More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3406 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  100 
 
 		 461 aa  924    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5240  Na+/solute symporter  59.82 
 
 		 460 aa  538  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  41.16 
 
 		 483 aa  365  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  41.18 
 
 		 482 aa  364  1e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0190  Na+/solute symporter  41.1 
 
 		 471 aa  363  4e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0470055  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0718  Na+/solute symporter  42.07 
 
 		 486 aa  358  9e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0463  sodium/solute symporter transmembrane protein  39.32 
 
 		 479 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0353  Na+/solute symporter  40.35 
 
 		 479 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  40.26 
 
 		 482 aa  356  5.999999999999999e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0122  Na+/solute symporter  42.14 
 
 		 449 aa  352  5.9999999999999994e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00309864  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  40.72 
 
 		 479 aa  348  8e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0338  Na+/solute symporter  40.13 
 
 		 479 aa  347  3e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0436  Na+/solute symporter  39.21 
 
 		 478 aa  342  7e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0375  Na+/solute symporter  38.36 
 
 		 478 aa  339  5e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197469 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3448  Na+/solute symporter  39.96 
 
 		 495 aa  338  9e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4155  Na+/solute symporter  38.14 
 
 		 515 aa  334  2e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.128874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0695  Na+/solute symporter  38.49 
 
 		 492 aa  334  2e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.921144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0212  sodium/solute symporter  38.58 
 
 		 475 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.200787 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1911  Na+/solute symporter  33.89 
 
 		 460 aa  218  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.504205  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  27.74 
 
 		 472 aa  168  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  25.17 
 
 		 483 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  27.45 
 
 		 479 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  25.8 
 
 		 476 aa  129  8.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  28.6 
 
 		 500 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  26.73 
 
 		 461 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  27.37 
 
 		 461 aa  123  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  26.76 
 
 		 460 aa  123  7e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  26.53 
 
 		 474 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0309  Na+/solute symporter  27.23 
 
 		 510 aa  121  3e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0864  hypothetical protein  27.67 
 
 		 524 aa  121  3e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.983965  normal  0.0488094 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  23.96 
 
 		 464 aa  119  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1333  Na+/solute symporter  24.68 
 
 		 466 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000174463  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  23.68 
 
 		 537 aa  117  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  25.3 
 
 		 506 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1525  Na+/solute symporter  26.52 
 
 		 475 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  26.48 
 
 		 483 aa  113  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  22.82 
 
 		 486 aa  112  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2906  Na+/solute symporter  28.57 
 
 		 463 aa  111  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  26.14 
 
 		 483 aa  110  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  25.64 
 
 		 482 aa  110  6e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0815  Na+/solute symporter  25 
 
 		 507 aa  110  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.215377  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0964  Na+/solute symporter  25.48 
 
 		 508 aa  109  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  25.8 
 
 		 488 aa  108  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  26.82 
 
 		 462 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2686  sodium/proline symporter  25.16 
 
 		 486 aa  108  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0182  Na+/solute symporter  24.55 
 
 		 478 aa  105  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2608  sodium/proline symporter  25.8 
 
 		 483 aa  104  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0498264  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0446  hypothetical protein  26.55 
 
 		 726 aa  104  3e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.722173 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1072  Na+/solute symporter  24.49 
 
 		 527 aa  104  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0387059  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0089  Na+/solute symporter  24.65 
 
 		 496 aa  103  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000762337  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0769  Na+/solute symporter  24.24 
 
 		 487 aa  103  9e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00939685 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  24.21 
 
 		 459 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  24.21 
 
 		 459 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2635  sodium/solute transporter family urea transporter  24.94 
 
 		 476 aa  102  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.451328 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  24.66 
 
 		 500 aa  102  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.23 
 
 		 533 aa  102  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  25.07 
 
 		 483 aa  102  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  25.06 
 
 		 459 aa  102  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1520  Sodium/proline symporter  25.21 
 
 		 483 aa  102  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5962  Na+/solute symporter  24.7 
 
 		 472 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  26.26 
 
 		 463 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0846  Na+/solute symporter  25 
 
 		 507 aa  102  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  26.39 
 
 		 463 aa  101  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  26.96 
 
 		 487 aa  101  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  26.41 
 
 		 492 aa  101  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2263  sodium/solute transporter family urea transporter  24.6 
 
 		 474 aa  100  4e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0563  Na+/solute symporter  24.41 
 
 		 476 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.379209 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  26.39 
 
 		 492 aa  100  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0649  Na+/solute symporter  26.28 
 
 		 505 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.374818  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0642  Na+/solute symporter  26.28 
 
 		 505 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0662  Na+/solute symporter  26.28 
 
 		 505 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0913668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  27.14 
 
 		 492 aa  100  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1533  Na+/solute symporter  24.7 
 
 		 472 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6296  Na+/solute symporter  24.7 
 
 		 472 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957255  normal  0.770519 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  27.14 
 
 		 493 aa  99.8  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0779  Na+/solute symporter  25.11 
 
 		 482 aa  99.8  8e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  27.14 
 
 		 492 aa  100  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6955  Na+/solute symporter  24.7 
 
 		 472 aa  100  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.269545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  26.92 
 
 		 492 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3709  SSS sodium solute transporter superfamily  24.03 
 
 		 564 aa  99  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174317  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1398  sodium/proline symporter  24.94 
 
 		 483 aa  99.4  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0934266  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  26.92 
 
 		 493 aa  99  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  25.43 
 
 		 492 aa  99  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  26.92 
 
 		 493 aa  99  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4529  Na+/solute symporter  24.31 
 
 		 525 aa  98.6  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  26.92 
 
 		 492 aa  99  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  26.54 
 
 		 492 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1451  sodium/proline symporter  24.72 
 
 		 483 aa  97.8  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0423407  unclonable  0.000000000084673 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  25.9 
 
 		 484 aa  97.8  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2541  sodium/pantothenate symporter  23.43 
 
 		 487 aa  97.8  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000222476  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1463  sodium/proline symporter  24.94 
 
 		 483 aa  97.8  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.169082  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  24.59 
 
 		 493 aa  97.4  5e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  25.43 
 
 		 492 aa  97.1  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  25.43 
 
 		 492 aa  97.1  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  25.38 
 
 		 492 aa  97.1  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  26.82 
 
 		 492 aa  97.1  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  25.43 
 
 		 492 aa  97.1  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  25.38 
 
 		 492 aa  97.1  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  25.43 
 
 		 492 aa  97.1  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1939  sodium/proline symporter  26.55 
 
 		 498 aa  96.3  9e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>