More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0575 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  100 
 
 
479 aa  913    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2906  Na+/solute symporter  61.9 
 
 
463 aa  481  1e-134  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  54.37 
 
 
461 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  54.59 
 
 
461 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  51.87 
 
 
463 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  51.21 
 
 
463 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  48.88 
 
 
459 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  47.57 
 
 
459 aa  397  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  48.88 
 
 
459 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  44.49 
 
 
472 aa  393  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  50.11 
 
 
462 aa  390  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1620  Na+/solute symporter  48.81 
 
 
460 aa  386  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0163738 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  48.56 
 
 
459 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  48.56 
 
 
459 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  45.82 
 
 
500 aa  383  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0964  Na+/solute symporter  44.91 
 
 
508 aa  375  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0846  Na+/solute symporter  46.69 
 
 
507 aa  378  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  39.74 
 
 
483 aa  323  6e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04330  Na+/proline symporter  45.19 
 
 
497 aa  323  6e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.723621  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  28.73 
 
 
483 aa  194  4e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  30.34 
 
 
474 aa  189  7e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  29.38 
 
 
483 aa  188  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  32.97 
 
 
460 aa  173  6.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  30.53 
 
 
487 aa  172  9e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  27.68 
 
 
476 aa  167  4e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1817  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.16 
 
 
484 aa  158  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0041  sodium/pantothenate symporter  31.17 
 
 
468 aa  153  8e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.3030600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  27.98 
 
 
461 aa  147  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  28.69 
 
 
482 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  28.6 
 
 
483 aa  145  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  28.6 
 
 
482 aa  144  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  27.37 
 
 
464 aa  144  4e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2710  Na+/solute symporter  27.27 
 
 
462 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.308556  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0924  twin-arginine translocation pathway signal  29.24 
 
 
452 aa  137  4e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.839391  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  28.57 
 
 
506 aa  137  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0864  hypothetical protein  27.24 
 
 
524 aa  134  5e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.983965  normal  0.0488094 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0309  Na+/solute symporter  26.73 
 
 
510 aa  131  3e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0695  Na+/solute symporter  26.36 
 
 
492 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.921144  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  26.18 
 
 
486 aa  128  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  29.18 
 
 
492 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  28.16 
 
 
479 aa  128  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5240  Na+/solute symporter  29.07 
 
 
460 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  28.69 
 
 
485 aa  127  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  27.42 
 
 
487 aa  126  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.88 
 
 
526 aa  125  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1952  Na+/solute symporter  24.14 
 
 
638 aa  124  3e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  27.71 
 
 
492 aa  124  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  28.06 
 
 
492 aa  124  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  27.22 
 
 
492 aa  123  6e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  27.22 
 
 
493 aa  123  9e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  27.02 
 
 
492 aa  123  9e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  27.02 
 
 
493 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  27.02 
 
 
493 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  27.02 
 
 
492 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3448  Na+/solute symporter  27.59 
 
 
495 aa  122  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  28.28 
 
 
492 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0718  Na+/solute symporter  26.4 
 
 
486 aa  120  6e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  27.02 
 
 
492 aa  119  9e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0122  Na+/solute symporter  26.36 
 
 
449 aa  119  9e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00309864  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  26.79 
 
 
492 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  27.56 
 
 
492 aa  118  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  26.99 
 
 
492 aa  117  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  26.79 
 
 
492 aa  117  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  26.79 
 
 
492 aa  117  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  26.99 
 
 
492 aa  117  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  26.99 
 
 
492 aa  117  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1379  sodium/panthothenate symporter  31.97 
 
 
492 aa  117  5e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0385274  normal  0.372154 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1264  sodium:proline symporter (proline permease)  25.24 
 
 
639 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  27.25 
 
 
484 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4155  Na+/solute symporter  25.87 
 
 
515 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.128874  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1178  sodium:solute symporter family protein  26.2 
 
 
585 aa  114  3e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.107894 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4206  Na+/solute symporter  27.68 
 
 
490 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153775  normal  0.0109856 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1146  Na+/solute symporter  27.13 
 
 
469 aa  114  4.0000000000000004e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.497129  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0353  Na+/solute symporter  26.77 
 
 
479 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606466  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1081  sodium/proline symporter  29.28 
 
 
498 aa  114  5e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000772394  unclonable  0.00000000000701401 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0089  Na+/solute symporter  28.37 
 
 
496 aa  113  8.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000762337  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0375  Na+/solute symporter  26.81 
 
 
478 aa  113  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.197469 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0190  Na+/solute symporter  24.35 
 
 
471 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0470055  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  27.31 
 
 
492 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0463  sodium/solute symporter transmembrane protein  26.74 
 
 
479 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4898  solute/sodium symporter (SSS) family protein  28.69 
 
 
489 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  26.6 
 
 
492 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  27.33 
 
 
483 aa  110  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1526  Na+/solute symporter  26.74 
 
 
586 aa  110  5e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0436  Na+/solute symporter  26.57 
 
 
478 aa  110  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  23.25 
 
 
500 aa  109  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2672  Na+/solute symporter  24.43 
 
 
599 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  26.88 
 
 
488 aa  108  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  26.19 
 
 
492 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0338  Na+/solute symporter  25.32 
 
 
479 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2608  sodium/proline symporter  27.14 
 
 
483 aa  107  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0498264  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0355  Na+/solute symporter  26.74 
 
 
492 aa  107  4e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  27.61 
 
 
518 aa  107  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  25.47 
 
 
492 aa  107  5e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3355  Na+/solute symporter  29.04 
 
 
517 aa  107  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1083  Na+/solute symporter  25.1 
 
 
588 aa  106  8e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0991073  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  26.75 
 
 
483 aa  106  9e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2686  sodium/proline symporter  25.87 
 
 
486 aa  106  9e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1333  Na+/solute symporter  25.45 
 
 
466 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000174463  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  27.42 
 
 
492 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>