More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_01330 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0068  Na+/solute symporter  71.37 
 
 		 512 aa  690    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01330  Na+/proline symporter  100 
 
 		 525 aa  1030    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3090  Na+/solute symporter  60.24 
 
 		 508 aa  586  1e-166  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000664536  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0612  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  49.2 
 
 		 503 aa  396  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000214976  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3191  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  45.36 
 
 		 504 aa  360  4e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.205305  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2279  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  44.21 
 
 		 504 aa  340  5e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.257788  hitchhiker  0.0000218485 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0735  Na+/solute symporter  42.51 
 
 		 489 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1220  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  41.75 
 
 		 489 aa  335  1e-90  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1464  Na+/solute symporter  42.16 
 
 		 489 aa  335  2e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.675757  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1759  Na+ symporter  40.57 
 
 		 531 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1134  Na+/solute symporter  28.41 
 
 		 527 aa  162  1e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02712  proline/sodium symporter  31.22 
 
 		 493 aa  160  5e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.076903  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1326  Sodium/proline symporter  29.98 
 
 		 488 aa  154  5e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0529188  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  28.87 
 
 		 487 aa  151  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1653  sodium/proline symporter  31.28 
 
 		 511 aa  150  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  28.66 
 
 		 492 aa  150  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  28.87 
 
 		 492 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  28.42 
 
 		 492 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  28.42 
 
 		 492 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  28.42 
 
 		 492 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  28.42 
 
 		 492 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  28.42 
 
 		 492 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  28.42 
 
 		 492 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  28.66 
 
 		 493 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  28.66 
 
 		 492 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  28.66 
 
 		 492 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  28.87 
 
 		 492 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  28.66 
 
 		 493 aa  148  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  28.66 
 
 		 493 aa  148  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  28.69 
 
 		 492 aa  148  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  28.45 
 
 		 492 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0425  Na+/solute symporter  28.7 
 
 		 530 aa  147  5e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  28.45 
 
 		 492 aa  147  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1002  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.54 
 
 		 533 aa  147  6e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2326  Na+/solute symporter  28.1 
 
 		 520 aa  145  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  28.22 
 
 		 492 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3463  proline/sodium symporter  31.9 
 
 		 495 aa  145  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1396  Na+/proline symporter  29.03 
 
 		 553 aa  144  3e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  30.07 
 
 		 492 aa  145  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3721  sodium:proline symporter (proline permease)  27.79 
 
 		 553 aa  144  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  29.28 
 
 		 488 aa  144  6e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  28.63 
 
 		 484 aa  140  6e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2137  SSS sodium solute transporter superfamily  28.07 
 
 		 528 aa  139  1e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00565072  normal  0.610314 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0036  Na+ symporter  27.36 
 
 		 537 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.90526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1063  hypothetical protein  30.71 
 
 		 526 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.771513 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  27.63 
 
 		 492 aa  136  9e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1248  Sodium/proline symporter  32.81 
 
 		 496 aa  136  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.126391  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4147  sodium/proline symporter  30.56 
 
 		 497 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01675  proline/sodium symporter  32.33 
 
 		 504 aa  136  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.068924  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1440  proline permease  30.89 
 
 		 511 aa  135  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0406998  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0522  sodium/proline symporter  28.98 
 
 		 492 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550728  normal  0.0854838 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1156  sodium/proline symporter  26.15 
 
 		 486 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.307204  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  26.19 
 
 		 513 aa  134  6e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4818  sodium/proline symporter  28.74 
 
 		 492 aa  134  6e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.88778  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4946  sodium/proline symporter  28.74 
 
 		 492 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4995  sodium/proline symporter  28.1 
 
 		 492 aa  133  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05510  SSS sodium solute transporter  26.59 
 
 		 536 aa  132  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  28.02 
 
 		 492 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  26.8 
 
 		 482 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1957  high affinity proline permease  30.2 
 
 		 512 aa  132  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1991  high affinity proline permease  30.2 
 
 		 512 aa  132  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4736  sodium/proline symporter PutP  27.93 
 
 		 506 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54150  sodium/proline symporter PutP  27.7 
 
 		 506 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  27.79 
 
 		 492 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0453  Sodium/proline symporter  28.03 
 
 		 494 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1250  sodium/proline symporter  27.11 
 
 		 496 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.469552 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01018  proline:sodium symporter  28.53 
 
 		 502 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2580  sodium/proline symporter  28.53 
 
 		 502 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0213742 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1131  sodium/proline symporter  28.53 
 
 		 502 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.276577  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1253  sodium/proline symporter  28.53 
 
 		 502 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.325594 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1135  sodium/proline symporter  28.53 
 
 		 502 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0465761  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2108  sodium/proline symporter  28.53 
 
 		 502 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.275652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3766  sodium/proline symporter  29.26 
 
 		 499 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.525061  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2627  sodium/proline symporter  29.07 
 
 		 502 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.516748  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  27.92 
 
 		 492 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1200  sodium/proline symporter  28.53 
 
 		 502 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.133838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  29.13 
 
 		 488 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0148  sodium/proline symporter  27.99 
 
 		 499 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.720955  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1235  sodium/proline symporter  28.53 
 
 		 502 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0211084  normal  0.60164 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1190  sodium/proline symporter  28.53 
 
 		 502 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.969329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1220  sodium/proline symporter  28.53 
 
 		 502 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.405046 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  28.87 
 
 		 483 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1542  sodium/proline symporter  29.4 
 
 		 502 aa  128  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.13082 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1716  GTP-binding protein, HSR1-releated protein  26.14 
 
 		 498 aa  128  3e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.066858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  27.02 
 
 		 485 aa  128  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0468  Na+/solute symporter  27.97 
 
 		 528 aa  128  3e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.280127  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1706  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.07 
 
 		 533 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1860  sodium/proline symporter  32.41 
 
 		 496 aa  127  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0914218  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2302  sodium/proline symporter  28.27 
 
 		 502 aa  127  5e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  29.19 
 
 		 483 aa  127  5e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1847  Na+/solute symporter  27.13 
 
 		 543 aa  127  6e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.145671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0049  Na+/solute symporter  28.7 
 
 		 543 aa  127  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1085  sodium/proline symporter  28.27 
 
 		 503 aa  126  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1291  Na+/solute symporter  28.64 
 
 		 481 aa  126  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  26.54 
 
 		 493 aa  126  1e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0975  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.81 
 
 		 533 aa  126  1e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0034  Na+/solute symporter  28.34 
 
 		 543 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.404882  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0507  Na+/solute symporter  28.72 
 
 		 519 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.550362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3641  sodium/panthothenate symporter  26.71 
 
 		 483 aa  125  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000698464  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4575  sodium/panthothenate symporter  26.71 
 
 		 483 aa  125  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000690231  normal  0.130163 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>