More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0924 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0924  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 
452 aa  889    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.839391  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0041  sodium/pantothenate symporter  58.3 
 
 
468 aa  482  1e-135  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.3030600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1444  hypothetical protein  34.4 
 
 
1170 aa  214  2.9999999999999995e-54  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0446  hypothetical protein  32.52 
 
 
726 aa  204  4e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.722173 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0939  hypothetical protein  31.04 
 
 
1157 aa  199  9e-50  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.186942 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0449  hypothetical protein  31.45 
 
 
1126 aa  187  3e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.812136 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1009  hypothetical protein  29.18 
 
 
1116 aa  185  2.0000000000000003e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.804907 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0563  hypothetical protein  27.96 
 
 
1121 aa  181  2e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0552395 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1503  hypothetical protein  29.56 
 
 
1085 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1501  hypothetical protein  29.56 
 
 
1085 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1038  hypothetical protein  28.94 
 
 
487 aa  162  9e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0040  metal-dependent phosphohydrolase  28.92 
 
 
1109 aa  157  3e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  26.54 
 
 
472 aa  150  6e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0839  hypothetical protein  27.5 
 
 
1105 aa  144  2e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0994214 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  29.6 
 
 
483 aa  145  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1041  hypothetical protein  27.7 
 
 
485 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.880803 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0694  hypothetical protein  26.64 
 
 
958 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0927  hypothetical protein  27.76 
 
 
1156 aa  139  1e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0257155 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0697  hypothetical protein  26.95 
 
 
953 aa  138  2e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  27.53 
 
 
459 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  27.53 
 
 
459 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  26.29 
 
 
474 aa  137  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0327  hypothetical protein  28.7 
 
 
489 aa  133  5e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1743  hypothetical protein  29.93 
 
 
485 aa  133  7.999999999999999e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.60384 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  28.04 
 
 
461 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1620  Na+/solute symporter  28.16 
 
 
460 aa  132  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0163738 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0355  hypothetical protein  26 
 
 
1111 aa  130  6e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0552395 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  28.84 
 
 
459 aa  130  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  28.45 
 
 
476 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  28.91 
 
 
461 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  26.73 
 
 
462 aa  125  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  28.97 
 
 
479 aa  125  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  26.97 
 
 
463 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  27.36 
 
 
463 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  28.75 
 
 
483 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2710  Na+/solute symporter  26.67 
 
 
462 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.308556  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  28 
 
 
459 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  28.27 
 
 
459 aa  121  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  25.25 
 
 
483 aa  119  9e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  26.3 
 
 
486 aa  119  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1146  Na+/solute symporter  26.99 
 
 
469 aa  119  9.999999999999999e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.497129  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  28.67 
 
 
487 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  26.36 
 
 
482 aa  117  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4206  Na+/solute symporter  27.55 
 
 
490 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153775  normal  0.0109856 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  27.59 
 
 
500 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2906  Na+/solute symporter  26.68 
 
 
463 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  24.95 
 
 
464 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4155  Na+/solute symporter  27.7 
 
 
515 aa  107  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.128874  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1817  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.16 
 
 
484 aa  107  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0463  sodium/solute symporter transmembrane protein  26.56 
 
 
479 aa  106  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0353  Na+/solute symporter  26.56 
 
 
479 aa  106  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606466  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  25.11 
 
 
493 aa  106  8e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0375  Na+/solute symporter  26.56 
 
 
478 aa  105  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.197469 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  27.99 
 
 
492 aa  104  3e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  25.29 
 
 
483 aa  104  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  27.48 
 
 
483 aa  104  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  25.23 
 
 
482 aa  104  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  24.78 
 
 
485 aa  104  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0436  Na+/solute symporter  25.27 
 
 
478 aa  103  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0190  Na+/solute symporter  26.68 
 
 
471 aa  103  5e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0470055  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  27.99 
 
 
492 aa  103  8e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  28.19 
 
 
492 aa  103  9e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0338  Na+/solute symporter  25.95 
 
 
479 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0718  Na+/solute symporter  26.51 
 
 
486 aa  102  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  26.22 
 
 
479 aa  101  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0964  Na+/solute symporter  26.16 
 
 
508 aa  100  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.75 
 
 
533 aa  99.8  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  24.24 
 
 
482 aa  99.4  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  29.52 
 
 
530 aa  98.6  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  27.48 
 
 
483 aa  97.4  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0695  Na+/solute symporter  25.46 
 
 
492 aa  97.1  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.921144  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  26.43 
 
 
482 aa  97.1  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  24.6 
 
 
492 aa  96.7  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1081  sodium/proline symporter  25.11 
 
 
498 aa  96.7  8e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000772394  unclonable  0.00000000000701401 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  24.67 
 
 
484 aa  95.5  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  24.49 
 
 
492 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3085  sodium/proline symporter  24.06 
 
 
484 aa  94.7  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.198592 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0846  Na+/solute symporter  26.09 
 
 
507 aa  94.7  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  24.09 
 
 
492 aa  94  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  26.56 
 
 
488 aa  94  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1250  sodium/proline symporter  26.53 
 
 
496 aa  94  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  27.56 
 
 
551 aa  94  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  24.09 
 
 
492 aa  94  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  24.09 
 
 
492 aa  93.6  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  24.09 
 
 
492 aa  94  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  24.09 
 
 
492 aa  94  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  24.09 
 
 
492 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2608  sodium/proline symporter  26.32 
 
 
483 aa  93.6  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0498264  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4946  sodium/proline symporter  25 
 
 
492 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  24.09 
 
 
492 aa  93.2  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0522  sodium/proline symporter  24.78 
 
 
492 aa  93.2  9e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550728  normal  0.0854838 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1333  Na+/solute symporter  25.9 
 
 
466 aa  92.8  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000174463  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  24.37 
 
 
492 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.24 
 
 
526 aa  92.8  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  23.68 
 
 
493 aa  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  23.68 
 
 
493 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  23.68 
 
 
492 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  23.46 
 
 
492 aa  92  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  23.68 
 
 
492 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  24.14 
 
 
492 aa  92  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.286578 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>