More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1090 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  66.22 
 
 		 523 aa  714    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  64.18 
 
 		 522 aa  651    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  67.5 
 
 		 520 aa  677    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  67.31 
 
 		 520 aa  678    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  100 
 
 		 520 aa  1041    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  72.69 
 
 		 520 aa  770    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  64.42 
 
 		 522 aa  659    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  65.51 
 
 		 522 aa  695    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  65.77 
 
 		 520 aa  703    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  65.83 
 
 		 519 aa  691    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  61.2 
 
 		 592 aa  645    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  53.65 
 
 		 548 aa  587  1e-166  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1152  SSS sodium solute transporter superfamily  45.73 
 
 		 562 aa  479  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0742973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  45.89 
 
 		 561 aa  478  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1927  SSS sodium solute transporter superfamily  46.48 
 
 		 568 aa  466  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0029053  normal  0.303256 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3116  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  46.29 
 
 		 522 aa  457  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5244  SSS sodium solute transporter superfamily  45.24 
 
 		 545 aa  455  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4728  SSS sodium solute transporter superfamily  45.4 
 
 		 549 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  hitchhiker  0.00040203 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3072  SSS sodium solute transporter superfamily  46.13 
 
 		 539 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00704051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5697  SSS sodium solute transporter superfamily  46.07 
 
 		 536 aa  428  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.479819 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3635  SSS sodium solute transporter superfamily  40.81 
 
 		 565 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.85975  normal  0.450055 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  41.71 
 
 		 561 aa  391  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2732  SSS sodium solute transporter superfamily  43.32 
 
 		 561 aa  383  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  42.37 
 
 		 509 aa  368  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  36.13 
 
 		 523 aa  306  7e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  34.05 
 
 		 533 aa  271  2e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  35.21 
 
 		 551 aa  239  9e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03563  predicted transporter  31.06 
 
 		 571 aa  236  6e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0024  SSS sodium solute transporter superfamily  31.06 
 
 		 571 aa  236  6e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03506  hypothetical protein  31.06 
 
 		 571 aa  236  6e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4187  putative symporter YidK  31.06 
 
 		 571 aa  236  6e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4044  putative symporter YidK  31.25 
 
 		 571 aa  236  8e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.978949 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.3 
 
 		 526 aa  236  9e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5111  putative symporter YidK  31.06 
 
 		 571 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.393136 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.16 
 
 		 565 aa  229  8e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  32.69 
 
 		 598 aa  225  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1859  SSS sodium solute transporter superfamily  32.1 
 
 		 551 aa  224  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0338  putative symporter YidK  33.07 
 
 		 562 aa  223  6e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000369581  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1283  putative symporter YidK  33.12 
 
 		 531 aa  222  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0610  putative symporter YidK  33.98 
 
 		 551 aa  220  5e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.266517  normal  0.0320256 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0970  SSS sodium solute transporter superfamily  38.89 
 
 		 765 aa  216  9.999999999999999e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000363528  normal  0.258421 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  31.11 
 
 		 557 aa  209  7e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.22 
 
 		 526 aa  206  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0592432  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0087  putative symporter YidK  33.92 
 
 		 529 aa  205  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  32.69 
 
 		 557 aa  204  5e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5643  putative symporter YidK  29.76 
 
 		 532 aa  196  6e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0528726  normal  0.86029 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3270  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  32.46 
 
 		 474 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.291687  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0578  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.15 
 
 		 473 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.493945  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3621  SSS sodium solute transporter superfamily  29.76 
 
 		 596 aa  189  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.434287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4019  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.04 
 
 		 474 aa  187  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000206243 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2774  SSS sodium solute transporter superfamily  30.21 
 
 		 529 aa  187  5e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00224729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  28.35 
 
 		 537 aa  181  4e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2201  putative symporter YidK  30.7 
 
 		 530 aa  180  5.999999999999999e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1671  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.81 
 
 		 593 aa  171  4e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302135 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4407  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.66 
 
 		 613 aa  163  9e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0343463  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04060  SSS sodium solute transporter  27.48 
 
 		 565 aa  160  4e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3709  SSS sodium solute transporter superfamily  26.06 
 
 		 564 aa  158  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174317  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.02 
 
 		 486 aa  155  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25 
 
 		 567 aa  152  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14290  SSS sodium solute transporter  26.91 
 
 		 566 aa  149  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0993  SSS sodium solute transporter superfamily  25.51 
 
 		 569 aa  148  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0554078  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6118  SSS sodium solute transporter superfamily  25.49 
 
 		 562 aa  143  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2048  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.39 
 
 		 550 aa  141  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0176  sodium:solute transporter  27.05 
 
 		 505 aa  141  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0179  sodium/solute symporter family protein  26.67 
 
 		 505 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.68 
 
 		 542 aa  140  7.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4098  Na+/solute symporter  30.89 
 
 		 486 aa  139  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0584341  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0990  SSS sodium solute transporter superfamily  24.26 
 
 		 560 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394544  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13128  sodium/glucose cotransporter  25.28 
 
 		 575 aa  130  8.000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.194229  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02564  hypothetical protein  25.92 
 
 		 581 aa  129  9.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4170  Na+/solute symporter  22.61 
 
 		 526 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0688566  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  26.08 
 
 		 530 aa  120  9e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3022  SSS sodium solute transporter superfamily  25.98 
 
 		 883 aa  120  9e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.61129  normal  0.844759 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0609  sodium/solute symporter  26.95 
 
 		 513 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.952879  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2815  SSS sodium solute transporter superfamily  25.76 
 
 		 527 aa  117  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2866  sodium-solute symporter  28.66 
 
 		 581 aa  117  6e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297174 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04816  alkaline phosphatase synthesis sensor protein phoR  24.94 
 
 		 513 aa  116  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3355  Na+/solute symporter  28.4 
 
 		 517 aa  114  5e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12043  sodium iodide symporter  27.81 
 
 		 547 aa  112  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1640  SSS sodium solute transporter superfamily  27.67 
 
 		 566 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0525  SSS sodium solute transporter superfamily  24.45 
 
 		 522 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.692758  unclonable  0.0000000000137784 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0416  sodium/solute symporter family protein  24.07 
 
 		 570 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.951118  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2672  Na+/solute symporter  23.46 
 
 		 599 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0961  Na+/solute symporter  25.35 
 
 		 587 aa  107  5e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  27.23 
 
 		 483 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1526  Na+/solute symporter  24.9 
 
 		 586 aa  104  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1324  Na+/solute symporter  24.38 
 
 		 603 aa  104  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1083  Na+/solute symporter  25.56 
 
 		 588 aa  104  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0991073  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3985  SSS sodium solute transporter superfamily  24.32 
 
 		 527 aa  103  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000567258  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0171  SSS sodium solute transporter superfamily  24.46 
 
 		 520 aa  102  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0745729 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0350  Na+/solute symporter  24.44 
 
 		 489 aa  103  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  26.56 
 
 		 474 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6961  Na+/solute symporter  27.85 
 
 		 533 aa  103  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.931741  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  24.84 
 
 		 482 aa  102  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6588  SSS sodium solute transporter superfamily  24.83 
 
 		 529 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1178  sodium:solute symporter family protein  24.42 
 
 		 585 aa  102  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.107894 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1380  SSS sodium solute transporter superfamily  25.74 
 
 		 562 aa  101  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.366294 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2893  Na+/solute symporter  24.3 
 
 		 604 aa  101  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2962  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.98 
 
 		 574 aa  101  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.324391  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2466  SSS sodium solute transporter superfamily  24.17 
 
 		 509 aa  101  4e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4963400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>