More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1337 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1337  sodium/proline symporter (proline permease)  100 
 
 		 531 aa  1059    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1847  Na+/solute symporter  67.05 
 
 		 543 aa  679    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.145671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0425  Na+/solute symporter  51.81 
 
 		 530 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0468  Na+/solute symporter  51.66 
 
 		 528 aa  498  1e-139  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.280127  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1002  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  49.15 
 
 		 533 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0971  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  50.28 
 
 		 533 aa  489  1e-137  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1706  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  49.91 
 
 		 533 aa  487  1e-136  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0975  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  49.72 
 
 		 533 aa  487  1e-136  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0036  Na+ symporter  49.72 
 
 		 537 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.90526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3721  sodium:proline symporter (proline permease)  47.9 
 
 		 553 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1134  Na+/solute symporter  50.99 
 
 		 527 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2326  Na+/solute symporter  48.07 
 
 		 520 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0049  Na+/solute symporter  51.17 
 
 		 543 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0034  Na+/solute symporter  50.67 
 
 		 543 aa  449  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.404882  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0037  Na+/solute symporter  51.17 
 
 		 543 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1063  hypothetical protein  47.89 
 
 		 526 aa  389  1e-107  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.771513 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3191  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.21 
 
 		 504 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.205305  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0408  Na+/proline symporter-like protein  52.91 
 
 		 377 aa  160  7e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3090  Na+/solute symporter  26.91 
 
 		 508 aa  159  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000664536  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0612  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.85 
 
 		 503 aa  154  5e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000214976  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1220  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.54 
 
 		 489 aa  146  1e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  25.62 
 
 		 492 aa  144  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  28.17 
 
 		 485 aa  143  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0735  Na+/solute symporter  25.38 
 
 		 489 aa  143  6e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1464  Na+/solute symporter  25.05 
 
 		 489 aa  143  7e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.675757  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  28.17 
 
 		 484 aa  143  9e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  25.62 
 
 		 492 aa  143  9e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  25.62 
 
 		 492 aa  143  9e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  25.62 
 
 		 492 aa  143  9e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  25.43 
 
 		 492 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  27.31 
 
 		 492 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  25.43 
 
 		 492 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  26.14 
 
 		 492 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1759  Na+ symporter  28.95 
 
 		 531 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2279  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.34 
 
 		 504 aa  138  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.257788  hitchhiker  0.0000218485 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  26.77 
 
 		 492 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  26.82 
 
 		 488 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  27.1 
 
 		 492 aa  134  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1242  sodium/proline symporter  27.13 
 
 		 491 aa  131  4.0000000000000003e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1291  Na+/solute symporter  26.83 
 
 		 481 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54150  sodium/proline symporter PutP  26.41 
 
 		 506 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4736  sodium/proline symporter PutP  26.41 
 
 		 506 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  30.3 
 
 		 518 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0416  sodium/proline symporter  26.95 
 
 		 495 aa  128  3e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.292846  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0457  sodium/proline symporter  24.66 
 
 		 492 aa  125  2e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4843  SSS sodium solute transporter superfamily  27.29 
 
 		 544 aa  125  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  24.73 
 
 		 492 aa  125  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1854  sodium/proline permease  25.11 
 
 		 489 aa  125  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.794377  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  27.03 
 
 		 482 aa  124  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  28.39 
 
 		 493 aa  124  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1494  sodium/proline permease  25.78 
 
 		 489 aa  123  8e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.858456  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1675  sodium/proline permease  25.11 
 
 		 489 aa  123  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0491  sodium/proline symporter  26.98 
 
 		 495 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  23.8 
 
 		 492 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  26.44 
 
 		 493 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  24.18 
 
 		 492 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  23.8 
 
 		 487 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1250  sodium/proline symporter  26.32 
 
 		 496 aa  120  6e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  24.4 
 
 		 492 aa  120  7e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  24.4 
 
 		 493 aa  120  7e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  24.4 
 
 		 493 aa  120  7e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  24.4 
 
 		 493 aa  120  7e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  29.38 
 
 		 497 aa  120  7e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1957  high affinity proline permease  25.74 
 
 		 512 aa  120  7e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  24.4 
 
 		 492 aa  120  7e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1991  high affinity proline permease  25.74 
 
 		 512 aa  120  7e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  29.57 
 
 		 483 aa  120  7.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1326  Sodium/proline symporter  26.1 
 
 		 488 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0529188  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  26.98 
 
 		 482 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  24.18 
 
 		 492 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3686  sodium/panthothenate symporter  27.79 
 
 		 483 aa  118  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.925299  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3766  sodium/proline symporter  25.78 
 
 		 499 aa  118  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.525061  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0455  sodium/panthothenate symporter  29.15 
 
 		 484 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1209  sodium/panthothenate symporter  29.15 
 
 		 484 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00169799  normal  0.818802 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0389  sodium/panthothenate symporter  29.15 
 
 		 484 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00229851  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4420  sodium/panthothenate symporter  28.76 
 
 		 481 aa  117  6.9999999999999995e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0607009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11200  sodium/panthothenate symporter  27.59 
 
 		 540 aa  116  7.999999999999999e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.556211  normal  0.356279 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0453  Sodium/proline symporter  24.62 
 
 		 494 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  24.18 
 
 		 492 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0171  sodium/proline symporter  29.82 
 
 		 496 aa  116  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02712  proline/sodium symporter  26.4 
 
 		 493 aa  116  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.076903  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1440  proline permease  26.12 
 
 		 511 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0406998  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04170  sodium/proline symporter  27.92 
 
 		 499 aa  115  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0302673 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01330  Na+/proline symporter  24.78 
 
 		 525 aa  115  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4063  sodium/proline symporter  27.25 
 
 		 497 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3408  sodium/proline symporter  27.25 
 
 		 497 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.704891  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1542  sodium/proline symporter  26.13 
 
 		 502 aa  114  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.13082 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3255  sodium/panthothenate symporter  28.02 
 
 		 477 aa  114  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.344037  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0148  sodium/proline symporter  24.89 
 
 		 499 aa  114  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.720955  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1229  sodium/proline symporter  25.31 
 
 		 504 aa  113  7.000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3553  sodium/panthothenate symporter  27.52 
 
 		 483 aa  113  8.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000280994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05510  SSS sodium solute transporter  25.93 
 
 		 536 aa  113  9e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3641  sodium/panthothenate symporter  27.52 
 
 		 483 aa  113  9e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000698464  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1379  sodium/panthothenate symporter  28.35 
 
 		 492 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0385274  normal  0.372154 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3560  sodium/panthothenate symporter  27.82 
 
 		 479 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000874922 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3346  sodium/panthothenate symporter  27.82 
 
 		 479 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000197319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3311  sodium/panthothenate symporter  27.82 
 
 		 479 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3261  sodium/panthothenate symporter  27.82 
 
 		 479 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0182263  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3607  sodium/panthothenate symporter  27.82 
 
 		 479 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.258245  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0068  Na+/solute symporter  25.33 
 
 		 512 aa  113  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>