More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1298 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_3294  Na+/solute symporter  87.93 
 
 
469 aa  781    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241683  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4721  Na+/solute symporter  79.74 
 
 
463 aa  704    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1298  Na+/solute symporter  100 
 
 
472 aa  910    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.537823 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6434  Na+/solute symporter  36.36 
 
 
473 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00922487 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0688  Na+/solute symporter  33.7 
 
 
471 aa  299  7e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.217002  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0645  Na+/solute symporter  33.7 
 
 
472 aa  294  3e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.646028  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3710  Na+/solute symporter  35.05 
 
 
471 aa  293  4e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8130  Na+/solute symporter  36.01 
 
 
474 aa  292  7e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.580887  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3539  Na+/solute symporter  34.81 
 
 
471 aa  292  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0326627  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5962  Na+/solute symporter  36.71 
 
 
472 aa  289  7e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1533  Na+/solute symporter  36.49 
 
 
472 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6296  Na+/solute symporter  36.49 
 
 
472 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957255  normal  0.770519 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6955  Na+/solute symporter  36.49 
 
 
472 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.269545  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0563  Na+/solute symporter  34.84 
 
 
476 aa  283  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.379209 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  27.39 
 
 
474 aa  131  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1525  Na+/solute symporter  27 
 
 
475 aa  131  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  25.2 
 
 
472 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  29.16 
 
 
462 aa  114  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  27.11 
 
 
459 aa  113  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  28.88 
 
 
459 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  28.88 
 
 
459 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  28.61 
 
 
459 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  28.88 
 
 
459 aa  104  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  23.39 
 
 
483 aa  99.8  9e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2906  Na+/solute symporter  28.42 
 
 
463 aa  99.4  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  26.84 
 
 
463 aa  97.1  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  26.84 
 
 
463 aa  97.1  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  25.66 
 
 
461 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  24.34 
 
 
464 aa  92  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1333  Na+/solute symporter  25.44 
 
 
466 aa  90.9  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000174463  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  27.86 
 
 
479 aa  89.4  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2163  Na+/solute symporter  26.62 
 
 
459 aa  86.3  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000233045 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0688  Na+/solute symporter  26.21 
 
 
464 aa  85.1  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  30.88 
 
 
483 aa  85.5  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  25.26 
 
 
461 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  26.09 
 
 
500 aa  84.7  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0964  Na+/solute symporter  25.6 
 
 
508 aa  84.7  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  26.63 
 
 
506 aa  83.2  0.000000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0846  Na+/solute symporter  26.26 
 
 
507 aa  80.9  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1620  Na+/solute symporter  24.33 
 
 
460 aa  80.5  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0163738 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  24.05 
 
 
476 aa  77.4  0.0000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  26.83 
 
 
461 aa  75.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0041  sodium/pantothenate symporter  24.39 
 
 
468 aa  75.5  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.3030600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.08 
 
 
533 aa  74.3  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.95 
 
 
526 aa  72.8  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0924  twin-arginine translocation pathway signal  20.63 
 
 
452 aa  72.4  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.839391  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1337  Na+/solute symporter  26.93 
 
 
461 aa  72.4  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.833142  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5240  Na+/solute symporter  25 
 
 
460 aa  71.2  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2710  Na+/solute symporter  25.16 
 
 
462 aa  70.1  0.00000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.308556  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0642  Na+/solute symporter  28.03 
 
 
505 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0649  Na+/solute symporter  28.03 
 
 
505 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.374818  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0662  Na+/solute symporter  28.03 
 
 
505 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0913668  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4898  solute/sodium symporter (SSS) family protein  24.94 
 
 
489 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0446  hypothetical protein  25.71 
 
 
726 aa  67  0.0000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.722173 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.72 
 
 
567 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4206  Na+/solute symporter  20.87 
 
 
490 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153775  normal  0.0109856 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1817  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.08 
 
 
484 aa  64.7  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1134  Na+/solute symporter  22.71 
 
 
527 aa  65.1  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.82 
 
 
565 aa  65.1  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0422  Na+/solute symporter  23.87 
 
 
476 aa  64.3  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273483  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3985  SSS sodium solute transporter superfamily  23.71 
 
 
527 aa  64.3  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000567258  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1277  acetate permease  22.25 
 
 
537 aa  64.3  0.000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  24.27 
 
 
551 aa  63.9  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0089  Na+/solute symporter  26.9 
 
 
496 aa  63.5  0.000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000762337  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  22.22 
 
 
520 aa  63.2  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.22 
 
 
520 aa  63.2  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1444  hypothetical protein  21.96 
 
 
1170 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2834  Na+/solute symporter  23.28 
 
 
543 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00723472  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1490  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  22.33 
 
 
516 aa  61.6  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0960795  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0034  Na+/solute symporter  28.32 
 
 
543 aa  61.6  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.404882  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04330  Na+/proline symporter  26.26 
 
 
497 aa  61.6  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.723621  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0449  hypothetical protein  22.08 
 
 
1126 aa  61.2  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.812136 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1672  sodium/solute symporter family protein  22.22 
 
 
516 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.206426  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4619  acetate permease  23.23 
 
 
549 aa  60.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1850  SSS sodium solute transporter superfamily  23.86 
 
 
513 aa  60.5  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4617  acetate permease  22.98 
 
 
549 aa  60.5  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.825598  normal  0.309264 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4533  acetate permease  22.98 
 
 
549 aa  60.5  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.612121  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4668  acetate permease  23.23 
 
 
549 aa  60.5  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.962936  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1480  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  22.09 
 
 
516 aa  60.5  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4526  acetate permease  22.98 
 
 
549 aa  60.5  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2672  Na+/solute symporter  25 
 
 
599 aa  60.1  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1703  sodium/solute symporter family protein  22.09 
 
 
516 aa  60.1  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1518  sodium/solute symporter family protein  22.09 
 
 
516 aa  60.1  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.782594  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1635  sodium/solute symporter family protein  22.09 
 
 
516 aa  60.1  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  23.44 
 
 
460 aa  59.7  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0049  Na+/solute symporter  27.97 
 
 
543 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3672  sodium/solute symporter family protein  21.99 
 
 
516 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0653794  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0037  Na+/solute symporter  27.97 
 
 
543 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3675  hypothetical protein  21.8 
 
 
554 aa  59.3  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.834284 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  24.77 
 
 
509 aa  58.9  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0815  Na+/solute symporter  24.83 
 
 
507 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.215377  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1777  sodium/solute symporter family protein  21.56 
 
 
516 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3925  cation/acetate symporter ActP  21.52 
 
 
549 aa  58.5  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4311  acetate permease  21.52 
 
 
549 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03899  hypothetical protein  21.52 
 
 
549 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.790578  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1523  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  21.76 
 
 
516 aa  58.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.292925  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5572  acetate permease  21.52 
 
 
549 aa  58.5  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4622  acetate permease  21.52 
 
 
549 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4529  acetate permease  21.52 
 
 
549 aa  58.5  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3960  acetate permease  21.52 
 
 
549 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.221467 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>