More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3347 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  100 
 
 		 486 aa  960    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  27.21 
 
 		 474 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  28.76 
 
 		 476 aa  172  1e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  29.34 
 
 		 463 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  27.87 
 
 		 483 aa  163  6e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  28.94 
 
 		 472 aa  162  9e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  29.24 
 
 		 461 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  29.19 
 
 		 459 aa  161  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  29.83 
 
 		 463 aa  161  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  28.96 
 
 		 459 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  28.12 
 
 		 459 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  28.94 
 
 		 461 aa  157  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  28.36 
 
 		 459 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2710  Na+/solute symporter  29.15 
 
 		 462 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.308556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  29.23 
 
 		 459 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  29.78 
 
 		 500 aa  149  8e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0718  Na+/solute symporter  27.7 
 
 		 486 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  27.91 
 
 		 483 aa  148  3e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  28.5 
 
 		 462 aa  144  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1620  Na+/solute symporter  28.11 
 
 		 460 aa  143  7e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0163738 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  27.69 
 
 		 483 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  27.69 
 
 		 482 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  28.37 
 
 		 464 aa  140  7e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4206  Na+/solute symporter  27.48 
 
 		 490 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153775  normal  0.0109856 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  26.49 
 
 		 482 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  29.93 
 
 		 460 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0695  Na+/solute symporter  27.71 
 
 		 492 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.921144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4155  Na+/solute symporter  27.88 
 
 		 515 aa  133  6.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.128874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0864  hypothetical protein  27.02 
 
 		 524 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.983965  normal  0.0488094 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0190  Na+/solute symporter  26.61 
 
 		 471 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0470055  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2906  Na+/solute symporter  26.78 
 
 		 463 aa  130  6e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1525  Na+/solute symporter  27.04 
 
 		 475 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.98 
 
 		 526 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0924  twin-arginine translocation pathway signal  26.47 
 
 		 452 aa  127  5e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.839391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  28.85 
 
 		 479 aa  127  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0422  Na+/solute symporter  25.93 
 
 		 476 aa  127  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.01 
 
 		 533 aa  126  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  26.67 
 
 		 479 aa  125  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  28.54 
 
 		 500 aa  125  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1714  sodium/panthothenate symporter  27.35 
 
 		 483 aa  125  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000601067 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0338  Na+/solute symporter  25.27 
 
 		 479 aa  121  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  29.89 
 
 		 497 aa  121  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  26.98 
 
 		 483 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  28.25 
 
 		 518 aa  120  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1333  Na+/solute symporter  27.23 
 
 		 466 aa  119  9e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000174463  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  27.83 
 
 		 493 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1081  sodium/proline symporter  30.02 
 
 		 498 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000772394  unclonable  0.00000000000701401 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0964  Na+/solute symporter  26.68 
 
 		 508 aa  119  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0353  Na+/solute symporter  25.47 
 
 		 479 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1911  Na+/solute symporter  25.55 
 
 		 460 aa  118  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.504205  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2163  Na+/solute symporter  27.82 
 
 		 459 aa  118  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233045 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0846  Na+/solute symporter  26.22 
 
 		 507 aa  117  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0694  hypothetical protein  24.23 
 
 		 958 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0463  sodium/solute symporter transmembrane protein  25.34 
 
 		 479 aa  116  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  29.41 
 
 		 484 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  27.61 
 
 		 482 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1817  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.55 
 
 		 484 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0355  Na+/solute symporter  26.36 
 
 		 492 aa  114  3e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  29.61 
 
 		 492 aa  114  3e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1072  Na+/solute symporter  27.38 
 
 		 527 aa  114  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0387059  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.95 
 
 		 519 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  26.47 
 
 		 482 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5240  Na+/solute symporter  25.77 
 
 		 460 aa  113  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0436  Na+/solute symporter  24.2 
 
 		 478 aa  113  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  28.22 
 
 		 493 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  28.67 
 
 		 492 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  28.44 
 
 		 492 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0416  sodium/proline symporter  27.1 
 
 		 495 aa  113  1.0000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.292846  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  25.81 
 
 		 506 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0375  Na+/solute symporter  24.77 
 
 		 478 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197469 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  29.32 
 
 		 492 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  25.81 
 
 		 488 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1009  hypothetical protein  26.35 
 
 		 1116 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.804907 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4843  SSS sodium solute transporter superfamily  26.17 
 
 		 544 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  29.41 
 
 		 488 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  28.44 
 
 		 492 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  28.44 
 
 		 492 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  28.44 
 
 		 492 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  28.44 
 
 		 492 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  28.44 
 
 		 492 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1250  sodium/proline symporter  26.53 
 
 		 496 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  25.32 
 
 		 537 aa  111  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  23.44 
 
 		 461 aa  111  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  29.16 
 
 		 492 aa  111  3e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  28.64 
 
 		 492 aa  110  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  28.6 
 
 		 492 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1677  sodium/panthothenate symporter  27.77 
 
 		 479 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.874122  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  27.96 
 
 		 520 aa  110  8.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  28.38 
 
 		 485 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  25.39 
 
 		 509 aa  108  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  28.64 
 
 		 492 aa  109  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0309  Na+/solute symporter  26.8 
 
 		 510 aa  108  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.53 
 
 		 567 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  24.14 
 
 		 523 aa  107  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04330  Na+/proline symporter  28.6 
 
 		 497 aa  107  5e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.723621  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0449  hypothetical protein  24.95 
 
 		 1126 aa  106  7e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.812136 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0939  hypothetical protein  25.35 
 
 		 1157 aa  106  7e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.186942 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  26.79 
 
 		 487 aa  107  7e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0697  hypothetical protein  23.35 
 
 		 953 aa  106  8e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  26.84 
 
 		 492 aa  106  9e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>