More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0422 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0422  Na+/solute symporter  100 
 
 		 476 aa  915    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2710  Na+/solute symporter  37.15 
 
 		 462 aa  293  6e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.308556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4206  Na+/solute symporter  33.48 
 
 		 490 aa  231  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153775  normal  0.0109856 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  29.28 
 
 		 464 aa  167  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  27.5 
 
 		 474 aa  154  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  25.73 
 
 		 486 aa  144  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  27.19 
 
 		 472 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  29.13 
 
 		 461 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  25.99 
 
 		 483 aa  128  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  26.84 
 
 		 482 aa  125  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  27.25 
 
 		 483 aa  123  6e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  27.74 
 
 		 500 aa  122  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4843  SSS sodium solute transporter superfamily  27.39 
 
 		 544 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  28.87 
 
 		 482 aa  120  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  25.32 
 
 		 483 aa  117  3.9999999999999997e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  26.13 
 
 		 459 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1525  Na+/solute symporter  27.08 
 
 		 475 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  26.53 
 
 		 513 aa  114  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1264  sodium:proline symporter (proline permease)  27.27 
 
 		 639 aa  113  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  28.26 
 
 		 461 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  26.62 
 
 		 459 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  26.33 
 
 		 463 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  26.19 
 
 		 459 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1952  Na+/solute symporter  26 
 
 		 638 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1398  sodium/proline symporter  25.15 
 
 		 483 aa  111  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0934266  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0122  Na+/solute symporter  26.4 
 
 		 449 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00309864  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1451  sodium/proline symporter  25.54 
 
 		 483 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0423407  unclonable  0.000000000084673 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  26.88 
 
 		 459 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2469  sodium/proline symporter  26.65 
 
 		 497 aa  110  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00121427  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  27.12 
 
 		 460 aa  110  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  26.88 
 
 		 459 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1463  sodium/proline symporter  25.35 
 
 		 483 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.169082  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  25.7 
 
 		 463 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0355  Na+/solute symporter  26.8 
 
 		 492 aa  109  1e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2865  sodium/proline symporter  27.6 
 
 		 483 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.468907 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  27.63 
 
 		 492 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  26.67 
 
 		 482 aa  107  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  26.86 
 
 		 506 aa  107  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  27.4 
 
 		 484 aa  107  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2927  Na+/solute symporter  30.15 
 
 		 491 aa  107  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1081  sodium/proline symporter  26.65 
 
 		 498 aa  107  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000772394  unclonable  0.00000000000701401 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  27.79 
 
 		 462 aa  107  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  27.69 
 
 		 492 aa  106  8e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2790  sodium/proline symporter  27.4 
 
 		 483 aa  106  8e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276408  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2770  sodium/proline symporter  27.4 
 
 		 483 aa  106  8e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000703765  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1588  sodium/proline symporter  27.4 
 
 		 483 aa  106  8e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000493204  unclonable  0.00000000000453194 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1817  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.09 
 
 		 484 aa  106  9e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  28.77 
 
 		 479 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  25.94 
 
 		 483 aa  106  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1716  GTP-binding protein, HSR1-releated protein  25.67 
 
 		 498 aa  104  3e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.066858  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  21.12 
 
 		 476 aa  104  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01880  Na+/proline symporter  27.01 
 
 		 587 aa  104  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  27.35 
 
 		 483 aa  104  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  27.82 
 
 		 485 aa  104  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1525  Na+/solute symporter  28.51 
 
 		 479 aa  104  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1533  Na+/solute symporter  26.38 
 
 		 472 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2608  sodium/proline symporter  25.51 
 
 		 483 aa  103  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0498264  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6296  Na+/solute symporter  26.38 
 
 		 472 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957255  normal  0.770519 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6955  Na+/solute symporter  26.38 
 
 		 472 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.269545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4529  Na+/solute symporter  26.05 
 
 		 525 aa  103  8e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  30.46 
 
 		 492 aa  103  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  27.48 
 
 		 492 aa  103  9e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0563  Na+/solute symporter  23.69 
 
 		 476 aa  103  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.379209 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  29.17 
 
 		 492 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  28.67 
 
 		 492 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0436  Na+/solute symporter  26.67 
 
 		 478 aa  103  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  26.53 
 
 		 488 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3448  Na+/solute symporter  27.52 
 
 		 495 aa  102  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  27.37 
 
 		 523 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0718  Na+/solute symporter  25.47 
 
 		 486 aa  102  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  28.46 
 
 		 492 aa  101  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  27.11 
 
 		 493 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  27.11 
 
 		 492 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  26.29 
 
 		 487 aa  101  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  27.09 
 
 		 492 aa  101  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  25.96 
 
 		 492 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  27.11 
 
 		 492 aa  101  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  25.96 
 
 		 492 aa  100  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  27.11 
 
 		 493 aa  100  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  25.96 
 
 		 492 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  27.11 
 
 		 493 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0089  Na+/solute symporter  28.87 
 
 		 496 aa  100  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000762337  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  27.11 
 
 		 492 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  26.17 
 
 		 492 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  26.58 
 
 		 487 aa  100  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  26.17 
 
 		 492 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  26.17 
 
 		 492 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  27.11 
 
 		 492 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  26.84 
 
 		 492 aa  100  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0190  Na+/solute symporter  27.16 
 
 		 471 aa  100  6e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0470055  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  25.52 
 
 		 483 aa  100  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  30.48 
 
 		 479 aa  100  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1939  sodium/proline symporter  29.19 
 
 		 498 aa  99.8  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2541  sodium/pantothenate symporter  24.22 
 
 		 487 aa  99.4  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000222476  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0695  Na+/solute symporter  26.8 
 
 		 492 aa  99.8  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.921144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0375  Na+/solute symporter  26.02 
 
 		 478 aa  99  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197469 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2686  sodium/proline symporter  24.16 
 
 		 486 aa  99  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  24.95 
 
 		 482 aa  98.2  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0463  sodium/solute symporter transmembrane protein  28.18 
 
 		 479 aa  97.8  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0353  Na+/solute symporter  28.01 
 
 		 479 aa  97.8  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606466  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>