259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0043 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0043  Na+/solute symporter  100 
 
 		 565 aa  1144    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5478  Na+/solute symporter  58.98 
 
 		 568 aa  671    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0650513 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2866  sodium-solute symporter  55.79 
 
 		 581 aa  645    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297174 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1640  SSS sodium solute transporter superfamily  63.04 
 
 		 566 aa  748    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1380  SSS sodium solute transporter superfamily  57.54 
 
 		 562 aa  651    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.366294 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2962  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  49.64 
 
 		 574 aa  563  1.0000000000000001e-159  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.324391  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12043  sodium iodide symporter  48.04 
 
 		 547 aa  538  9.999999999999999e-153  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2609  Na+/solute symporter  44.36 
 
 		 566 aa  455  1.0000000000000001e-126  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  38.46 
 
 		 542 aa  199  9e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2815  SSS sodium solute transporter superfamily  26.29 
 
 		 527 aa  152  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6588  SSS sodium solute transporter superfamily  27.05 
 
 		 529 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  33.22 
 
 		 526 aa  145  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495731  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  30.46 
 
 		 530 aa  144  5e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03377  sodium:solute symporter family protein  30.82 
 
 		 523 aa  142  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3352  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  32.39 
 
 		 479 aa  140  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3985  SSS sodium solute transporter superfamily  26.57 
 
 		 527 aa  131  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000567258  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02564  hypothetical protein  26.53 
 
 		 581 aa  130  9.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2070  Na+/solute symporter  29.9 
 
 		 489 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0171  SSS sodium solute transporter superfamily  27.06 
 
 		 520 aa  126  1e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0745729 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4170  Na+/solute symporter  26.14 
 
 		 526 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0688566  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1825  SSS sodium solute transporter superfamily  29.37 
 
 		 533 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.915648  normal  0.529366 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.52 
 
 		 533 aa  117  7.999999999999999e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0609  sodium/solute symporter  27.4 
 
 		 513 aa  114  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.952879  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2763  Na+/solute symporter  28.48 
 
 		 472 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04816  alkaline phosphatase synthesis sensor protein phoR  27.92 
 
 		 513 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09590  Na+/proline symporter  28.98 
 
 		 501 aa  111  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0974546  normal  0.236374 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2009  sodium:solute symporter family protein  28.09 
 
 		 473 aa  110  5e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0195  sodium:solute symporter family protein  27 
 
 		 468 aa  109  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3022  SSS sodium solute transporter superfamily  27.48 
 
 		 883 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.61129  normal  0.844759 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0261  Na+/solute symporter  27.06 
 
 		 468 aa  108  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.728087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0232  Na+/solute symporter  25.99 
 
 		 467 aa  105  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2358  Na+/solute symporter  29.02 
 
 		 472 aa  103  7e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.552943  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0297  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.89 
 
 		 510 aa  103  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.977217  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0304  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.89 
 
 		 510 aa  103  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2466  SSS sodium solute transporter superfamily  26.25 
 
 		 509 aa  103  9e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4963400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  28.25 
 
 		 551 aa  101  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1518  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.94 
 
 		 892 aa  101  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0206  Na+/solute symporter  27.18 
 
 		 470 aa  101  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1193  sodium-glucose/galactose cotransporter  27.04 
 
 		 498 aa  96.3  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0641857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1238  sodium-glucose/galactose cotransporter  27.04 
 
 		 498 aa  96.3  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.425742 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1203  sodium-glucose/galactose cotransporter  27.04 
 
 		 498 aa  96.3  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.410205 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1223  sodium-glucose/galactose cotransporter  27.04 
 
 		 498 aa  96.3  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.532882 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5947  Na+/solute symporter  27.27 
 
 		 509 aa  92  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.35 
 
 		 526 aa  90.5  8e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0176  sodium:solute transporter  25.17 
 
 		 505 aa  90.1  9e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0179  sodium/solute symporter family protein  25.17 
 
 		 505 aa  89.7  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.67 
 
 		 523 aa  88.2  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0525  SSS sodium solute transporter superfamily  24.18 
 
 		 522 aa  87.8  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.692758  unclonable  0.0000000000137784 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  25.25 
 
 		 520 aa  85.9  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1047  sodium/solute symporter  25.18 
 
 		 488 aa  85.1  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322443  normal  0.451489 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  28.34 
 
 		 561 aa  84.7  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.6 
 
 		 548 aa  84.7  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0416  sodium/solute symporter family protein  26.97 
 
 		 570 aa  83.6  0.000000000000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.951118  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  25.18 
 
 		 520 aa  83.6  0.000000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.51 
 
 		 567 aa  83.6  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1227  Na+/solute symporter  25.76 
 
 		 517 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.212817  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1869  Na+/solute symporter  26.98 
 
 		 502 aa  82  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.319535 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  27.02 
 
 		 523 aa  82  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3709  SSS sodium solute transporter superfamily  30.32 
 
 		 564 aa  82  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174317  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25 
 
 		 522 aa  82  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3029  Na+/solute symporter  24.01 
 
 		 492 aa  81.6  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934608 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03563  predicted transporter  26.65 
 
 		 571 aa  80.5  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0024  SSS sodium solute transporter superfamily  26.65 
 
 		 571 aa  80.5  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03506  hypothetical protein  26.65 
 
 		 571 aa  80.5  0.00000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1598  Na+/solute symporter  24.82 
 
 		 487 aa  80.5  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.414751 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4187  putative symporter YidK  26.65 
 
 		 571 aa  80.1  0.00000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.17 
 
 		 561 aa  80.1  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3635  SSS sodium solute transporter superfamily  23.82 
 
 		 565 aa  80.1  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.85975  normal  0.450055 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5111  putative symporter YidK  26.33 
 
 		 571 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.393136 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  26.21 
 
 		 509 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.71 
 
 		 565 aa  79  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  26.1 
 
 		 557 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  26.02 
 
 		 557 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4044  putative symporter YidK  26.33 
 
 		 571 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.978949 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3621  SSS sodium solute transporter superfamily  27.84 
 
 		 596 aa  79  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.434287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0970  SSS sodium solute transporter superfamily  21.15 
 
 		 765 aa  79  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000363528  normal  0.258421 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3355  Na+/solute symporter  29.61 
 
 		 517 aa  78.6  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2048  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.38 
 
 		 550 aa  78.2  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1101  sodium:solute symporter family protein  21.02 
 
 		 486 aa  77.8  0.0000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.465096 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2903  Na+/solute symporter  24.34 
 
 		 488 aa  77.8  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1927  SSS sodium solute transporter superfamily  26.3 
 
 		 568 aa  77  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0029053  normal  0.303256 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.62 
 
 		 520 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  24.26 
 
 		 537 aa  76.6  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.81 
 
 		 519 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3541  Na+/solute symporter  26.49 
 
 		 597 aa  75.1  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165749  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.77 
 
 		 522 aa  75.5  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3116  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.11 
 
 		 522 aa  75.1  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4728  SSS sodium solute transporter superfamily  23.4 
 
 		 549 aa  75.1  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  hitchhiker  0.00040203 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1671  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  21.29 
 
 		 593 aa  74.7  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302135 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5244  SSS sodium solute transporter superfamily  23.3 
 
 		 545 aa  74.3  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6812  Na+/solute symporter  25 
 
 		 493 aa  73.9  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0641673  hitchhiker  0.00114247 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2774  SSS sodium solute transporter superfamily  24.26 
 
 		 529 aa  73.9  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00224729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2732  SSS sodium solute transporter superfamily  24.44 
 
 		 561 aa  73.9  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1152  SSS sodium solute transporter superfamily  23.13 
 
 		 562 aa  72.8  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0742973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.28 
 
 		 522 aa  72.4  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4407  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.08 
 
 		 613 aa  72.8  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0343463  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  24.67 
 
 		 592 aa  72.4  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6118  SSS sodium solute transporter superfamily  27.94 
 
 		 562 aa  71.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  25.09 
 
 		 520 aa  70.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.74 
 
 		 520 aa  70.5  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>