More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1134 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1134  Na+/solute symporter  100 
 
 		 527 aa  1036    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2326  Na+/solute symporter  65.47 
 
 		 520 aa  657    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1063  hypothetical protein  60.08 
 
 		 526 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.771513 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0425  Na+/solute symporter  56.61 
 
 		 530 aa  541  1e-153  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3721  sodium:proline symporter (proline permease)  53.12 
 
 		 553 aa  538  9.999999999999999e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0468  Na+/solute symporter  53.97 
 
 		 528 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.280127  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1706  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  52.27 
 
 		 533 aa  498  1e-140  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0975  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  53.22 
 
 		 533 aa  497  1e-139  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0971  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  53.02 
 
 		 533 aa  498  1e-139  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0036  Na+ symporter  53.82 
 
 		 537 aa  495  1e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.90526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1002  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  50.3 
 
 		 533 aa  491  1e-137  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1847  Na+/solute symporter  50.7 
 
 		 543 aa  442  1e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.145671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1337  sodium/proline symporter (proline permease)  50.99 
 
 		 531 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0049  Na+/solute symporter  50.7 
 
 		 543 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0034  Na+/solute symporter  49.61 
 
 		 543 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.404882  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0037  Na+/solute symporter  50.6 
 
 		 543 aa  435  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3191  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.29 
 
 		 504 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.205305  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0408  Na+/proline symporter-like protein  45.06 
 
 		 377 aa  162  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1759  Na+ symporter  29.19 
 
 		 531 aa  158  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3090  Na+/solute symporter  27.25 
 
 		 508 aa  153  8.999999999999999e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000664536  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0068  Na+/solute symporter  28.32 
 
 		 512 aa  146  8.000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1291  Na+/solute symporter  26.03 
 
 		 481 aa  144  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1464  Na+/solute symporter  27.31 
 
 		 489 aa  144  5e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.675757  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1220  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.02 
 
 		 489 aa  144  5e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0735  Na+/solute symporter  26.79 
 
 		 489 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2279  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.35 
 
 		 504 aa  140  7.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.257788  hitchhiker  0.0000218485 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01330  Na+/proline symporter  28.41 
 
 		 525 aa  137  4e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  24.39 
 
 		 492 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0612  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.33 
 
 		 503 aa  130  6e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000214976  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  24.14 
 
 		 492 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  24.14 
 
 		 492 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  24.14 
 
 		 492 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  24.89 
 
 		 492 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  24.89 
 
 		 492 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  24.89 
 
 		 492 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  24.75 
 
 		 492 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  26.28 
 
 		 485 aa  127  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  24.89 
 
 		 492 aa  127  7e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  23.43 
 
 		 492 aa  124  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1542  sodium/proline symporter  26.08 
 
 		 502 aa  124  5e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.13082 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0457  sodium/proline symporter  26.86 
 
 		 492 aa  124  5e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3686  sodium/panthothenate symporter  28.61 
 
 		 483 aa  123  8e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.925299  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  25.11 
 
 		 484 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1939  sodium/proline symporter  27.16 
 
 		 498 aa  122  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  25.48 
 
 		 482 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01675  proline/sodium symporter  27.51 
 
 		 504 aa  121  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.068924  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  24.62 
 
 		 488 aa  121  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  27.79 
 
 		 493 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4420  sodium/panthothenate symporter  26.44 
 
 		 481 aa  120  7.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0607009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  23.73 
 
 		 492 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3844  sodium/panthothenate symporter  25.39 
 
 		 483 aa  118  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325661  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  22.32 
 
 		 492 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  22.13 
 
 		 492 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04170  sodium/proline symporter  27.03 
 
 		 499 aa  117  3.9999999999999997e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0302673 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29910  sodium/proline symporter  28.08 
 
 		 520 aa  117  5e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  25.32 
 
 		 493 aa  117  5e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1415  SSS family Na(+)/proline symporter  27.19 
 
 		 499 aa  117  6e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.631202 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  24.01 
 
 		 482 aa  117  6.9999999999999995e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0552  sodium/pantothenate symporter  26.62 
 
 		 482 aa  117  6.9999999999999995e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02712  proline/sodium symporter  27.02 
 
 		 493 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.076903  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  21.89 
 
 		 487 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1209  sodium/panthothenate symporter  26.32 
 
 		 484 aa  116  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00169799  normal  0.818802 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0455  sodium/panthothenate symporter  26.32 
 
 		 484 aa  116  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0389  sodium/panthothenate symporter  26.32 
 
 		 484 aa  116  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00229851  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  22.13 
 
 		 492 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.286578 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01018  proline:sodium symporter  25.32 
 
 		 502 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2627  sodium/proline symporter  25.53 
 
 		 502 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.516748  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  22.03 
 
 		 493 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  22.03 
 
 		 492 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1253  sodium/proline symporter  25.32 
 
 		 502 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.325594 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1131  sodium/proline symporter  25.32 
 
 		 502 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.276577  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2108  sodium/proline symporter  25.32 
 
 		 502 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.275652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2580  sodium/proline symporter  25.32 
 
 		 502 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0213742 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1135  sodium/proline symporter  25.32 
 
 		 502 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0465761  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1156  sodium/proline symporter  24.84 
 
 		 486 aa  115  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.307204  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1200  sodium/proline symporter  25.11 
 
 		 502 aa  115  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.133838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  26.17 
 
 		 492 aa  115  3e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  21.91 
 
 		 492 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2302  sodium/proline symporter  25.32 
 
 		 502 aa  114  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0240  sodium/panthothenate symporter  27.51 
 
 		 483 aa  114  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1220  sodium/proline symporter  25.11 
 
 		 502 aa  115  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.405046 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1235  sodium/proline symporter  25.11 
 
 		 502 aa  115  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0211084  normal  0.60164 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0244  sodium/panthothenate symporter  27.51 
 
 		 483 aa  114  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1190  sodium/proline symporter  25.11 
 
 		 502 aa  115  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.969329  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  21.91 
 
 		 493 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  21.91 
 
 		 493 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1854  sodium/proline permease  24.46 
 
 		 489 aa  114  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.794377  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  25.54 
 
 		 492 aa  114  6e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1576  Sodium/proline symporter  28.57 
 
 		 499 aa  113  7.000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.84214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4147  sodium/proline symporter  26.94 
 
 		 497 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1451  sodium/proline symporter  26.19 
 
 		 483 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0423407  unclonable  0.000000000084673 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  25.11 
 
 		 492 aa  113  9e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2865  sodium/proline symporter  26.41 
 
 		 483 aa  113  9e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.468907 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1440  proline permease  26.38 
 
 		 511 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0406998  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1085  sodium/proline symporter  24.89 
 
 		 503 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1675  sodium/proline permease  24.46 
 
 		 489 aa  113  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2790  sodium/proline symporter  26.46 
 
 		 483 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276408  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1588  sodium/proline symporter  26.46 
 
 		 483 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000493204  unclonable  0.00000000000453194 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2770  sodium/proline symporter  26.46 
 
 		 483 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000703765  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3553  sodium/panthothenate symporter  25.59 
 
 		 483 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000280994  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>