More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4206 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4206  Na+/solute symporter  100 
 
 		 490 aa  977    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153775  normal  0.0109856 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2710  Na+/solute symporter  32.08 
 
 		 462 aa  233  9e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.308556  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0422  Na+/solute symporter  33.06 
 
 		 476 aa  201  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  26.07 
 
 		 474 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  27.68 
 
 		 472 aa  144  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  26.89 
 
 		 464 aa  143  6e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  25.67 
 
 		 476 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1250  sodium/proline symporter  27.17 
 
 		 496 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  27.4 
 
 		 486 aa  127  5e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  24.9 
 
 		 483 aa  125  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3463  proline/sodium symporter  26.72 
 
 		 495 aa  124  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0695  Na+/solute symporter  27.53 
 
 		 492 aa  124  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.921144  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  25.4 
 
 		 492 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  25.75 
 
 		 493 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  25.75 
 
 		 493 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  25.75 
 
 		 493 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  25.75 
 
 		 492 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  27.25 
 
 		 459 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  25.75 
 
 		 492 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  25.6 
 
 		 487 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  25.55 
 
 		 492 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1653  sodium/proline symporter  26.18 
 
 		 511 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  25.4 
 
 		 492 aa  120  6e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  22.8 
 
 		 483 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  26.03 
 
 		 483 aa  118  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  26.83 
 
 		 459 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1081  sodium/proline symporter  26.72 
 
 		 498 aa  118  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000772394  unclonable  0.00000000000701401 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02712  proline/sodium symporter  25.96 
 
 		 493 aa  117  3.9999999999999997e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.076903  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  24.9 
 
 		 492 aa  117  5e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1156  sodium/proline symporter  25.96 
 
 		 486 aa  117  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.307204  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  25.4 
 
 		 492 aa  117  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  24.26 
 
 		 492 aa  117  5e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  24.8 
 
 		 492 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  26.31 
 
 		 513 aa  116  8.999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  24.31 
 
 		 492 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  25.46 
 
 		 482 aa  114  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  24.9 
 
 		 492 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  27.06 
 
 		 463 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  27.22 
 
 		 463 aa  114  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  26.42 
 
 		 459 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  27 
 
 		 459 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  27 
 
 		 459 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0924  twin-arginine translocation pathway signal  27.56 
 
 		 452 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.839391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1326  Sodium/proline symporter  24.8 
 
 		 488 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0529188  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  25.45 
 
 		 493 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  24.9 
 
 		 483 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  24.64 
 
 		 461 aa  111  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  25.25 
 
 		 492 aa  111  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  25.8 
 
 		 492 aa  110  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54150  sodium/proline symporter PutP  26.95 
 
 		 506 aa  110  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  25.39 
 
 		 492 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  25.39 
 
 		 492 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  25.39 
 
 		 492 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  25.39 
 
 		 492 aa  109  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  24.65 
 
 		 484 aa  109  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  25.39 
 
 		 492 aa  109  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0149  Sodium/proline symporter  27.56 
 
 		 498 aa  109  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4736  sodium/proline symporter PutP  26.95 
 
 		 506 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  25.05 
 
 		 461 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01675  proline/sodium symporter  25.98 
 
 		 504 aa  107  7e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.068924  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1525  Na+/solute symporter  24.47 
 
 		 475 aa  106  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4843  SSS sodium solute transporter superfamily  23.57 
 
 		 544 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  26.41 
 
 		 500 aa  106  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  27.74 
 
 		 479 aa  105  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  27.07 
 
 		 493 aa  105  2e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  24.6 
 
 		 482 aa  105  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2906  Na+/solute symporter  26.4 
 
 		 463 aa  105  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  24.31 
 
 		 483 aa  104  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3490  sodium/proline symporter  24.85 
 
 		 498 aa  104  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.753009  normal  0.0181041 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  25 
 
 		 492 aa  103  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  22.4 
 
 		 482 aa  103  6e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4283  sodium/proline symporter  26.29 
 
 		 498 aa  103  7e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4423  sodium/proline symporter  26.29 
 
 		 498 aa  103  7e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0117  sodium/proline symporter  26.29 
 
 		 498 aa  103  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  24.14 
 
 		 488 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1113  SSS sodium solute transporter superfamily  25.79 
 
 		 529 aa  103  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00736856  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4236  sodium/proline symporter  26.29 
 
 		 498 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  27.42 
 
 		 460 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  24.08 
 
 		 518 aa  102  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1440  proline permease  25.52 
 
 		 511 aa  102  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0406998  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1817  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.06 
 
 		 484 aa  102  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  23.73 
 
 		 483 aa  102  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  25.45 
 
 		 485 aa  101  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0353  Na+/solute symporter  26.33 
 
 		 479 aa  101  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  24.18 
 
 		 492 aa  100  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2608  sodium/proline symporter  23.12 
 
 		 483 aa  100  6e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0498264  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07840  sodium/ prolin symporter  25.68 
 
 		 544 aa  100  7e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  25.64 
 
 		 479 aa  100  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1991  high affinity proline permease  25.99 
 
 		 512 aa  100  8e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1957  high affinity proline permease  25.99 
 
 		 512 aa  100  8e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3085  sodium/proline symporter  23.8 
 
 		 484 aa  99.8  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.198592 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0463  sodium/solute symporter transmembrane protein  26.68 
 
 		 479 aa  99.4  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0083  sodium/proline symporter  26.48 
 
 		 498 aa  99.8  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05050  sodium/proline symporter  26.39 
 
 		 499 aa  99  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2686  sodium/proline symporter  23.79 
 
 		 486 aa  99  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1860  sodium/proline symporter  27.11 
 
 		 496 aa  98.6  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0914218  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3448  Na+/solute symporter  27.92 
 
 		 495 aa  98.6  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  26.3 
 
 		 487 aa  98.2  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04170  sodium/proline symporter  26.03 
 
 		 499 aa  97.4  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0302673 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4055  sodium/proline symporter  26.43 
 
 		 498 aa  97.8  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>