More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0801 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  100 
 
 		 487 aa  979    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  73.24 
 
 		 483 aa  692    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1817  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  55.92 
 
 		 484 aa  514  1e-144  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  30.75 
 
 		 479 aa  182  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  28.25 
 
 		 472 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  28.63 
 
 		 461 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  30.08 
 
 		 463 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  29.75 
 
 		 463 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  29.36 
 
 		 461 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  29.45 
 
 		 462 aa  166  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  30.59 
 
 		 459 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  30.59 
 
 		 459 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  30.59 
 
 		 459 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  31.1 
 
 		 459 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  30.43 
 
 		 459 aa  162  9e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  28.91 
 
 		 500 aa  154  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2906  Na+/solute symporter  28.14 
 
 		 463 aa  152  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0367  Na+/solute symporter  28.88 
 
 		 446 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.101074  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  30.19 
 
 		 460 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1620  Na+/solute symporter  28.28 
 
 		 460 aa  147  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0163738 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  24.95 
 
 		 483 aa  143  6e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0924  twin-arginine translocation pathway signal  28.54 
 
 		 452 aa  143  8e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.839391  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  27.35 
 
 		 476 aa  140  7e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  26.22 
 
 		 483 aa  137  3.0000000000000003e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  27.91 
 
 		 509 aa  133  7.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0846  Na+/solute symporter  25.85 
 
 		 507 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0041  sodium/pantothenate symporter  25.54 
 
 		 468 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.3030600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  27.49 
 
 		 492 aa  131  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  27.07 
 
 		 493 aa  130  6e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  27.25 
 
 		 493 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  26.46 
 
 		 492 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  27.25 
 
 		 492 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.37 
 
 		 522 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  28.31 
 
 		 483 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  27.25 
 
 		 493 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  27.25 
 
 		 493 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  26.26 
 
 		 487 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  27.25 
 
 		 492 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  26.26 
 
 		 492 aa  127  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1716  GTP-binding protein, HSR1-releated protein  29.71 
 
 		 498 aa  128  3e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.066858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  27.97 
 
 		 492 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  27.66 
 
 		 488 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  27.62 
 
 		 492 aa  127  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  27.62 
 
 		 492 aa  127  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  27.62 
 
 		 492 aa  127  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0964  Na+/solute symporter  24.7 
 
 		 508 aa  127  6e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  26.06 
 
 		 492 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  27.62 
 
 		 492 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  27.62 
 
 		 492 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  27.31 
 
 		 482 aa  126  9e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1081  sodium/proline symporter  28.67 
 
 		 498 aa  125  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000772394  unclonable  0.00000000000701401 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3463  proline/sodium symporter  26.57 
 
 		 495 aa  125  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  26.92 
 
 		 492 aa  125  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  27.86 
 
 		 492 aa  125  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  28.03 
 
 		 483 aa  125  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  25.2 
 
 		 551 aa  125  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1242  sodium/proline symporter  27.05 
 
 		 491 aa  124  3e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.78 
 
 		 526 aa  124  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  27.51 
 
 		 492 aa  124  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1675  sodium/proline permease  26.28 
 
 		 489 aa  123  6e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  23.34 
 
 		 474 aa  123  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  25.66 
 
 		 492 aa  123  6e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1854  sodium/proline permease  26 
 
 		 489 aa  123  9e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.794377  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.98 
 
 		 533 aa  122  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  26.56 
 
 		 482 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  26.57 
 
 		 483 aa  121  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07840  sodium/ prolin symporter  27.58 
 
 		 544 aa  121  3e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0416  sodium/proline symporter  26.97 
 
 		 495 aa  121  3e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.292846  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1494  sodium/proline permease  25.84 
 
 		 489 aa  121  3e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.858456  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  26.6 
 
 		 464 aa  121  3.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2710  Na+/solute symporter  27.48 
 
 		 462 aa  120  6e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.308556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2686  sodium/proline symporter  28.08 
 
 		 486 aa  120  6e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  27.55 
 
 		 492 aa  120  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0522  sodium/proline symporter  27.46 
 
 		 492 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550728  normal  0.0854838 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  25.5 
 
 		 518 aa  119  9e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  27.15 
 
 		 493 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  25.93 
 
 		 486 aa  118  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.25 
 
 		 523 aa  117  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.17 
 
 		 565 aa  118  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  27.55 
 
 		 488 aa  117  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2608  sodium/proline symporter  26.17 
 
 		 483 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0498264  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1463  sodium/proline symporter  28.37 
 
 		 483 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.169082  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1653  sodium/proline symporter  26.95 
 
 		 511 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.56 
 
 		 520 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2469  sodium/proline symporter  28.05 
 
 		 497 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00121427  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4946  sodium/proline symporter  27.59 
 
 		 492 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1248  Sodium/proline symporter  29.24 
 
 		 496 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.126391  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1398  sodium/proline symporter  28.37 
 
 		 483 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0934266  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  25.76 
 
 		 520 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4818  sodium/proline symporter  27.38 
 
 		 492 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.88778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0672  Na+/solute symporter  24.12 
 
 		 633 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4995  sodium/proline symporter  25.91 
 
 		 492 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  27.4 
 
 		 482 aa  114  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1600  Na+/solute symporter  28.04 
 
 		 473 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0101485  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  28.02 
 
 		 485 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05410  Sodium:solute symporter  25.11 
 
 		 542 aa  114  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000184365  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4206  Na+/solute symporter  24.34 
 
 		 490 aa  113  8.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153775  normal  0.0109856 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1451  sodium/proline symporter  28.1 
 
 		 483 aa  113  9e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0423407  unclonable  0.000000000084673 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2865  sodium/proline symporter  28.34 
 
 		 483 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.468907 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2770  sodium/proline symporter  28.34 
 
 		 483 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000703765  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>