More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1324 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1755  hypothetical protein  59.97 
 
 
577 aa  690    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1324  Na+/solute symporter  100 
 
 
603 aa  1191    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1011  Na+/proline symporter  48.71 
 
 
583 aa  544  1e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18811  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  48.97 
 
 
583 aa  544  1e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0257597  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16021  Na+/proline symporter  49.91 
 
 
587 aa  542  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2062  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  52.29 
 
 
584 aa  514  1e-144  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039516  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0610  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  52.03 
 
 
587 aa  489  1e-137  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.922091  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04421  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  50.69 
 
 
589 aa  480  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2672  Na+/solute symporter  37.42 
 
 
599 aa  390  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1083  Na+/solute symporter  37 
 
 
588 aa  364  3e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0991073  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1526  Na+/solute symporter  38.18 
 
 
586 aa  360  3e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1384  sodium:solute symporter family protein  36.38 
 
 
588 aa  358  9.999999999999999e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1358  Na+/solute symporter  38.35 
 
 
587 aa  353  5e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00027915  normal  0.0566975 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1178  sodium:solute symporter family protein  36.78 
 
 
585 aa  353  5.9999999999999994e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.107894 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0961  Na+/solute symporter  36.61 
 
 
587 aa  348  1e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13128  sodium/glucose cotransporter  34.7 
 
 
575 aa  347  3e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.194229  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2245  Na+/solute symporter  39.69 
 
 
609 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1120  Na+/solute symporter  34.98 
 
 
587 aa  333  7.000000000000001e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.13754  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0638  Na+/solute symporter  30.45 
 
 
538 aa  199  9e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2288  Na+/solute symporter  28.97 
 
 
593 aa  164  6e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.175475 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0129  Na+/solute symporter  27.32 
 
 
596 aa  157  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2072  Na+/solute symporter  27.73 
 
 
609 aa  157  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0164847 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2441  Na+/solute symporter  26.85 
 
 
625 aa  146  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231666  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0565  Na+/solute symporter  27.59 
 
 
594 aa  144  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.426275  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2033  Na+/solute symporter  26.3 
 
 
625 aa  137  5e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  25.61 
 
 
523 aa  120  9e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3587  Na+/solute symporter  25.68 
 
 
556 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.55 
 
 
533 aa  114  6e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.82 
 
 
526 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3541  Na+/solute symporter  25 
 
 
597 aa  111  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165749  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  27.05 
 
 
592 aa  109  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  27.46 
 
 
483 aa  106  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2416  Na+/solute symporter  27.1 
 
 
575 aa  104  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.664159  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.58 
 
 
519 aa  102  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  25 
 
 
520 aa  101  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.83 
 
 
523 aa  100  8e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1952  Na+/solute symporter  25.66 
 
 
638 aa  99.8  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.94 
 
 
520 aa  98.2  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.12 
 
 
565 aa  98.6  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.82 
 
 
520 aa  97.4  6e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0350  Na+/solute symporter  24.24 
 
 
489 aa  97.4  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  24.95 
 
 
520 aa  97.1  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.09 
 
 
522 aa  96.7  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.17 
 
 
522 aa  96.3  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  24.71 
 
 
537 aa  95.9  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  23.57 
 
 
520 aa  95.9  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6588  SSS sodium solute transporter superfamily  24.17 
 
 
529 aa  95.5  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  28.84 
 
 
513 aa  95.1  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.75 
 
 
526 aa  93.6  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0592432  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  25.86 
 
 
483 aa  93.2  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1264  sodium:proline symporter (proline permease)  27.09 
 
 
639 aa  92.4  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  24.8 
 
 
476 aa  92.8  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2608  SSS sodium solute transporter superfamily  25.62 
 
 
570 aa  92.8  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.74 
 
 
522 aa  92.4  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  24.25 
 
 
461 aa  92  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  24.45 
 
 
461 aa  90.9  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0303  Na+/solute symporter  27.76 
 
 
596 aa  90.5  8e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  27.48 
 
 
551 aa  90.1  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2893  Na+/solute symporter  24.63 
 
 
604 aa  90.1  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2466  SSS sodium solute transporter superfamily  26.33 
 
 
509 aa  89.7  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4963400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6118  SSS sodium solute transporter superfamily  23.89 
 
 
562 aa  89  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000913  sodium-solute symporter putative  26.24 
 
 
590 aa  88.6  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  24.24 
 
 
460 aa  88.6  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3355  Na+/solute symporter  26.08 
 
 
517 aa  88.2  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  22.53 
 
 
472 aa  87.8  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  26.64 
 
 
459 aa  87.4  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  26.38 
 
 
509 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1859  SSS sodium solute transporter superfamily  25.78 
 
 
551 aa  87  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  23.54 
 
 
487 aa  85.5  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3635  SSS sodium solute transporter superfamily  23.53 
 
 
565 aa  85.5  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.85975  normal  0.450055 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0171  SSS sodium solute transporter superfamily  24.65 
 
 
520 aa  85.9  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0745729 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3709  SSS sodium solute transporter superfamily  24.65 
 
 
564 aa  86.3  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174317  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  24.08 
 
 
483 aa  86.3  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  25.42 
 
 
461 aa  85.1  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.13 
 
 
567 aa  84.7  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1671  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.67 
 
 
593 aa  84.7  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0302135 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  23.46 
 
 
530 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0289  Na+/solute symporter  24.37 
 
 
590 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0322805  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.01 
 
 
548 aa  81.3  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4407  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.14 
 
 
613 aa  80.9  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0343463  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.71 
 
 
542 aa  80.5  0.00000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  22.36 
 
 
561 aa  80.1  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201601  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.63 
 
 
561 aa  79.7  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3985  SSS sodium solute transporter superfamily  22.78 
 
 
527 aa  78.2  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000567258  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2815  SSS sodium solute transporter superfamily  23.73 
 
 
527 aa  77.8  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0297  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.6 
 
 
510 aa  77  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.977217  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0304  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.6 
 
 
510 aa  77  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  25.93 
 
 
463 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  24.5 
 
 
474 aa  75.5  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04060  SSS sodium solute transporter  21.38 
 
 
565 aa  75.1  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  23.73 
 
 
557 aa  75.1  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  25.7 
 
 
463 aa  75.1  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1518  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.25 
 
 
892 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2763  Na+/solute symporter  26.77 
 
 
472 aa  74.3  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  23.73 
 
 
557 aa  74.3  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  25.06 
 
 
598 aa  74.3  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2732  SSS sodium solute transporter superfamily  23.33 
 
 
561 aa  73.9  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0672  Na+/solute symporter  23.9 
 
 
633 aa  73.6  0.000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  24.66 
 
 
492 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  24.66 
 
 
492 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>