More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3090 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3090  Na+/solute symporter  100 
 
 		 508 aa  1008    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000664536  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01330  Na+/proline symporter  60.24 
 
 		 525 aa  536  1e-151  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0068  Na+/solute symporter  59.55 
 
 		 512 aa  536  1e-151  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0612  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  48.94 
 
 		 503 aa  448  1.0000000000000001e-124  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000214976  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3191  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  44.83 
 
 		 504 aa  411  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.205305  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2279  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  43.5 
 
 		 504 aa  383  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.257788  hitchhiker  0.0000218485 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0735  Na+/solute symporter  38.91 
 
 		 489 aa  349  6e-95  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1464  Na+/solute symporter  39.8 
 
 		 489 aa  349  7e-95  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.675757  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1220  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  40.99 
 
 		 489 aa  348  2e-94  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1759  Na+ symporter  40.52 
 
 		 531 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  27.02 
 
 		 497 aa  168  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  28.22 
 
 		 518 aa  167  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0425  Na+/solute symporter  29.62 
 
 		 530 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3490  sodium/proline symporter  28.08 
 
 		 498 aa  163  5.0000000000000005e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.753009  normal  0.0181041 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1081  sodium/proline symporter  29.16 
 
 		 498 aa  162  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000772394  unclonable  0.00000000000701401 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  26.98 
 
 		 493 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  26.98 
 
 		 492 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  27.38 
 
 		 492 aa  161  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1653  sodium/proline symporter  28.18 
 
 		 511 aa  161  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1242  sodium/proline symporter  27.12 
 
 		 491 aa  161  3e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1440  proline permease  29.94 
 
 		 511 aa  160  4e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0406998  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  26.79 
 
 		 492 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02712  proline/sodium symporter  27.93 
 
 		 493 aa  160  4e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.076903  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  26.79 
 
 		 493 aa  160  5e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  26.79 
 
 		 493 aa  160  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  27.22 
 
 		 492 aa  160  7e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  26.53 
 
 		 492 aa  159  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0171  sodium/proline symporter  26.99 
 
 		 496 aa  158  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  26.33 
 
 		 487 aa  158  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1250  sodium/proline symporter  29.08 
 
 		 496 aa  157  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3721  sodium:proline symporter (proline permease)  26.43 
 
 		 553 aa  157  4e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1002  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.23 
 
 		 533 aa  157  4e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  26.34 
 
 		 492 aa  157  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05510  SSS sodium solute transporter  27.53 
 
 		 536 aa  156  7e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1991  high affinity proline permease  29.25 
 
 		 512 aa  156  7e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1957  high affinity proline permease  29.25 
 
 		 512 aa  156  7e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3463  proline/sodium symporter  28.02 
 
 		 495 aa  156  9e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  27.2 
 
 		 492 aa  156  9e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  26.24 
 
 		 493 aa  155  1e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1326  Sodium/proline symporter  29.12 
 
 		 488 aa  156  1e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0529188  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1396  Na+/proline symporter  26.2 
 
 		 553 aa  155  2e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  26.34 
 
 		 492 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1716  GTP-binding protein, HSR1-releated protein  30.07 
 
 		 498 aa  154  4e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.066858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  27.79 
 
 		 483 aa  154  5e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1847  Na+/solute symporter  28.19 
 
 		 543 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.145671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54150  sodium/proline symporter PutP  27.19 
 
 		 506 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1134  Na+/solute symporter  27.25 
 
 		 527 aa  153  8e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0148  sodium/proline symporter  27.64 
 
 		 499 aa  152  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.720955  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1542  sodium/proline symporter  27.52 
 
 		 502 aa  152  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.13082 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  27.37 
 
 		 488 aa  152  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  27.59 
 
 		 483 aa  152  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  26.68 
 
 		 493 aa  152  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  27 
 
 		 492 aa  152  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  27.54 
 
 		 492 aa  152  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  27.54 
 
 		 492 aa  152  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1113  SSS sodium solute transporter superfamily  26.14 
 
 		 529 aa  152  2e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00736856  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  26.57 
 
 		 492 aa  151  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4736  sodium/proline symporter PutP  27.56 
 
 		 506 aa  152  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  27.54 
 
 		 492 aa  152  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2326  Na+/solute symporter  26.55 
 
 		 520 aa  152  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  27.54 
 
 		 492 aa  152  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  27.54 
 
 		 492 aa  152  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0522  sodium/proline symporter  26.74 
 
 		 492 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550728  normal  0.0854838 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4995  sodium/proline symporter  25.78 
 
 		 492 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  27.13 
 
 		 513 aa  150  7e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0036  Na+ symporter  25.89 
 
 		 537 aa  148  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.90526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1706  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.29 
 
 		 533 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0273  sodium/proline symporter  27.89 
 
 		 504 aa  147  4.0000000000000006e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3553  sodium/panthothenate symporter  26.89 
 
 		 483 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000280994  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4946  sodium/proline symporter  25.94 
 
 		 492 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0453  Sodium/proline symporter  27.19 
 
 		 494 aa  147  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03116  sodium/panthothenate symporter  26.89 
 
 		 483 aa  147  6e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.735141  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0448  sodium/pantothenate symporter  26.89 
 
 		 483 aa  147  6e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.293948  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4575  sodium/panthothenate symporter  26.89 
 
 		 483 aa  147  6e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000690231  normal  0.130163 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3742  sodium/panthothenate symporter  26.89 
 
 		 483 aa  147  6e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150129  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0448  sodium/panthothenate symporter  26.89 
 
 		 483 aa  147  6e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.024979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3450  sodium/panthothenate symporter  26.89 
 
 		 483 aa  147  6e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000724112  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03067  hypothetical protein  26.89 
 
 		 483 aa  147  6e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.647307  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3641  sodium/panthothenate symporter  26.89 
 
 		 483 aa  147  6e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000698464  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3680  sodium/panthothenate symporter  27.37 
 
 		 483 aa  146  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.433126 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4818  sodium/proline symporter  25.72 
 
 		 492 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.88778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4018  sodium/proline symporter  27.23 
 
 		 494 aa  146  9e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3574  sodium/panthothenate symporter  27.37 
 
 		 483 aa  146  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3573  sodium/panthothenate symporter  27.37 
 
 		 483 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0131777  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3742  sodium/panthothenate symporter  27.37 
 
 		 483 aa  146  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.133198 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  26.72 
 
 		 485 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0817  proline permease  27.58 
 
 		 498 aa  145  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1156  sodium/proline symporter  28.11 
 
 		 486 aa  145  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.307204  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0975  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.07 
 
 		 533 aa  145  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3645  sodium/panthothenate symporter  27.37 
 
 		 483 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060524 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  27.52 
 
 		 492 aa  145  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  27.48 
 
 		 488 aa  145  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2608  sodium/proline symporter  26.3 
 
 		 483 aa  145  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0498264  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5016  proline permease  27.11 
 
 		 495 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1415  SSS family Na(+)/proline symporter  28.44 
 
 		 499 aa  144  3e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.631202 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0389  sodium/panthothenate symporter  27.46 
 
 		 484 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00229851  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1209  sodium/panthothenate symporter  27.46 
 
 		 484 aa  144  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00169799  normal  0.818802 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0455  sodium/panthothenate symporter  27.46 
 
 		 484 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2930  sodium/proline symporter  25.74 
 
 		 494 aa  144  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0527151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1063  hypothetical protein  31.71 
 
 		 526 aa  144  4e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.771513 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>