More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_2009 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_2009  sodium:solute symporter family protein  100 
 
 
473 aa  928    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2763  Na+/solute symporter  70.7 
 
 
472 aa  638    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2358  Na+/solute symporter  70.7 
 
 
472 aa  620  1e-176  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.552943  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0206  Na+/solute symporter  69.79 
 
 
470 aa  601  1e-170  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0195  sodium:solute symporter family protein  68.95 
 
 
468 aa  588  1e-167  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0232  Na+/solute symporter  67.18 
 
 
467 aa  575  1.0000000000000001e-163  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0261  Na+/solute symporter  65.87 
 
 
468 aa  571  1.0000000000000001e-162  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.728087  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09590  Na+/proline symporter  41.68 
 
 
501 aa  332  1e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0974546  normal  0.236374 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1825  SSS sodium solute transporter superfamily  38.32 
 
 
533 aa  293  5e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.915648  normal  0.529366 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1227  Na+/solute symporter  42.6 
 
 
517 aa  272  1e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.212817  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1869  Na+/solute symporter  39.43 
 
 
502 aa  248  2e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.319535 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3352  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  39.71 
 
 
479 aa  237  3e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5947  Na+/solute symporter  39.76 
 
 
509 aa  236  7e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  32.71 
 
 
542 aa  200  5e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0171  SSS sodium solute transporter superfamily  32.29 
 
 
520 aa  197  4.0000000000000005e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0745729 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  31.65 
 
 
530 aa  170  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02564  hypothetical protein  28.35 
 
 
581 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03377  sodium:solute symporter family protein  31.74 
 
 
523 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1101  sodium:solute symporter family protein  27.75 
 
 
486 aa  162  1e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.465096 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1518  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.98 
 
 
892 aa  158  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3022  SSS sodium solute transporter superfamily  31.61 
 
 
883 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.61129  normal  0.844759 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4818  Na+/solute symporter  27.48 
 
 
501 aa  156  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0525  SSS sodium solute transporter superfamily  29.01 
 
 
522 aa  154  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.692758  unclonable  0.0000000000137784 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3029  Na+/solute symporter  27.15 
 
 
492 aa  153  7e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00934608 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4170  Na+/solute symporter  27.63 
 
 
526 aa  153  8e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0688566  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6812  Na+/solute symporter  28.29 
 
 
493 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0641673  hitchhiker  0.00114247 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1047  sodium/solute symporter  27.57 
 
 
488 aa  152  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322443  normal  0.451489 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5478  Na+/solute symporter  32.89 
 
 
568 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0650513 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2962  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  33.44 
 
 
574 aa  152  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.324391  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.02 
 
 
526 aa  150  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495731  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2903  Na+/solute symporter  27.48 
 
 
488 aa  150  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1598  Na+/solute symporter  27.95 
 
 
487 aa  150  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.414751 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0179  sodium/solute symporter family protein  28.32 
 
 
505 aa  146  9e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0176  sodium:solute transporter  28.32 
 
 
505 aa  146  9e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2070  Na+/solute symporter  26.77 
 
 
489 aa  143  5e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1640  SSS sodium solute transporter superfamily  30.82 
 
 
566 aa  139  8.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171262  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12043  sodium iodide symporter  31.79 
 
 
547 aa  139  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2466  SSS sodium solute transporter superfamily  28.83 
 
 
509 aa  138  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4963400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6588  SSS sodium solute transporter superfamily  28.31 
 
 
529 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2815  SSS sodium solute transporter superfamily  26.85 
 
 
527 aa  134  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0609  sodium/solute symporter  26.33 
 
 
513 aa  133  7.999999999999999e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.952879  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04816  alkaline phosphatase synthesis sensor protein phoR  26.71 
 
 
513 aa  130  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3985  SSS sodium solute transporter superfamily  26.89 
 
 
527 aa  130  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000567258  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07575  putative transmembrane sodium-solute transporter  27.03 
 
 
478 aa  129  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1380  SSS sodium solute transporter superfamily  28.81 
 
 
562 aa  127  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.366294 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2866  sodium-solute symporter  29.47 
 
 
581 aa  126  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00297174 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2609  Na+/solute symporter  32.68 
 
 
566 aa  123  6e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0297  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.56 
 
 
510 aa  114  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.977217  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0304  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.56 
 
 
510 aa  114  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  30.38 
 
 
523 aa  111  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0043  Na+/solute symporter  28.09 
 
 
565 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  27.78 
 
 
592 aa  107  6e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1859  SSS sodium solute transporter superfamily  29.32 
 
 
551 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3355  Na+/solute symporter  27.23 
 
 
517 aa  100  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  27.17 
 
 
537 aa  97.8  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.53 
 
 
526 aa  97.8  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  24.17 
 
 
520 aa  97.4  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.13 
 
 
523 aa  95.9  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1223  sodium-glucose/galactose cotransporter  26.35 
 
 
498 aa  94.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.532882 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1203  sodium-glucose/galactose cotransporter  26.35 
 
 
498 aa  94.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.410205 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1193  sodium-glucose/galactose cotransporter  26.35 
 
 
498 aa  94.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0641857  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1238  sodium-glucose/galactose cotransporter  26.35 
 
 
498 aa  94.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.425742 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  27.11 
 
 
598 aa  94.4  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0993  SSS sodium solute transporter superfamily  27.25 
 
 
569 aa  89.7  9e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0554078  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.53 
 
 
519 aa  89  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.36 
 
 
533 aa  88.6  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.38 
 
 
520 aa  86.7  8e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.85 
 
 
522 aa  86.7  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0416  sodium/solute symporter family protein  27.96 
 
 
570 aa  85.9  0.000000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.951118  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3541  Na+/solute symporter  25.14 
 
 
597 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165749  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  25.07 
 
 
509 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.93 
 
 
522 aa  84.3  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.1 
 
 
565 aa  83.6  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.32 
 
 
520 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  23.45 
 
 
520 aa  82  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4407  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.34 
 
 
613 aa  82.4  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0343463  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3709  SSS sodium solute transporter superfamily  25.94 
 
 
564 aa  81.6  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174317  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.15 
 
 
548 aa  81.3  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  25.28 
 
 
487 aa  81.3  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4210  sodium/proline symporter  27.57 
 
 
494 aa  80.9  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0148  sodium/proline symporter  28.05 
 
 
499 aa  81.3  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.720955  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  24.1 
 
 
520 aa  81.3  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6118  SSS sodium solute transporter superfamily  24.32 
 
 
562 aa  81.3  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3116  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.69 
 
 
522 aa  80.9  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6961  Na+/solute symporter  23.86 
 
 
533 aa  80.1  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.931741  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4018  sodium/proline symporter  26.85 
 
 
494 aa  79.3  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.43 
 
 
567 aa  79.7  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3645  sodium/panthothenate symporter  27.73 
 
 
483 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00060524 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3742  sodium/panthothenate symporter  27.73 
 
 
483 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.133198 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3680  sodium/panthothenate symporter  27.45 
 
 
483 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.433126 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3573  sodium/panthothenate symporter  27.73 
 
 
483 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0131777  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  28.42 
 
 
557 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3574  sodium/panthothenate symporter  27.45 
 
 
483 aa  78.2  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1152  SSS sodium solute transporter superfamily  23.28 
 
 
562 aa  77.8  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0742973  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1283  putative symporter YidK  24.87 
 
 
531 aa  77.8  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1324  Na+/solute symporter  26.08 
 
 
603 aa  77.8  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1600  Na+/solute symporter  27.84 
 
 
473 aa  77.4  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0101485  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  28.57 
 
 
557 aa  77.4  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3766  sodium/proline symporter  26.19 
 
 
499 aa  77  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.525061  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1178  sodium:solute symporter family protein  24.02 
 
 
585 aa  77  0.0000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.107894 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>