 aa  99.8  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  24.69 
 
 
520 aa  99.8  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2962  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.52 
 
 
574 aa  99.8  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.324391  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1598  Na+/solute symporter  24.37 
 
 
487 aa  99  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.414751 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1927  SSS sodium solute transporter superfamily  25.36 
 
 
568 aa  99  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0029053  normal  0.303256 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3116  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.46 
 
 
522 aa  99.4  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2201  putative symporter YidK  23.87 
 
 
530 aa  98.6  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  26.14 
 
 
479 aa  98.2  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.24 
 
 
548 aa  97.8  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0610  putative symporter YidK  24.21 
 
 
551 aa  97.8  4e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.266517  normal  0.0320256 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  25.71 
 
 
476 aa  97.4  6e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1283  putative symporter YidK  23 
 
 
531 aa  97.1  8e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1869  Na+/solute symporter  25.69 
 
 
502 aa  96.3  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.319535 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  22.41 
 
 
557 aa  96.3  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3709  SSS sodium solute transporter superfamily  23.32 
 
 
564 aa  95.1  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174317  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  23.21 
 
 
557 aa  95.9  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.4 
 
 
526 aa  95.5  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2732  SSS sodium solute transporter superfamily  26.57 
 
 
561 aa  95.1  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1526  Na+/solute symporter  24.77 
 
 
586 aa  94  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  25.22 
 
 
482 aa  93.6  9e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2903  Na+/solute symporter  24.39 
 
 
488 aa  93.2  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1152  SSS sodium solute transporter superfamily  23.52 
 
 
562 aa  93.2  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0742973  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  25.22 
 
 
483 aa  92  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5244  SSS sodium solute transporter superfamily  24.35 
 
 
545 aa  92.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.05 
 
 
520 aa  92  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5947  Na+/solute symporter  26.05 
 
 
509 aa  91.7  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0043  Na+/solute symporter  27.53 
 
 
565 aa  91.3  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  24.06 
 
 
492 aa  90.5  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.23 
 
 
522 aa  90.1  8e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4019  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.98 
 
 
474 aa  90.1  9e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000206243 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1178  sodium:solute symporter family protein  25.19 
 
 
585 aa  90.1  9e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.107894 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  24.61 
 
 
482 aa  89.7  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  23.61 
 
 
492 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  23.86 
 
 
492 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  24.09 
 
 
537 aa  89  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>