244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1291 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1291  Na+/solute symporter  100 
 
 		 481 aa  942    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1134  Na+/solute symporter  26.03 
 
 		 527 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1002  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.46 
 
 		 533 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3721  sodium:proline symporter (proline permease)  26.71 
 
 		 553 aa  134  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3191  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.38 
 
 		 504 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.205305  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0468  Na+/solute symporter  28.99 
 
 		 528 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.280127  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3090  Na+/solute symporter  28.37 
 
 		 508 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000664536  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1706  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.6 
 
 		 533 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2326  Na+/solute symporter  30.68 
 
 		 520 aa  126  7e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0975  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.95 
 
 		 533 aa  125  2e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0971  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.49 
 
 		 533 aa  124  4e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0036  Na+ symporter  29.49 
 
 		 537 aa  123  8e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.90526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2279  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.51 
 
 		 504 aa  122  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.257788  hitchhiker  0.0000218485 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1063  hypothetical protein  28.65 
 
 		 526 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.771513 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0425  Na+/solute symporter  28.09 
 
 		 530 aa  119  9e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01330  Na+/proline symporter  29.35 
 
 		 525 aa  119  9.999999999999999e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1337  sodium/proline symporter (proline permease)  26.83 
 
 		 531 aa  116  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0034  Na+/solute symporter  31.87 
 
 		 543 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.404882  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0049  Na+/solute symporter  31.87 
 
 		 543 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0037  Na+/solute symporter  31.87 
 
 		 543 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1464  Na+/solute symporter  25.39 
 
 		 489 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.675757  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0735  Na+/solute symporter  25.37 
 
 		 489 aa  113  8.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0612  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.98 
 
 		 503 aa  111  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000214976  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1220  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.95 
 
 		 489 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1847  Na+/solute symporter  27.55 
 
 		 543 aa  106  9e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.145671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0068  Na+/solute symporter  29.64 
 
 		 512 aa  101  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1759  Na+ symporter  28.12 
 
 		 531 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4420  sodium/panthothenate symporter  30.28 
 
 		 481 aa  98.2  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0607009  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3686  sodium/panthothenate symporter  29.02 
 
 		 483 aa  93.2  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.925299  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1209  sodium/panthothenate symporter  27.76 
 
 		 484 aa  91.3  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00169799  normal  0.818802 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0455  sodium/panthothenate symporter  27.76 
 
 		 484 aa  91.3  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0389  sodium/panthothenate symporter  27.76 
 
 		 484 aa  91.3  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00229851  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0244  sodium/panthothenate symporter  27.9 
 
 		 483 aa  90.5  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1600  Na+/solute symporter  27.67 
 
 		 473 aa  89.4  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0101485  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0240  sodium/panthothenate symporter  27.9 
 
 		 483 aa  89.7  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3844  sodium/panthothenate symporter  28.34 
 
 		 483 aa  89.7  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325661  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3680  sodium/panthothenate symporter  26.69 
 
 		 483 aa  87  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.433126 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3742  sodium/panthothenate symporter  26.69 
 
 		 483 aa  86.7  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.133198 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3574  sodium/panthothenate symporter  26.69 
 
 		 483 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3573  sodium/panthothenate symporter  26.69 
 
 		 483 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0131777  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3645  sodium/panthothenate symporter  26.69 
 
 		 483 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060524 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3641  sodium/panthothenate symporter  26.07 
 
 		 483 aa  84.7  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000698464  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03116  sodium/panthothenate symporter  26.07 
 
 		 483 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.735141  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0448  sodium/pantothenate symporter  26.07 
 
 		 483 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.293948  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3553  sodium/panthothenate symporter  26.07 
 
 		 483 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000280994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3742  sodium/panthothenate symporter  26.07 
 
 		 483 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150129  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4575  sodium/panthothenate symporter  26.07 
 
 		 483 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000690231  normal  0.130163 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3450  sodium/panthothenate symporter  26.07 
 
 		 483 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000724112  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03067  hypothetical protein  26.07 
 
 		 483 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.647307  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0448  sodium/panthothenate symporter  26.07 
 
 		 483 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.024979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1194  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  26.22 
 
 		 476 aa  82.8  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.679676 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0567  sodium/panthothenate symporter  24.44 
 
 		 480 aa  80.1  0.00000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.868181  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  26.2 
 
 		 483 aa  78.6  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1379  sodium/panthothenate symporter  25.94 
 
 		 492 aa  73.9  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0385274  normal  0.372154 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2227  sodium/panthothenate symporter  26.73 
 
 		 477 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0585956  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3567  sodium/panthothenate symporter  24.68 
 
 		 477 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3346  sodium/panthothenate symporter  24.68 
 
 		 479 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000197319  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3607  sodium/panthothenate symporter  24.68 
 
 		 479 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.258245  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3311  sodium/panthothenate symporter  24.68 
 
 		 479 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3560  sodium/panthothenate symporter  24.68 
 
 		 479 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000874922 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3261  sodium/panthothenate symporter  24.68 
 
 		 479 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0182263  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1657  sodium/panthothenate symporter  25.63 
 
 		 477 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343419 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3660  sodium/panthothenate symporter  25.63 
 
 		 477 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3570  sodium/panthothenate symporter  24.36 
 
 		 477 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3255  sodium/panthothenate symporter  25.63 
 
 		 477 aa  72  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.344037  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3321  sodium/panthothenate symporter  25.72 
 
 		 494 aa  68.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11200  sodium/panthothenate symporter  26.98 
 
 		 540 aa  68.2  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.556211  normal  0.356279 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1716  GTP-binding protein, HSR1-releated protein  25.71 
 
 		 498 aa  67.8  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.066858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2686  sodium/proline symporter  24.65 
 
 		 486 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  25.96 
 
 		 488 aa  66.6  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  23.01 
 
 		 482 aa  66.6  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0844  sodium/panthothenate symporter  21.22 
 
 		 444 aa  66.2  0.000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0552  sodium/pantothenate symporter  21.85 
 
 		 482 aa  65.5  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2845  Na+/solute symporter  20.54 
 
 		 474 aa  65.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  24.65 
 
 		 485 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2874  sodium/panthothenate symporter  26.67 
 
 		 495 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1714  sodium/panthothenate symporter  23.32 
 
 		 483 aa  63.5  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000601067 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2927  Na+/solute symporter  25.88 
 
 		 491 aa  63.5  0.000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  24.93 
 
 		 482 aa  63.5  0.000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2265  sodium/proline symporter  25.35 
 
 		 494 aa  63.2  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0457  sodium/proline symporter  19.05 
 
 		 492 aa  62.8  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2039  proline permease  25.35 
 
 		 494 aa  63.2  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.241899 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2367  sodium/proline symporter  25.35 
 
 		 494 aa  63.2  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0234397  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  24.17 
 
 		 484 aa  61.2  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2974  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.43 
 
 		 478 aa  61.2  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.154355 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2608  sodium/proline symporter  25.73 
 
 		 483 aa  61.2  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0498264  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1901  sodium/panthothenate symporter  28.1 
 
 		 512 aa  60.5  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000150828 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1326  Sodium/proline symporter  22.44 
 
 		 488 aa  60.8  0.00000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0529188  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  24.62 
 
 		 493 aa  60.5  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0507  Na+/solute symporter  24.7 
 
 		 519 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.550362  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5016  proline permease  24.63 
 
 		 495 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2627  sodium/proline symporter  24.22 
 
 		 502 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.516748  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4946  sodium/proline symporter  25.83 
 
 		 492 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1253  sodium/proline symporter  24.79 
 
 		 502 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.325594 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4018  sodium/proline symporter  23.19 
 
 		 494 aa  58.9  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0453  Sodium/proline symporter  26.05 
 
 		 494 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04650  sodium/panthothenate symporter  25 
 
 		 496 aa  59.3  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00393427  hitchhiker  0.0000895838 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04170  sodium/proline symporter  26.27 
 
 		 499 aa  58.9  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0302673 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2469  sodium/proline symporter  24.93 
 
 		 497 aa  58.5  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00121427  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4818  sodium/proline symporter  25.83 
 
 		 492 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.88778  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>