More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0800 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  77.37 
 
 
479 aa  734    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  100 
 
 
483 aa  969    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  89.24 
 
 
482 aa  849    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  99.59 
 
 
482 aa  964    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0463  sodium/solute symporter transmembrane protein  57.42 
 
 
479 aa  510  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0353  Na+/solute symporter  56.76 
 
 
479 aa  511  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606466  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0190  Na+/solute symporter  55.77 
 
 
471 aa  498  1e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0470055  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0338  Na+/solute symporter  55.35 
 
 
479 aa  488  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0436  Na+/solute symporter  53.86 
 
 
478 aa  486  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0375  Na+/solute symporter  54.35 
 
 
478 aa  484  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.197469 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0718  Na+/solute symporter  52.51 
 
 
486 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0695  Na+/solute symporter  49.16 
 
 
492 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.921144  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4155  Na+/solute symporter  49.17 
 
 
515 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.128874  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0212  sodium/solute symporter  50.73 
 
 
475 aa  410  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.200787 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3448  Na+/solute symporter  44.47 
 
 
495 aa  385  1e-105  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  40.95 
 
 
461 aa  355  6.999999999999999e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5240  Na+/solute symporter  43.17 
 
 
460 aa  347  4e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0122  Na+/solute symporter  39.11 
 
 
449 aa  288  2e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00309864  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1911  Na+/solute symporter  30.57 
 
 
460 aa  162  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.504205  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  27.48 
 
 
472 aa  153  7e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  27.94 
 
 
483 aa  153  8e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  28.4 
 
 
476 aa  147  5e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  27.59 
 
 
486 aa  132  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  27.9 
 
 
464 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  27.55 
 
 
474 aa  127  7e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  27.54 
 
 
461 aa  123  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  29.07 
 
 
463 aa  123  9e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  29.07 
 
 
463 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  27.94 
 
 
461 aa  121  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0815  Na+/solute symporter  27.21 
 
 
507 aa  121  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.215377  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2710  Na+/solute symporter  30.09 
 
 
462 aa  120  3.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.308556  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  28.77 
 
 
460 aa  119  9e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  26.93 
 
 
459 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  28.6 
 
 
479 aa  119  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  25.81 
 
 
483 aa  117  3.9999999999999997e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  26.55 
 
 
462 aa  117  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  26.05 
 
 
459 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  26.05 
 
 
459 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  26.28 
 
 
459 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  26.05 
 
 
459 aa  113  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  27.6 
 
 
500 aa  111  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0642  Na+/solute symporter  28.6 
 
 
505 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0649  Na+/solute symporter  28.38 
 
 
505 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.374818  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0662  Na+/solute symporter  28.38 
 
 
505 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0913668  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  26.79 
 
 
500 aa  108  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0964  Na+/solute symporter  28.11 
 
 
508 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0846  Na+/solute symporter  28.35 
 
 
507 aa  105  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  26.61 
 
 
493 aa  105  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0041  sodium/pantothenate symporter  24.74 
 
 
468 aa  105  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.3030600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  23.93 
 
 
523 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4206  Na+/solute symporter  24.31 
 
 
490 aa  105  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153775  normal  0.0109856 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  24.7 
 
 
484 aa  103  7e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2906  Na+/solute symporter  26.68 
 
 
463 aa  103  8e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  27.49 
 
 
485 aa  103  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  26.92 
 
 
483 aa  102  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0309  Na+/solute symporter  23.9 
 
 
510 aa  102  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0422  Na+/solute symporter  26.98 
 
 
476 aa  102  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273483  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0924  twin-arginine translocation pathway signal  25.13 
 
 
452 aa  102  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.839391  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3553  sodium/panthothenate symporter  26.56 
 
 
483 aa  101  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000280994  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1072  Na+/solute symporter  26.6 
 
 
527 aa  100  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0387059  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  25.78 
 
 
557 aa  100  7e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0093  Na+/solute symporter  28.41 
 
 
505 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.620511  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  25.96 
 
 
487 aa  98.2  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.55 
 
 
565 aa  97.8  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  25.78 
 
 
557 aa  97.1  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1379  sodium/panthothenate symporter  25.8 
 
 
492 aa  96.7  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0385274  normal  0.372154 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.34 
 
 
523 aa  96.3  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1525  Na+/solute symporter  26.5 
 
 
475 aa  95.1  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0864  hypothetical protein  25.24 
 
 
524 aa  95.1  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.983965  normal  0.0488094 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3321  sodium/panthothenate symporter  25.25 
 
 
494 aa  93.6  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  23.42 
 
 
506 aa  93.6  8e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3641  sodium/panthothenate symporter  26.35 
 
 
483 aa  92.8  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000698464  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0182  Na+/solute symporter  25.93 
 
 
478 aa  92.8  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0171  SSS sodium solute transporter superfamily  23.59 
 
 
520 aa  92.8  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0745729 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  26.89 
 
 
483 aa  92.8  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2815  SSS sodium solute transporter superfamily  24.46 
 
 
527 aa  91.7  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6588  SSS sodium solute transporter superfamily  24.53 
 
 
529 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03067  hypothetical protein  26.14 
 
 
483 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.647307  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03116  sodium/panthothenate symporter  26.14 
 
 
483 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.735141  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0448  sodium/pantothenate symporter  26.14 
 
 
483 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.293948  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4575  sodium/panthothenate symporter  26.14 
 
 
483 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000690231  normal  0.130163 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3742  sodium/panthothenate symporter  26.14 
 
 
483 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150129  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3450  sodium/panthothenate symporter  26.14 
 
 
483 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000724112  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0448  sodium/panthothenate symporter  26.14 
 
 
483 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.024979  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1250  sodium/proline symporter  25.69 
 
 
496 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1156  sodium/proline symporter  25.74 
 
 
486 aa  90.9  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.307204  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.67 
 
 
548 aa  90.9  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  25.05 
 
 
492 aa  90.1  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4420  sodium/panthothenate symporter  25.42 
 
 
481 aa  90.1  9e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0607009  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1248  Sodium/proline symporter  25.51 
 
 
496 aa  90.1  9e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.126391  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0089  Na+/solute symporter  23.67 
 
 
496 aa  89.7  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000762337  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  25.28 
 
 
492 aa  89.4  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4529  Na+/solute symporter  25 
 
 
525 aa  88.6  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3645  sodium/panthothenate symporter  24.94 
 
 
483 aa  88.2  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00060524 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  25.51 
 
 
492 aa  88.2  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02712  proline/sodium symporter  25.87 
 
 
493 aa  88.2  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.076903  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3255  sodium/panthothenate symporter  25.89 
 
 
477 aa  88.2  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.344037  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3680  sodium/panthothenate symporter  24.94 
 
 
483 aa  88.2  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.433126 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3574  sodium/panthothenate symporter  24.94 
 
 
483 aa  88.2  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  22.97 
 
 
520 aa  87.8  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.133382 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>