More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1063 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1063  hypothetical protein  100 
 
 		 526 aa  1039    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.771513 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1134  Na+/solute symporter  60.08 
 
 		 527 aa  619  1e-176  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2326  Na+/solute symporter  61.39 
 
 		 520 aa  617  1e-175  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0425  Na+/solute symporter  52.2 
 
 		 530 aa  498  1e-139  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3721  sodium:proline symporter (proline permease)  50 
 
 		 553 aa  487  1e-136  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1706  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  49.9 
 
 		 533 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1002  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  47.98 
 
 		 533 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0975  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  49.14 
 
 		 533 aa  465  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0971  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  48.94 
 
 		 533 aa  465  1e-129  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0468  Na+/solute symporter  49.8 
 
 		 528 aa  465  1e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.280127  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0036  Na+ symporter  48.02 
 
 		 537 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.90526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1847  Na+/solute symporter  47.7 
 
 		 543 aa  409  1e-113  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.145671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1337  sodium/proline symporter (proline permease)  46.88 
 
 		 531 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0034  Na+/solute symporter  45.12 
 
 		 543 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.404882  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0037  Na+/solute symporter  44.92 
 
 		 543 aa  395  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0049  Na+/solute symporter  44.92 
 
 		 543 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3191  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.57 
 
 		 504 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.205305  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3090  Na+/solute symporter  30.44 
 
 		 508 aa  162  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000664536  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1759  Na+ symporter  29.61 
 
 		 531 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0735  Na+/solute symporter  28.92 
 
 		 489 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0408  Na+/proline symporter-like protein  48.94 
 
 		 377 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1220  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.18 
 
 		 489 aa  146  1e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1464  Na+/solute symporter  28.13 
 
 		 489 aa  145  2e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.675757  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0612  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.31 
 
 		 503 aa  134  5e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000214976  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0068  Na+/solute symporter  29.5 
 
 		 512 aa  132  1.0000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3645  sodium/panthothenate symporter  29.37 
 
 		 483 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060524 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3641  sodium/panthothenate symporter  29.1 
 
 		 483 aa  127  5e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000698464  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3553  sodium/panthothenate symporter  29.1 
 
 		 483 aa  127  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000280994  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03116  sodium/panthothenate symporter  28.84 
 
 		 483 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.735141  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0448  sodium/pantothenate symporter  28.84 
 
 		 483 aa  125  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.293948  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3742  sodium/panthothenate symporter  28.84 
 
 		 483 aa  125  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150129  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1291  Na+/solute symporter  26.69 
 
 		 481 aa  126  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4575  sodium/panthothenate symporter  28.84 
 
 		 483 aa  125  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000690231  normal  0.130163 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2279  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.94 
 
 		 504 aa  126  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.257788  hitchhiker  0.0000218485 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0448  sodium/panthothenate symporter  28.84 
 
 		 483 aa  125  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.024979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4147  sodium/proline symporter  27.45 
 
 		 497 aa  126  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03067  hypothetical protein  28.84 
 
 		 483 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.647307  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3573  sodium/panthothenate symporter  29.1 
 
 		 483 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0131777  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0171  sodium/proline symporter  27.9 
 
 		 496 aa  126  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3450  sodium/panthothenate symporter  28.84 
 
 		 483 aa  125  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000724112  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4420  sodium/panthothenate symporter  29.41 
 
 		 481 aa  126  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0607009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  28.09 
 
 		 485 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3574  sodium/panthothenate symporter  28.84 
 
 		 483 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3742  sodium/panthothenate symporter  29.1 
 
 		 483 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.133198 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3680  sodium/panthothenate symporter  28.84 
 
 		 483 aa  125  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.433126 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01330  Na+/proline symporter  29.71 
 
 		 525 aa  124  3e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  27.11 
 
 		 518 aa  124  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0389  sodium/panthothenate symporter  27.75 
 
 		 484 aa  123  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00229851  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1209  sodium/panthothenate symporter  27.75 
 
 		 484 aa  123  8e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00169799  normal  0.818802 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0455  sodium/panthothenate symporter  27.75 
 
 		 484 aa  123  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02712  proline/sodium symporter  27.98 
 
 		 493 aa  121  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.076903  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1576  Sodium/proline symporter  31.75 
 
 		 499 aa  120  6e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.84214  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  25.96 
 
 		 492 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1415  SSS family Na(+)/proline symporter  31.43 
 
 		 499 aa  119  9.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.631202 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3686  sodium/panthothenate symporter  26.25 
 
 		 483 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.925299  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3490  sodium/proline symporter  28.73 
 
 		 498 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.753009  normal  0.0181041 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  25.8 
 
 		 492 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  25.8 
 
 		 492 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  25.8 
 
 		 492 aa  117  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  25.8 
 
 		 492 aa  117  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  25.8 
 
 		 492 aa  117  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  26.1 
 
 		 483 aa  117  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  25.8 
 
 		 492 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  26.74 
 
 		 492 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1653  sodium/proline symporter  27.24 
 
 		 511 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  26.55 
 
 		 492 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29910  sodium/proline symporter  28.81 
 
 		 520 aa  116  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  25.64 
 
 		 483 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  26.7 
 
 		 484 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1957  high affinity proline permease  27.97 
 
 		 512 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1991  high affinity proline permease  27.97 
 
 		 512 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1156  sodium/proline symporter  28 
 
 		 486 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.307204  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  26.8 
 
 		 492 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01675  proline/sodium symporter  25.1 
 
 		 504 aa  115  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.068924  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1379  sodium/panthothenate symporter  28.3 
 
 		 492 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0385274  normal  0.372154 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2227  sodium/panthothenate symporter  27.72 
 
 		 477 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0585956  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1939  sodium/proline symporter  27.1 
 
 		 498 aa  114  5e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3844  sodium/panthothenate symporter  26.58 
 
 		 483 aa  114  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325661  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  26.48 
 
 		 497 aa  113  7.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  25.65 
 
 		 492 aa  113  9e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  23.19 
 
 		 492 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  23.76 
 
 		 492 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  23.89 
 
 		 492 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  24.14 
 
 		 492 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  25.43 
 
 		 492 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  25.74 
 
 		 492 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1440  proline permease  26.23 
 
 		 511 aa  112  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0406998  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3463  proline/sodium symporter  25.55 
 
 		 495 aa  112  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0567  sodium/panthothenate symporter  27.13 
 
 		 480 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.868181  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2627  sodium/proline symporter  26.19 
 
 		 502 aa  111  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.516748  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  23.89 
 
 		 493 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  23.89 
 
 		 493 aa  111  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0244  sodium/panthothenate symporter  27.73 
 
 		 483 aa  111  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  23.89 
 
 		 493 aa  111  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  23.89 
 
 		 492 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  23.89 
 
 		 492 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4063  sodium/proline symporter  28.72 
 
 		 497 aa  111  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3408  sodium/proline symporter  28.72 
 
 		 497 aa  111  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.704891  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0240  sodium/panthothenate symporter  27.73 
 
 		 483 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2670  sodium/proline symporter  30.28 
 
 		 541 aa  111  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>