More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1796 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  100 
 
 		 483 aa  951    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  46.88 
 
 		 476 aa  420  1e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  43.84 
 
 		 474 aa  350  4e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  31.01 
 
 		 462 aa  194  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  25.47 
 
 		 472 aa  190  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  30.3 
 
 		 459 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  30.3 
 
 		 459 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  29.14 
 
 		 459 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  29.55 
 
 		 459 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0846  Na+/solute symporter  29.92 
 
 		 507 aa  180  4.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  29.09 
 
 		 463 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  29.35 
 
 		 459 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  28.57 
 
 		 461 aa  177  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  28.96 
 
 		 463 aa  177  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0964  Na+/solute symporter  30.36 
 
 		 508 aa  176  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  28.42 
 
 		 479 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  28.48 
 
 		 500 aa  173  5.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  29.1 
 
 		 461 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2906  Na+/solute symporter  28.94 
 
 		 463 aa  162  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  27.65 
 
 		 486 aa  159  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  26.46 
 
 		 483 aa  159  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  28.21 
 
 		 482 aa  158  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  27.92 
 
 		 483 aa  155  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  28.15 
 
 		 482 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  28.77 
 
 		 479 aa  154  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1620  Na+/solute symporter  27.6 
 
 		 460 aa  152  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0163738 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2710  Na+/solute symporter  28.63 
 
 		 462 aa  149  9e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.308556  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04330  Na+/proline symporter  29.18 
 
 		 497 aa  148  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.723621  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  25.11 
 
 		 461 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0718  Na+/solute symporter  25.7 
 
 		 486 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  31.33 
 
 		 460 aa  146  8.000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0864  hypothetical protein  27.67 
 
 		 524 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.983965  normal  0.0488094 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  28.54 
 
 		 518 aa  138  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1525  Na+/solute symporter  27.79 
 
 		 475 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  28.36 
 
 		 488 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  28.18 
 
 		 497 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  26.65 
 
 		 483 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  26.33 
 
 		 464 aa  134  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  26 
 
 		 493 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1250  sodium/proline symporter  27.33 
 
 		 496 aa  134  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2608  sodium/proline symporter  27.97 
 
 		 483 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0498264  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  27.24 
 
 		 483 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  26.21 
 
 		 483 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  27.17 
 
 		 500 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4155  Na+/solute symporter  26.36 
 
 		 515 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.128874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0309  Na+/solute symporter  25.88 
 
 		 510 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0122  Na+/solute symporter  24.55 
 
 		 449 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00309864  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1264  sodium:proline symporter (proline permease)  28.21 
 
 		 639 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3448  Na+/solute symporter  25.95 
 
 		 495 aa  127  4.0000000000000003e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2137  SSS sodium solute transporter superfamily  24.8 
 
 		 528 aa  127  5e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00565072  normal  0.610314 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3490  sodium/proline symporter  27.4 
 
 		 498 aa  127  5e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.753009  normal  0.0181041 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  26.18 
 
 		 513 aa  126  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5240  Na+/solute symporter  23.5 
 
 		 460 aa  126  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0463  sodium/solute symporter transmembrane protein  25.23 
 
 		 479 aa  125  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0924  twin-arginine translocation pathway signal  25.67 
 
 		 452 aa  125  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.839391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0171  sodium/proline symporter  27.71 
 
 		 496 aa  125  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  25.72 
 
 		 482 aa  125  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0695  Na+/solute symporter  26.11 
 
 		 492 aa  124  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.921144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2686  sodium/proline symporter  26.39 
 
 		 486 aa  124  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  26 
 
 		 483 aa  124  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1817  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.55 
 
 		 484 aa  124  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0375  Na+/solute symporter  26.5 
 
 		 478 aa  124  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197469 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0552  sodium/pantothenate symporter  25.77 
 
 		 482 aa  123  7e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0353  Na+/solute symporter  24.55 
 
 		 479 aa  123  9e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  24.95 
 
 		 487 aa  123  9e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1333  Na+/solute symporter  26.43 
 
 		 466 aa  121  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000174463  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1081  sodium/proline symporter  26.89 
 
 		 498 aa  121  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000772394  unclonable  0.00000000000701401 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2790  sodium/proline symporter  26.75 
 
 		 483 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276408  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1588  sodium/proline symporter  26.75 
 
 		 483 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000493204  unclonable  0.00000000000453194 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3721  sodium:proline symporter (proline permease)  24.81 
 
 		 553 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1952  Na+/solute symporter  26.71 
 
 		 638 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0190  Na+/solute symporter  24.1 
 
 		 471 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0470055  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2770  sodium/proline symporter  26.75 
 
 		 483 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000703765  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2865  sodium/proline symporter  26.8 
 
 		 483 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.468907 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1575  Sodium/proline symporter  25.16 
 
 		 498 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0675536  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4843  SSS sodium solute transporter superfamily  27.62 
 
 		 544 aa  120  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1379  sodium/panthothenate symporter  26.8 
 
 		 492 aa  120  6e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0385274  normal  0.372154 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0367  Na+/solute symporter  27.69 
 
 		 446 aa  120  7e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.101074  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0436  Na+/solute symporter  25.61 
 
 		 478 aa  120  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  25.1 
 
 		 506 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2163  Na+/solute symporter  25.59 
 
 		 459 aa  119  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233045 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2469  sodium/proline symporter  25.55 
 
 		 497 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00121427  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  24.73 
 
 		 482 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0089  Na+/solute symporter  26.45 
 
 		 496 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000762337  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1396  Na+/proline symporter  24.66 
 
 		 553 aa  117  5e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1716  GTP-binding protein, HSR1-releated protein  25.67 
 
 		 498 aa  117  5e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.066858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0041  sodium/pantothenate symporter  26.98 
 
 		 468 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.3030600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3463  proline/sodium symporter  25.97 
 
 		 495 aa  116  8.999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  23.55 
 
 		 492 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1653  sodium/proline symporter  23.2 
 
 		 511 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1463  sodium/proline symporter  25.2 
 
 		 483 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.169082  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  23.92 
 
 		 484 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0338  Na+/solute symporter  23.67 
 
 		 479 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0422  Na+/solute symporter  25.06 
 
 		 476 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  24.24 
 
 		 485 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  24.81 
 
 		 530 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1398  sodium/proline symporter  25.26 
 
 		 483 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0934266  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  24.1 
 
 		 492 aa  114  3e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1451  sodium/proline symporter  24.35 
 
 		 483 aa  113  6e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0423407  unclonable  0.000000000084673 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0355  Na+/solute symporter  25.06 
 
 		 492 aa  113  7.000000000000001e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>