More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4019 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4019  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  100 
 
 		 474 aa  948    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000206243 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0578  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  87.29 
 
 		 473 aa  846    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.493945  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3270  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  85.96 
 
 		 474 aa  817    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.291687  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  57.57 
 
 		 486 aa  529  1e-149  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4098  Na+/solute symporter  53.28 
 
 		 486 aa  498  1e-140  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0584341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1283  putative symporter YidK  40.37 
 
 		 531 aa  306  5.0000000000000004e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0338  putative symporter YidK  37.39 
 
 		 562 aa  282  1e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000369581  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4044  putative symporter YidK  35.77 
 
 		 571 aa  282  1e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.978949 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03563  predicted transporter  35.77 
 
 		 571 aa  281  2e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0024  SSS sodium solute transporter superfamily  35.77 
 
 		 571 aa  281  2e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03506  hypothetical protein  35.77 
 
 		 571 aa  281  2e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4187  putative symporter YidK  35.77 
 
 		 571 aa  281  2e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5111  putative symporter YidK  35.56 
 
 		 571 aa  280  4e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.393136 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0087  putative symporter YidK  35.91 
 
 		 529 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0610  putative symporter YidK  34.5 
 
 		 551 aa  251  1e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.266517  normal  0.0320256 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2201  putative symporter YidK  34.69 
 
 		 530 aa  249  5e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5643  putative symporter YidK  31.43 
 
 		 532 aa  240  4e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0528726  normal  0.86029 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  34.66 
 
 		 509 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  30.9 
 
 		 520 aa  197  3e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.74 
 
 		 523 aa  194  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  29.18 
 
 		 520 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.04 
 
 		 522 aa  192  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.18 
 
 		 520 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.85 
 
 		 548 aa  190  5e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.31 
 
 		 519 aa  189  7e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  30.88 
 
 		 520 aa  183  5.0000000000000004e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3072  SSS sodium solute transporter superfamily  30.11 
 
 		 539 aa  181  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00704051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.2 
 
 		 522 aa  179  9e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.4 
 
 		 520 aa  179  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  30.42 
 
 		 592 aa  178  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.48 
 
 		 522 aa  178  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1152  SSS sodium solute transporter superfamily  32.06 
 
 		 562 aa  178  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0742973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1927  SSS sodium solute transporter superfamily  31.69 
 
 		 568 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0029053  normal  0.303256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  30.27 
 
 		 561 aa  171  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3116  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.62 
 
 		 522 aa  167  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.44 
 
 		 561 aa  167  5e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.77 
 
 		 565 aa  165  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5244  SSS sodium solute transporter superfamily  29.53 
 
 		 545 aa  161  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  27.35 
 
 		 523 aa  155  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  27.85 
 
 		 598 aa  154  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3635  SSS sodium solute transporter superfamily  27.7 
 
 		 565 aa  153  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.85975  normal  0.450055 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.12 
 
 		 533 aa  151  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.47 
 
 		 526 aa  149  7e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  28.02 
 
 		 557 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4728  SSS sodium solute transporter superfamily  27.82 
 
 		 549 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  hitchhiker  0.00040203 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  27.79 
 
 		 557 aa  147  6e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  27.75 
 
 		 551 aa  145  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2732  SSS sodium solute transporter superfamily  29.01 
 
 		 561 aa  142  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0970  SSS sodium solute transporter superfamily  32.59 
 
 		 765 aa  135  1.9999999999999998e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000363528  normal  0.258421 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5697  SSS sodium solute transporter superfamily  30.17 
 
 		 536 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.479819 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1859  SSS sodium solute transporter superfamily  25.83 
 
 		 551 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3621  SSS sodium solute transporter superfamily  28.61 
 
 		 596 aa  129  8.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.434287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1893  Na+/myo-inositol cotransporter  35.5 
 
 		 234 aa  111  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0549999  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  23.86 
 
 		 537 aa  105  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.53 
 
 		 526 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0592432  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3709  SSS sodium solute transporter superfamily  26.59 
 
 		 564 aa  100  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174317  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4407  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.71 
 
 		 613 aa  99  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0343463  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03377  sodium:solute symporter family protein  23.66 
 
 		 523 aa  96.3  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0990  SSS sodium solute transporter superfamily  25.27 
 
 		 560 aa  95.5  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6118  SSS sodium solute transporter superfamily  26.3 
 
 		 562 aa  95.1  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.06 
 
 		 542 aa  92.4  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  23.33 
 
 		 474 aa  89.7  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  23.59 
 
 		 530 aa  89.7  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0993  SSS sodium solute transporter superfamily  24.15 
 
 		 569 aa  89.4  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0554078  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14290  SSS sodium solute transporter  24.38 
 
 		 566 aa  88.6  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.39 
 
 		 567 aa  87.8  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1671  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  21.97 
 
 		 593 aa  87  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302135 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2048  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.29 
 
 		 550 aa  86.3  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0179  sodium/solute symporter family protein  23.83 
 
 		 505 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0176  sodium:solute transporter  23.58 
 
 		 505 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2774  SSS sodium solute transporter superfamily  22.71 
 
 		 529 aa  85.9  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00224729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04060  SSS sodium solute transporter  24.61 
 
 		 565 aa  85.5  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0304  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.53 
 
 		 510 aa  84.3  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0297  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.53 
 
 		 510 aa  84.3  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.977217  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.76 
 
 		 526 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495731  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  26.74 
 
 		 464 aa  83.2  0.000000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0609  sodium/solute symporter  25.84 
 
 		 513 aa  82.8  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.952879  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2466  SSS sodium solute transporter superfamily  23.96 
 
 		 509 aa  81.6  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4963400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04816  alkaline phosphatase synthesis sensor protein phoR  24.37 
 
 		 513 aa  81.3  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4170  Na+/solute symporter  23.76 
 
 		 526 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0688566  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  24.23 
 
 		 492 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  24.23 
 
 		 492 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  24.23 
 
 		 492 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2227  sodium/panthothenate symporter  28.29 
 
 		 477 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0585956  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  24.23 
 
 		 492 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2763  Na+/solute symporter  24.74 
 
 		 472 aa  76.6  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  24.23 
 
 		 492 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  24.23 
 
 		 492 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  24.45 
 
 		 492 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2358  Na+/solute symporter  24.86 
 
 		 472 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.552943  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0206  Na+/solute symporter  24.87 
 
 		 470 aa  74.3  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  23.65 
 
 		 487 aa  73.9  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2866  sodium-solute symporter  27.5 
 
 		 581 aa  73.6  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297174 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3029  Na+/solute symporter  24.48 
 
 		 492 aa  73.6  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934608 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2070  Na+/solute symporter  26.42 
 
 		 489 aa  73.2  0.000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  24.89 
 
 		 492 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0261  Na+/solute symporter  24.18 
 
 		 468 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.728087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  23.82 
 
 		 483 aa  72  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3570  sodium/panthothenate symporter  27.32 
 
 		 477 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2962  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.26 
 
 		 574 aa  70.5  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.324391  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>