More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6961 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6961  Na+/solute symporter  100 
 
 		 533 aa  1046    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.931741  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3355  Na+/solute symporter  51.63 
 
 		 517 aa  526  1e-148  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0350  Na+/solute symporter  45.97 
 
 		 489 aa  458  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3541  Na+/solute symporter  31.71 
 
 		 597 aa  158  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165749  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2893  Na+/solute symporter  29.59 
 
 		 604 aa  157  6e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3587  Na+/solute symporter  30.81 
 
 		 556 aa  144  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2416  Na+/solute symporter  30.9 
 
 		 575 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.664159  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0289  Na+/solute symporter  24.42 
 
 		 590 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0322805  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2608  SSS sodium solute transporter superfamily  29.3 
 
 		 570 aa  126  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  26.79 
 
 		 509 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000913  sodium-solute symporter putative  23.89 
 
 		 590 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  28.64 
 
 		 520 aa  108  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  27.85 
 
 		 520 aa  102  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.72 
 
 		 526 aa  101  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  26.21 
 
 		 523 aa  97.8  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.24 
 
 		 519 aa  97.1  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  25.26 
 
 		 472 aa  95.1  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3709  SSS sodium solute transporter superfamily  24.66 
 
 		 564 aa  92  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174317  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.89 
 
 		 523 aa  91.7  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.14 
 
 		 522 aa  90.9  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2466  SSS sodium solute transporter superfamily  24.89 
 
 		 509 aa  90.1  9e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4963400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.82 
 
 		 520 aa  89.7  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  27.42 
 
 		 592 aa  89  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0261  Na+/solute symporter  24.01 
 
 		 468 aa  89.4  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.728087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.93 
 
 		 522 aa  86.7  9e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1526  Na+/solute symporter  25.89 
 
 		 586 aa  86.3  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2672  Na+/solute symporter  26.1 
 
 		 599 aa  86.7  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1384  sodium:solute symporter family protein  26.7 
 
 		 588 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1203  sodium-glucose/galactose cotransporter  24.48 
 
 		 498 aa  84.7  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.410205 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1238  sodium-glucose/galactose cotransporter  24.48 
 
 		 498 aa  84.7  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.425742 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1223  sodium-glucose/galactose cotransporter  24.48 
 
 		 498 aa  84.7  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.532882 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  26.83 
 
 		 479 aa  84  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  27.2 
 
 		 520 aa  83.6  0.000000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.2 
 
 		 520 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1193  sodium-glucose/galactose cotransporter  24.13 
 
 		 498 aa  83.2  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0641857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  27.42 
 
 		 492 aa  82.4  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.92 
 
 		 522 aa  82.4  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2763  Na+/solute symporter  23.51 
 
 		 472 aa  82.8  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  25.12 
 
 		 463 aa  80.5  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  25.38 
 
 		 463 aa  80.5  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  26.61 
 
 		 492 aa  80.1  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.15 
 
 		 526 aa  80.1  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0592432  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0195  sodium:solute symporter family protein  23.53 
 
 		 468 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  25.63 
 
 		 461 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  26.61 
 
 		 492 aa  79.7  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1716  GTP-binding protein, HSR1-releated protein  25.61 
 
 		 498 aa  79  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.066858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  25.2 
 
 		 551 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3072  SSS sodium solute transporter superfamily  25.76 
 
 		 539 aa  78.6  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00704051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0961  Na+/solute symporter  25.59 
 
 		 587 aa  78.2  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4407  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.84 
 
 		 613 aa  78.6  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0343463  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6118  SSS sodium solute transporter superfamily  26.09 
 
 		 562 aa  78.2  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13128  sodium/glucose cotransporter  23.27 
 
 		 575 aa  77.8  0.0000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.194229  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  25.17 
 
 		 461 aa  77.4  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  25.19 
 
 		 530 aa  77  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  24.19 
 
 		 537 aa  77  0.0000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1178  sodium:solute symporter family protein  24.76 
 
 		 585 aa  76.6  0.0000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.107894 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0206  Na+/solute symporter  23.77 
 
 		 470 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02564  hypothetical protein  23.65 
 
 		 581 aa  75.5  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.93 
 
 		 565 aa  75.5  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0525  SSS sodium solute transporter superfamily  25.45 
 
 		 522 aa  75.5  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.692758  unclonable  0.0000000000137784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3022  SSS sodium solute transporter superfamily  25.62 
 
 		 883 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.61129  normal  0.844759 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  22.05 
 
 		 483 aa  75.9  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1825  SSS sodium solute transporter superfamily  25.81 
 
 		 533 aa  75.5  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.915648  normal  0.529366 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1927  SSS sodium solute transporter superfamily  25.38 
 
 		 568 aa  74.3  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0029053  normal  0.303256 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1671  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.38 
 
 		 593 aa  74.7  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302135 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0176  sodium:solute transporter  23.96 
 
 		 505 aa  74.3  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  24.67 
 
 		 474 aa  73.6  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1324  Na+/solute symporter  24.15 
 
 		 603 aa  73.6  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1083  Na+/solute symporter  24.82 
 
 		 588 aa  73.6  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0991073  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0179  sodium/solute symporter family protein  23.68 
 
 		 505 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2358  Na+/solute symporter  23.63 
 
 		 472 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.552943  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.2 
 
 		 533 aa  73.2  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03563  predicted transporter  23.43 
 
 		 571 aa  72.8  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0024  SSS sodium solute transporter superfamily  23.43 
 
 		 571 aa  72.8  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5111  putative symporter YidK  23.24 
 
 		 571 aa  72.8  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.393136 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4187  putative symporter YidK  23.43 
 
 		 571 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14290  SSS sodium solute transporter  22.72 
 
 		 566 aa  72.8  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1859  SSS sodium solute transporter superfamily  22.96 
 
 		 551 aa  72  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.53 
 
 		 542 aa  72.4  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  25.88 
 
 		 487 aa  72.4  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03506  hypothetical protein  23.43 
 
 		 571 aa  72.8  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0232  Na+/solute symporter  22.38 
 
 		 467 aa  72  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  26.94 
 
 		 459 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  26.94 
 
 		 459 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4044  putative symporter YidK  23.17 
 
 		 571 aa  71.2  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.978949 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  24.81 
 
 		 483 aa  71.2  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5244  SSS sodium solute transporter superfamily  26.95 
 
 		 545 aa  70.9  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  27.58 
 
 		 500 aa  70.5  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  27.23 
 
 		 459 aa  70.1  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  26.67 
 
 		 462 aa  70.1  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2137  SSS sodium solute transporter superfamily  24.36 
 
 		 528 aa  69.7  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00565072  normal  0.610314 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0993  SSS sodium solute transporter superfamily  24.22 
 
 		 569 aa  70.1  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0554078  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3635  SSS sodium solute transporter superfamily  24.95 
 
 		 565 aa  69.7  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.85975  normal  0.450055 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0864  hypothetical protein  25.98 
 
 		 524 aa  70.1  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.983965  normal  0.0488094 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  22.47 
 
 		 460 aa  69.3  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  23.7 
 
 		 483 aa  69.3  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1152  SSS sodium solute transporter superfamily  24 
 
 		 562 aa  69.3  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0742973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2732  SSS sodium solute transporter superfamily  26.49 
 
 		 561 aa  68.2  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01330  Na+/proline symporter  27.14 
 
 		 525 aa  67.8  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  25.65 
 
 		 557 aa  67  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>