More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02564 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02564  hypothetical protein  100 
 
 		 581 aa  1179    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04816  alkaline phosphatase synthesis sensor protein phoR  39.33 
 
 		 513 aa  344  2.9999999999999997e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0609  sodium/solute symporter  40.4 
 
 		 513 aa  335  1e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.952879  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  36.87 
 
 		 542 aa  301  2e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  30.76 
 
 		 530 aa  243  7.999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3352  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.88 
 
 		 479 aa  197  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0171  SSS sodium solute transporter superfamily  28.74 
 
 		 520 aa  194  5e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0745729 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09590  Na+/proline symporter  29.77 
 
 		 501 aa  191  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0974546  normal  0.236374 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03377  sodium:solute symporter family protein  27.54 
 
 		 523 aa  175  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2763  Na+/solute symporter  27.97 
 
 		 472 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4170  Na+/solute symporter  28.89 
 
 		 526 aa  171  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0688566  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1518  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.61 
 
 		 892 aa  170  8e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0232  Na+/solute symporter  27.95 
 
 		 467 aa  169  1e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2358  Na+/solute symporter  27.33 
 
 		 472 aa  166  8e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.552943  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.69 
 
 		 526 aa  166  9e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495731  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1825  SSS sodium solute transporter superfamily  28.08 
 
 		 533 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.915648  normal  0.529366 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2070  Na+/solute symporter  28.64 
 
 		 489 aa  158  2e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1227  Na+/solute symporter  27.51 
 
 		 517 aa  157  4e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.212817  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0195  sodium:solute symporter family protein  28.31 
 
 		 468 aa  157  6e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0261  Na+/solute symporter  27.91 
 
 		 468 aa  155  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.728087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0206  Na+/solute symporter  27.43 
 
 		 470 aa  155  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6588  SSS sodium solute transporter superfamily  26.41 
 
 		 529 aa  155  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3985  SSS sodium solute transporter superfamily  28.82 
 
 		 527 aa  154  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000567258  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0525  SSS sodium solute transporter superfamily  27.67 
 
 		 522 aa  152  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.692758  unclonable  0.0000000000137784 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1380  SSS sodium solute transporter superfamily  30.1 
 
 		 562 aa  152  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.366294 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3022  SSS sodium solute transporter superfamily  27.49 
 
 		 883 aa  150  7e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.61129  normal  0.844759 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2009  sodium:solute symporter family protein  28.41 
 
 		 473 aa  150  7e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2466  SSS sodium solute transporter superfamily  27.7 
 
 		 509 aa  147  4.0000000000000006e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4963400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.06 
 
 		 523 aa  146  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2815  SSS sodium solute transporter superfamily  25.55 
 
 		 527 aa  145  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2866  sodium-solute symporter  26.51 
 
 		 581 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297174 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  26.24 
 
 		 523 aa  141  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12043  sodium iodide symporter  28.06 
 
 		 547 aa  139  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.82 
 
 		 548 aa  139  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.78 
 
 		 533 aa  137  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  24.43 
 
 		 592 aa  136  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0179  sodium/solute symporter family protein  28.29 
 
 		 505 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0176  sodium:solute transporter  27.61 
 
 		 505 aa  134  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  25.65 
 
 		 520 aa  134  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1640  SSS sodium solute transporter superfamily  26.35 
 
 		 566 aa  134  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  24.84 
 
 		 551 aa  134  5e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5478  Na+/solute symporter  29.62 
 
 		 568 aa  134  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0650513 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  24.27 
 
 		 509 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.76 
 
 		 522 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  24.59 
 
 		 520 aa  130  7.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  27.9 
 
 		 598 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.61 
 
 		 565 aa  129  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.36 
 
 		 567 aa  128  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.82 
 
 		 519 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0043  Na+/solute symporter  26.53 
 
 		 565 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.89 
 
 		 526 aa  127  5e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2962  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.09 
 
 		 574 aa  127  6e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.324391  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.59 
 
 		 520 aa  126  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1193  sodium-glucose/galactose cotransporter  26.6 
 
 		 498 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0641857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1238  sodium-glucose/galactose cotransporter  26.6 
 
 		 498 aa  125  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.425742 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1223  sodium-glucose/galactose cotransporter  26.6 
 
 		 498 aa  125  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.532882 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1203  sodium-glucose/galactose cotransporter  26.6 
 
 		 498 aa  125  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.410205 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5947  Na+/solute symporter  27.84 
 
 		 509 aa  124  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.06 
 
 		 522 aa  124  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0304  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.6 
 
 		 510 aa  123  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0297  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.6 
 
 		 510 aa  123  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.977217  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  25.44 
 
 		 537 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.31 
 
 		 520 aa  120  6e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  25.31 
 
 		 520 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6118  SSS sodium solute transporter superfamily  25.47 
 
 		 562 aa  120  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1859  SSS sodium solute transporter superfamily  24.42 
 
 		 551 aa  120  9e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1598  Na+/solute symporter  24.83 
 
 		 487 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.414751 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14290  SSS sodium solute transporter  25.45 
 
 		 566 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1047  sodium/solute symporter  27.61 
 
 		 488 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322443  normal  0.451489 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4407  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.09 
 
 		 613 aa  118  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0343463  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0993  SSS sodium solute transporter superfamily  22.86 
 
 		 569 aa  118  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0554078  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1869  Na+/solute symporter  25.06 
 
 		 502 aa  117  5e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.319535 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1671  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.38 
 
 		 593 aa  113  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302135 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.87 
 
 		 522 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0990  SSS sodium solute transporter superfamily  25 
 
 		 560 aa  112  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  24.94 
 
 		 557 aa  111  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3072  SSS sodium solute transporter superfamily  22.63 
 
 		 539 aa  110  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00704051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5244  SSS sodium solute transporter superfamily  23.04 
 
 		 545 aa  110  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4728  SSS sodium solute transporter superfamily  22.91 
 
 		 549 aa  110  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  hitchhiker  0.00040203 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1152  SSS sodium solute transporter superfamily  22.84 
 
 		 562 aa  109  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0742973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04060  SSS sodium solute transporter  23.87 
 
 		 565 aa  109  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  24.73 
 
 		 557 aa  109  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07575  putative transmembrane sodium-solute transporter  22.86 
 
 		 478 aa  108  4e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1927  SSS sodium solute transporter superfamily  22.45 
 
 		 568 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0029053  normal  0.303256 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2609  Na+/solute symporter  26.19 
 
 		 566 aa  105  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3709  SSS sodium solute transporter superfamily  24.62 
 
 		 564 aa  105  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174317  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.37 
 
 		 561 aa  102  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1283  putative symporter YidK  24.4 
 
 		 531 aa  101  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0416  sodium/solute symporter family protein  23.93 
 
 		 570 aa  100  8e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.951118  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3635  SSS sodium solute transporter superfamily  23.93 
 
 		 565 aa  100  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.85975  normal  0.450055 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4818  Na+/solute symporter  22.61 
 
 		 501 aa  100  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03563  predicted transporter  21.26 
 
 		 571 aa  99  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0024  SSS sodium solute transporter superfamily  21.26 
 
 		 571 aa  99  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1101  sodium:solute symporter family protein  24.22 
 
 		 486 aa  99.4  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.465096 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2732  SSS sodium solute transporter superfamily  21.88 
 
 		 561 aa  99.4  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03506  hypothetical protein  21.26 
 
 		 571 aa  99  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4187  putative symporter YidK  21.26 
 
 		 571 aa  98.6  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0087  putative symporter YidK  23.57 
 
 		 529 aa  97.8  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  22.55 
 
 		 561 aa  97.4  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  26.04 
 
 		 472 aa  97.4  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>