More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1650 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  73.24 
 
 		 487 aa  679    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  100 
 
 		 483 aa  968    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1817  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  54.04 
 
 		 484 aa  503  1e-141  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  30.33 
 
 		 479 aa  180  4.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  31.24 
 
 		 459 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  31 
 
 		 459 aa  177  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  30.54 
 
 		 463 aa  176  8e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  30.73 
 
 		 463 aa  176  9e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  29.79 
 
 		 461 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  31.47 
 
 		 459 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  30.18 
 
 		 459 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  31.09 
 
 		 459 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  29.57 
 
 		 461 aa  172  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  31.26 
 
 		 500 aa  169  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  30 
 
 		 462 aa  166  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  27.06 
 
 		 472 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  27.24 
 
 		 483 aa  153  5e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.28 
 
 		 533 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2906  Na+/solute symporter  27.06 
 
 		 463 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  27.98 
 
 		 476 aa  146  8.000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1620  Na+/solute symporter  26.75 
 
 		 460 aa  146  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0163738 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0367  Na+/solute symporter  28.48 
 
 		 446 aa  144  3e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.101074  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  29.64 
 
 		 460 aa  144  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0041  sodium/pantothenate symporter  28.75 
 
 		 468 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.3030600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  27.78 
 
 		 551 aa  139  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0924  twin-arginine translocation pathway signal  28.75 
 
 		 452 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.839391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0964  Na+/solute symporter  25.15 
 
 		 508 aa  136  9e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  25.48 
 
 		 483 aa  135  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1716  GTP-binding protein, HSR1-releated protein  30.2 
 
 		 498 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.066858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.74 
 
 		 526 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1081  sodium/proline symporter  27.79 
 
 		 498 aa  134  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000772394  unclonable  0.00000000000701401 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  27.99 
 
 		 509 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  28.05 
 
 		 492 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  27.85 
 
 		 492 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  27.91 
 
 		 492 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  27.85 
 
 		 492 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  27.85 
 
 		 492 aa  131  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  27.85 
 
 		 492 aa  131  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  27.85 
 
 		 492 aa  131  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  27.68 
 
 		 492 aa  130  6e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  25.62 
 
 		 518 aa  130  7.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  26.83 
 
 		 492 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  28.16 
 
 		 492 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  28.07 
 
 		 488 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0846  Na+/solute symporter  24.55 
 
 		 507 aa  128  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  26.29 
 
 		 493 aa  127  3e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2710  Na+/solute symporter  28.81 
 
 		 462 aa  127  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.308556  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  26.15 
 
 		 486 aa  126  7e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4206  Na+/solute symporter  24.9 
 
 		 490 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153775  normal  0.0109856 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0416  sodium/proline symporter  26.78 
 
 		 495 aa  124  4e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.292846  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  24.62 
 
 		 474 aa  123  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  27.81 
 
 		 484 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  25.93 
 
 		 493 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  25.93 
 
 		 493 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  25.93 
 
 		 492 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  28.38 
 
 		 557 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  25.73 
 
 		 493 aa  121  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  25.73 
 
 		 492 aa  121  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.99 
 
 		 522 aa  121  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  25.1 
 
 		 492 aa  121  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  25.31 
 
 		 487 aa  121  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  25.31 
 
 		 492 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1242  sodium/proline symporter  26.65 
 
 		 491 aa  120  3.9999999999999996e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  27.24 
 
 		 557 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  28.99 
 
 		 492 aa  120  6e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0457  sodium/proline symporter  27.15 
 
 		 492 aa  120  7e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  26.06 
 
 		 523 aa  120  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  27.38 
 
 		 492 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  27.45 
 
 		 492 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  27.51 
 
 		 506 aa  119  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  24.1 
 
 		 497 aa  119  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3490  sodium/proline symporter  27.44 
 
 		 498 aa  119  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.753009  normal  0.0181041 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.07 
 
 		 520 aa  118  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  26.22 
 
 		 482 aa  118  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  24.74 
 
 		 492 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3463  proline/sodium symporter  24.7 
 
 		 495 aa  117  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1854  sodium/proline permease  24.61 
 
 		 489 aa  117  5e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.794377  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1250  sodium/proline symporter  25.05 
 
 		 496 aa  117  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1675  sodium/proline permease  24.66 
 
 		 489 aa  117  6e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1494  sodium/proline permease  24.66 
 
 		 489 aa  117  6e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.858456  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.88 
 
 		 565 aa  117  6.9999999999999995e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1156  sodium/proline symporter  27.65 
 
 		 486 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.307204  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  25.1 
 
 		 492 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1957  high affinity proline permease  25.2 
 
 		 512 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1444  hypothetical protein  24.43 
 
 		 1170 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1991  high affinity proline permease  25.2 
 
 		 512 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  25.71 
 
 		 464 aa  114  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07840  sodium/ prolin symporter  25.45 
 
 		 544 aa  114  4.0000000000000004e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  27.27 
 
 		 485 aa  114  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1600  Na+/solute symporter  29.26 
 
 		 473 aa  114  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0101485  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  24.49 
 
 		 492 aa  114  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2974  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.06 
 
 		 478 aa  113  7.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.154355 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1248  Sodium/proline symporter  26.97 
 
 		 496 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.126391  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2686  sodium/proline symporter  26.26 
 
 		 486 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  26.39 
 
 		 488 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04170  sodium/proline symporter  26.74 
 
 		 499 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0302673 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  26.47 
 
 		 592 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1440  proline permease  24.6 
 
 		 511 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0406998  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0453  Sodium/proline symporter  25.46 
 
 		 494 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1379  sodium/panthothenate symporter  28.3 
 
 		 492 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0385274  normal  0.372154 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>