More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2709 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  100 
 
 
483 aa  948    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  40.81 
 
 
472 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  37.58 
 
 
461 aa  331  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  38.68 
 
 
461 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  39.48 
 
 
459 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  39.48 
 
 
459 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  40.48 
 
 
459 aa  323  6e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  40.13 
 
 
463 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  40.13 
 
 
463 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  39.43 
 
 
459 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  39.87 
 
 
459 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  39.05 
 
 
462 aa  303  3.0000000000000004e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  39.74 
 
 
479 aa  301  2e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1620  Na+/solute symporter  36.93 
 
 
460 aa  288  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0163738 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2906  Na+/solute symporter  39.26 
 
 
463 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  35.98 
 
 
500 aa  269  8.999999999999999e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0964  Na+/solute symporter  33.4 
 
 
508 aa  246  4.9999999999999997e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0846  Na+/solute symporter  34.9 
 
 
507 aa  242  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04330  Na+/proline symporter  35.48 
 
 
497 aa  219  1e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.723621  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  30.26 
 
 
474 aa  186  7e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  26.32 
 
 
483 aa  155  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0924  twin-arginine translocation pathway signal  29.6 
 
 
452 aa  145  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.839391  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  27.91 
 
 
486 aa  135  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2710  Na+/solute symporter  27.39 
 
 
462 aa  126  7e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.308556  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0041  sodium/pantothenate symporter  27.86 
 
 
468 aa  125  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.3030600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  25.05 
 
 
476 aa  125  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1817  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.34 
 
 
484 aa  124  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  25.48 
 
 
483 aa  124  5e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.03 
 
 
526 aa  123  9e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  27.19 
 
 
460 aa  123  9e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1525  Na+/solute symporter  28.57 
 
 
475 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4206  Na+/solute symporter  25.8 
 
 
490 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153775  normal  0.0109856 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1333  Na+/solute symporter  26.86 
 
 
466 aa  118  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000174463  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  25.81 
 
 
483 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  26.04 
 
 
482 aa  117  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  25.77 
 
 
487 aa  117  6.9999999999999995e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  27.74 
 
 
482 aa  116  7.999999999999999e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0355  Na+/solute symporter  27.25 
 
 
492 aa  116  7.999999999999999e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2672  Na+/solute symporter  25.61 
 
 
599 aa  113  8.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4721  Na+/solute symporter  23.84 
 
 
463 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  24.21 
 
 
464 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0718  Na+/solute symporter  25.47 
 
 
486 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  25.81 
 
 
506 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3541  Na+/solute symporter  25.26 
 
 
597 aa  110  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165749  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  25.62 
 
 
479 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4898  solute/sodium symporter (SSS) family protein  26.19 
 
 
489 aa  108  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3448  Na+/solute symporter  28.37 
 
 
495 aa  106  9e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0122  Na+/solute symporter  25.46 
 
 
449 aa  106  9e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00309864  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  26.26 
 
 
493 aa  105  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0212  sodium/solute symporter  25.46 
 
 
475 aa  103  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.200787 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  25.07 
 
 
461 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0422  Na+/solute symporter  25.32 
 
 
476 aa  103  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273483  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0375  Na+/solute symporter  25 
 
 
478 aa  102  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.197469 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2163  Na+/solute symporter  25.52 
 
 
459 aa  102  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000233045 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  22.62 
 
 
537 aa  102  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3355  Na+/solute symporter  23.54 
 
 
517 aa  102  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0695  Na+/solute symporter  26.89 
 
 
492 aa  101  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.921144  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5240  Na+/solute symporter  26.27 
 
 
460 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1146  Na+/solute symporter  23.88 
 
 
469 aa  100  6e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.497129  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1671  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.38 
 
 
593 aa  100  7e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0302135 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0353  Na+/solute symporter  24.01 
 
 
479 aa  100  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606466  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3294  Na+/solute symporter  25.13 
 
 
469 aa  100  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241683  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1298  Na+/solute symporter  23.39 
 
 
472 aa  99.8  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.537823 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  25.97 
 
 
523 aa  99.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03377  sodium:solute symporter family protein  26.74 
 
 
523 aa  98.6  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0367  Na+/solute symporter  27.34 
 
 
446 aa  98.6  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.101074  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.89 
 
 
533 aa  98.6  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0463  sodium/solute symporter transmembrane protein  23.24 
 
 
479 aa  98.2  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0190  Na+/solute symporter  24.87 
 
 
471 aa  97.8  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0470055  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0436  Na+/solute symporter  23.96 
 
 
478 aa  97.8  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3085  sodium/proline symporter  28.49 
 
 
484 aa  97.4  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.198592 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1952  Na+/solute symporter  26.3 
 
 
638 aa  97.1  7e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4155  Na+/solute symporter  25.84 
 
 
515 aa  95.5  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.128874  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0993  SSS sodium solute transporter superfamily  22.32 
 
 
569 aa  94.7  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0554078  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2893  Na+/solute symporter  25.62 
 
 
604 aa  94  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1569  hypothetical protein  23.53 
 
 
468 aa  93.2  9e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1324  Na+/solute symporter  25.86 
 
 
603 aa  93.2  9e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  24.04 
 
 
530 aa  92.8  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1444  hypothetical protein  24.64 
 
 
1170 aa  93.2  1e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0338  Na+/solute symporter  22.86 
 
 
479 aa  92  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.98 
 
 
567 aa  92  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13128  sodium/glucose cotransporter  24.37 
 
 
575 aa  92  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.194229  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  24.32 
 
 
492 aa  92  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1526  Na+/solute symporter  23.58 
 
 
586 aa  90.1  8e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6118  SSS sodium solute transporter superfamily  24.8 
 
 
562 aa  89.7  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  23.77 
 
 
492 aa  89.4  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0446  hypothetical protein  22.69 
 
 
726 aa  89  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.722173 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  26.39 
 
 
592 aa  89  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0089  Na+/solute symporter  26.98 
 
 
496 aa  89  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000762337  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  24.04 
 
 
492 aa  89.4  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04060  SSS sodium solute transporter  24.21 
 
 
565 aa  88.6  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  24.31 
 
 
509 aa  88.2  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1072  Na+/solute symporter  26.43 
 
 
527 aa  88.6  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0387059  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3587  Na+/solute symporter  23.56 
 
 
556 aa  87.8  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0961  Na+/solute symporter  26.2 
 
 
587 aa  87.8  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  24.49 
 
 
500 aa  87.4  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  24.66 
 
 
513 aa  87.4  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  25.5 
 
 
520 aa  87.4  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  25.06 
 
 
551 aa  87  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0449  hypothetical protein  23.36 
 
 
1126 aa  87.4  6e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.812136 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>