More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1525 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1525  Na+/solute symporter  100 
 
 		 475 aa  936    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  29.79 
 
 		 474 aa  162  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1333  Na+/solute symporter  30.37 
 
 		 466 aa  147  5e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000174463  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4721  Na+/solute symporter  29.08 
 
 		 463 aa  143  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3294  Na+/solute symporter  28.71 
 
 		 469 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241683  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  27.71 
 
 		 483 aa  133  7.999999999999999e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2163  Na+/solute symporter  27.93 
 
 		 459 aa  132  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233045 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1298  Na+/solute symporter  27 
 
 		 472 aa  131  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.537823 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  26.36 
 
 		 476 aa  130  5.0000000000000004e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0563  Na+/solute symporter  27.44 
 
 		 476 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.379209 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  27.04 
 
 		 486 aa  125  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5962  Na+/solute symporter  26.18 
 
 		 472 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0688  Na+/solute symporter  26.18 
 
 		 471 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.217002  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6955  Na+/solute symporter  26.68 
 
 		 472 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.269545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1533  Na+/solute symporter  26.68 
 
 		 472 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6296  Na+/solute symporter  26.68 
 
 		 472 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957255  normal  0.770519 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  28.57 
 
 		 483 aa  120  4.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  23.62 
 
 		 472 aa  120  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6434  Na+/solute symporter  26.01 
 
 		 473 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00922487 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  26.34 
 
 		 461 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  26.3 
 
 		 459 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  26.85 
 
 		 461 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0645  Na+/solute symporter  25.46 
 
 		 472 aa  114  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.646028  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  30.59 
 
 		 460 aa  114  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  25.8 
 
 		 464 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  24.84 
 
 		 459 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8130  Na+/solute symporter  26.6 
 
 		 474 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.580887  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  26.52 
 
 		 461 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3710  Na+/solute symporter  26.09 
 
 		 471 aa  108  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.27 
 
 		 533 aa  108  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  24.57 
 
 		 463 aa  106  9e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  25.22 
 
 		 459 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  27.11 
 
 		 462 aa  106  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3539  Na+/solute symporter  25.2 
 
 		 471 aa  105  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0326627  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  24.78 
 
 		 463 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4206  Na+/solute symporter  25.06 
 
 		 490 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153775  normal  0.0109856 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2710  Na+/solute symporter  26.39 
 
 		 462 aa  103  7e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.308556  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0422  Na+/solute symporter  28.22 
 
 		 476 aa  101  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1337  Na+/solute symporter  29.33 
 
 		 461 aa  100  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.833142  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  26.4 
 
 		 479 aa  100  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  24.57 
 
 		 459 aa  99.8  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  24.57 
 
 		 459 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.65 
 
 		 565 aa  98.2  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2325  Na+/solute symporter  27.18 
 
 		 489 aa  98.2  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00258865  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  30 
 
 		 500 aa  97.4  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  26.56 
 
 		 493 aa  97.4  5e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  25.83 
 
 		 488 aa  96.3  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  25.06 
 
 		 479 aa  95.5  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  26.5 
 
 		 483 aa  95.1  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2608  sodium/proline symporter  25.78 
 
 		 483 aa  94.4  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0498264  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  25.55 
 
 		 482 aa  94  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2906  Na+/solute symporter  27.55 
 
 		 463 aa  93.6  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  26.23 
 
 		 482 aa  93.2  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  25.62 
 
 		 520 aa  92  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  25.17 
 
 		 483 aa  91.7  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  22.34 
 
 		 492 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.12 
 
 		 520 aa  90.5  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3766  sodium/proline symporter  25.15 
 
 		 499 aa  90.5  7e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.525061  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1620  Na+/solute symporter  24.3 
 
 		 460 aa  90.1  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0163738 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0688  Na+/solute symporter  25.83 
 
 		 464 aa  89.7  9e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  25.11 
 
 		 483 aa  89.4  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1542  sodium/proline symporter  25.44 
 
 		 502 aa  89  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.13082 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.75 
 
 		 523 aa  89  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  24.51 
 
 		 551 aa  88.2  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02712  proline/sodium symporter  24.5 
 
 		 493 aa  88.2  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.076903  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  26.94 
 
 		 493 aa  87.8  4e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  21.92 
 
 		 492 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  23.94 
 
 		 482 aa  87.4  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  26.48 
 
 		 509 aa  87  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  24.24 
 
 		 520 aa  87  7e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4018  sodium/proline symporter  25.55 
 
 		 494 aa  85.9  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  26.35 
 
 		 518 aa  85.5  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  21.34 
 
 		 492 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  21.55 
 
 		 493 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4728  SSS sodium solute transporter superfamily  27.91 
 
 		 549 aa  85.1  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  hitchhiker  0.00040203 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  21.55 
 
 		 493 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  24.07 
 
 		 482 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  21.55 
 
 		 493 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  21.55 
 
 		 492 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  23.88 
 
 		 492 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  21.55 
 
 		 492 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.54 
 
 		 519 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  26.17 
 
 		 487 aa  84.3  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2686  sodium/proline symporter  24.49 
 
 		 486 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  25.84 
 
 		 497 aa  84  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4210  sodium/proline symporter  24.89 
 
 		 494 aa  84  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0154  Na+/solute symporter  25.81 
 
 		 531 aa  84  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.535073  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0087  putative symporter YidK  25.07 
 
 		 529 aa  84  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3448  Na+/solute symporter  24.39 
 
 		 495 aa  84  0.000000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2770  sodium/proline symporter  25.79 
 
 		 483 aa  83.2  0.000000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000703765  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1588  sodium/proline symporter  25.79 
 
 		 483 aa  83.2  0.000000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000493204  unclonable  0.00000000000453194 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2790  sodium/proline symporter  25.79 
 
 		 483 aa  83.2  0.000000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276408  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2834  Na+/solute symporter  26.61 
 
 		 543 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00723472  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1415  SSS family Na(+)/proline symporter  25.23 
 
 		 499 aa  82.4  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.631202 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1520  Sodium/proline symporter  26.02 
 
 		 483 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0375  Na+/solute symporter  23.16 
 
 		 478 aa  82.8  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197469 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2865  sodium/proline symporter  25.79 
 
 		 483 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.468907 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1398  sodium/proline symporter  25.23 
 
 		 483 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0934266  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1463  sodium/proline symporter  25.23 
 
 		 483 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.169082  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  23.79 
 
 		 492 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>