214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6812 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6812  Na+/solute symporter  100 
 
 		 493 aa  988    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0641673  hitchhiker  0.00114247 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1598  Na+/solute symporter  47.07 
 
 		 487 aa  461  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.414751 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3029  Na+/solute symporter  48.47 
 
 		 492 aa  455  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934608 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2903  Na+/solute symporter  46.69 
 
 		 488 aa  431  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4818  Na+/solute symporter  44.88 
 
 		 501 aa  419  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1101  sodium:solute symporter family protein  46.38 
 
 		 486 aa  410  1e-113  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.465096 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1047  sodium/solute symporter  44.38 
 
 		 488 aa  399  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322443  normal  0.451489 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07575  putative transmembrane sodium-solute transporter  45.13 
 
 		 478 aa  394  1e-108  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09590  Na+/proline symporter  30.02 
 
 		 501 aa  184  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0974546  normal  0.236374 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1825  SSS sodium solute transporter superfamily  30.56 
 
 		 533 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.915648  normal  0.529366 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3352  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.4 
 
 		 479 aa  161  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2763  Na+/solute symporter  28.9 
 
 		 472 aa  160  6e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0232  Na+/solute symporter  27.91 
 
 		 467 aa  158  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0171  SSS sodium solute transporter superfamily  27.87 
 
 		 520 aa  157  5.0000000000000005e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0745729 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0206  Na+/solute symporter  28.5 
 
 		 470 aa  155  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0261  Na+/solute symporter  26.52 
 
 		 468 aa  154  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.728087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0195  sodium:solute symporter family protein  26.7 
 
 		 468 aa  151  3e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2009  sodium:solute symporter family protein  27.02 
 
 		 473 aa  150  4e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2358  Na+/solute symporter  27.12 
 
 		 472 aa  150  7e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.552943  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4170  Na+/solute symporter  23.51 
 
 		 526 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0688566  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2070  Na+/solute symporter  27.03 
 
 		 489 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1227  Na+/solute symporter  23.4 
 
 		 517 aa  124  5e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.212817  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2962  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.46 
 
 		 574 aa  121  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.324391  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1869  Na+/solute symporter  26.95 
 
 		 502 aa  119  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.319535 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.21 
 
 		 526 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495731  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.33 
 
 		 542 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5947  Na+/solute symporter  26.82 
 
 		 509 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03377  sodium:solute symporter family protein  25.79 
 
 		 523 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0609  sodium/solute symporter  22.92 
 
 		 513 aa  102  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.952879  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  22.77 
 
 		 530 aa  102  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2609  Na+/solute symporter  25.8 
 
 		 566 aa  101  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  24.43 
 
 		 557 aa  100  7e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.21 
 
 		 565 aa  100  8e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02564  hypothetical protein  23.5 
 
 		 581 aa  100  9e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12043  sodium iodide symporter  24.83 
 
 		 547 aa  99.4  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5478  Na+/solute symporter  22.92 
 
 		 568 aa  98.2  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0650513 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1380  SSS sodium solute transporter superfamily  25.25 
 
 		 562 aa  97.8  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.366294 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1518  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.69 
 
 		 892 aa  95.5  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0297  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.64 
 
 		 510 aa  92.4  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.977217  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0304  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.64 
 
 		 510 aa  92.4  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  23.53 
 
 		 557 aa  92.4  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04816  alkaline phosphatase synthesis sensor protein phoR  23.72 
 
 		 513 aa  90.9  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0179  sodium/solute symporter family protein  21.43 
 
 		 505 aa  89  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1640  SSS sodium solute transporter superfamily  24 
 
 		 566 aa  88.2  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0176  sodium:solute transporter  21.15 
 
 		 505 aa  87.4  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2466  SSS sodium solute transporter superfamily  21.64 
 
 		 509 aa  84.7  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4963400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2866  sodium-solute symporter  23.24 
 
 		 581 aa  83.6  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297174 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0525  SSS sodium solute transporter superfamily  22.86 
 
 		 522 aa  83.2  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.692758  unclonable  0.0000000000137784 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  23.24 
 
 		 509 aa  82  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  21.59 
 
 		 526 aa  80.1  0.00000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3022  SSS sodium solute transporter superfamily  21.17 
 
 		 883 aa  78.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.61129  normal  0.844759 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  23.25 
 
 		 523 aa  78.6  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  23.58 
 
 		 483 aa  77.8  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  23.57 
 
 		 482 aa  77  0.0000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  22.17 
 
 		 551 aa  75.5  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2774  SSS sodium solute transporter superfamily  22.27 
 
 		 529 aa  74.7  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00224729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.79 
 
 		 533 aa  74.3  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1193  sodium-glucose/galactose cotransporter  21.35 
 
 		 498 aa  73.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0641857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1203  sodium-glucose/galactose cotransporter  21.5 
 
 		 498 aa  73.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.410205 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1238  sodium-glucose/galactose cotransporter  21.5 
 
 		 498 aa  73.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.425742 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1223  sodium-glucose/galactose cotransporter  21.5 
 
 		 498 aa  73.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.532882 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  22.44 
 
 		 482 aa  73.2  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0068  Na+/solute symporter  26.4 
 
 		 512 aa  72  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  21.01 
 
 		 523 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  23.53 
 
 		 598 aa  70.5  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.12 
 
 		 526 aa  70.1  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0592432  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01330  Na+/proline symporter  25.73 
 
 		 525 aa  68.9  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  24.47 
 
 		 483 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04060  SSS sodium solute transporter  21.54 
 
 		 565 aa  66.2  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0087  putative symporter YidK  21.49 
 
 		 529 aa  65.5  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1113  SSS sodium solute transporter superfamily  22.34 
 
 		 529 aa  64.3  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00736856  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0043  Na+/solute symporter  25 
 
 		 565 aa  64.3  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  20.44 
 
 		 567 aa  63.9  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2815  SSS sodium solute transporter superfamily  19.74 
 
 		 527 aa  63.9  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  21.57 
 
 		 519 aa  63.9  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3191  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.99 
 
 		 504 aa  62.8  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.205305  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  21.2 
 
 		 486 aa  62.4  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5643  putative symporter YidK  21.66 
 
 		 532 aa  62.4  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0528726  normal  0.86029 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  21.92 
 
 		 479 aa  60.8  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1283  putative symporter YidK  22.76 
 
 		 531 aa  58.5  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  20 
 
 		 520 aa  58.5  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4019  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.03 
 
 		 474 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000206243 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  20.05 
 
 		 592 aa  58.5  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0815  Na+/solute symporter  24.57 
 
 		 507 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.215377  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0457  sodium/proline symporter  21.4 
 
 		 492 aa  58.2  0.0000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0990  SSS sodium solute transporter superfamily  21.98 
 
 		 560 aa  57.4  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3090  Na+/solute symporter  21.56 
 
 		 508 aa  57.4  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000664536  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  18.9 
 
 		 520 aa  57  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  26.76 
 
 		 493 aa  57  0.0000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  20.6 
 
 		 522 aa  56.6  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0093  Na+/solute symporter  24.05 
 
 		 505 aa  56.6  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.620511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5244  SSS sodium solute transporter superfamily  20.09 
 
 		 545 aa  56.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1242  sodium/proline symporter  28.1 
 
 		 491 aa  56.2  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  22.29 
 
 		 461 aa  56.2  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  25.07 
 
 		 487 aa  56.2  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0416  sodium/solute symporter family protein  20.81 
 
 		 570 aa  55.5  0.000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.951118  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  22.72 
 
 		 486 aa  54.7  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  19.11 
 
 		 520 aa  55.1  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3709  SSS sodium solute transporter superfamily  25.13 
 
 		 564 aa  55.1  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174317  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1731  sodium/proline symporter  25.35 
 
 		 496 aa  55.1  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.253035  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>