More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0565 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_0565  Na+/solute symporter  100 
 
 		 594 aa  1185    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.426275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2288  Na+/solute symporter  67.34 
 
 		 593 aa  800    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.175475 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2072  Na+/solute symporter  61.05 
 
 		 609 aa  764    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0164847 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0129  Na+/solute symporter  35.01 
 
 		 596 aa  273  6e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2441  Na+/solute symporter  32.32 
 
 		 625 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231666  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2033  Na+/solute symporter  32.59 
 
 		 625 aa  267  4e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0303  Na+/solute symporter  31.67 
 
 		 596 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1755  hypothetical protein  28.79 
 
 		 577 aa  159  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1324  Na+/solute symporter  26.78 
 
 		 603 aa  153  7e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1083  Na+/solute symporter  27.11 
 
 		 588 aa  152  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0991073  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2672  Na+/solute symporter  24.16 
 
 		 599 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1178  sodium:solute symporter family protein  26.99 
 
 		 585 aa  148  3e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.107894 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1526  Na+/solute symporter  27.69 
 
 		 586 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1120  Na+/solute symporter  27.34 
 
 		 587 aa  147  6e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.13754  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0961  Na+/solute symporter  27.04 
 
 		 587 aa  145  3e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1384  sodium:solute symporter family protein  27.05 
 
 		 588 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0638  Na+/solute symporter  25.91 
 
 		 538 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1358  Na+/solute symporter  27.35 
 
 		 587 aa  139  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00027915  normal  0.0566975 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16021  Na+/proline symporter  26.97 
 
 		 587 aa  134  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18811  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  26.75 
 
 		 583 aa  122  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0257597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2062  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  25.55 
 
 		 584 aa  120  7e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1011  Na+/proline symporter  26 
 
 		 583 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2245  Na+/solute symporter  26.88 
 
 		 609 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04421  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  26.37 
 
 		 589 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.82 
 
 		 533 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0610  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  25.39 
 
 		 587 aa  110  8.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.922091  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13128  sodium/glucose cotransporter  25.05 
 
 		 575 aa  109  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.194229  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  23.42 
 
 		 523 aa  103  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  26.59 
 
 		 530 aa  102  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  25.09 
 
 		 598 aa  94  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0171  SSS sodium solute transporter superfamily  26.1 
 
 		 520 aa  93.6  9e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0745729 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  25 
 
 		 551 aa  93.6  9e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  25.49 
 
 		 513 aa  89  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  23.49 
 
 		 492 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  22.89 
 
 		 487 aa  87.4  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  23.09 
 
 		 492 aa  87.4  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  22.69 
 
 		 493 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  22.69 
 
 		 492 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  22.95 
 
 		 492 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  22.69 
 
 		 493 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  22.69 
 
 		 493 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  22.69 
 
 		 492 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  24.81 
 
 		 487 aa  84.7  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  24.65 
 
 		 506 aa  84.3  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.8 
 
 		 565 aa  84.3  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0416  sodium/proline symporter  23.33 
 
 		 495 aa  84  0.000000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.292846  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  22.69 
 
 		 492 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  24.84 
 
 		 483 aa  82  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  24.85 
 
 		 484 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  25.63 
 
 		 483 aa  79.7  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3463  proline/sodium symporter  23.31 
 
 		 495 aa  78.6  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  23.54 
 
 		 497 aa  78.6  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0491  sodium/proline symporter  24.52 
 
 		 495 aa  78.6  0.0000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  22.46 
 
 		 492 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0041  sodium/pantothenate symporter  22.3 
 
 		 468 aa  78.2  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.3030600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  25.48 
 
 		 509 aa  78.2  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4147  sodium/proline symporter  22.34 
 
 		 497 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1716  GTP-binding protein, HSR1-releated protein  23.91 
 
 		 498 aa  77  0.0000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.066858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  26.58 
 
 		 492 aa  76.6  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.12 
 
 		 522 aa  76.3  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  22.89 
 
 		 492 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01675  proline/sodium symporter  24.01 
 
 		 504 aa  74.7  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.068924  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1229  sodium/proline symporter  24.27 
 
 		 504 aa  74.7  0.000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  26.81 
 
 		 488 aa  74.7  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0149  Sodium/proline symporter  22.11 
 
 		 498 aa  74.3  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  26.14 
 
 		 492 aa  74.3  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0525  SSS sodium solute transporter superfamily  24.76 
 
 		 522 aa  73.9  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.692758  unclonable  0.0000000000137784 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  22.53 
 
 		 518 aa  73.9  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  23.9 
 
 		 592 aa  73.6  0.000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2358  Na+/solute symporter  27.45 
 
 		 472 aa  73.9  0.000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.552943  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.04 
 
 		 520 aa  73.6  0.000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.43 
 
 		 520 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  22.48 
 
 		 492 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3013  sodium/proline symporter  23.58 
 
 		 498 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  23.43 
 
 		 493 aa  73.6  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  22.59 
 
 		 492 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  22.7 
 
 		 492 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  23.79 
 
 		 520 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  22.59 
 
 		 492 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  22.59 
 
 		 492 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  22.7 
 
 		 492 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0195  sodium:solute symporter family protein  27.46 
 
 		 468 aa  72  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  26.58 
 
 		 492 aa  72  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1081  sodium/proline symporter  22.88 
 
 		 498 aa  71.6  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000772394  unclonable  0.00000000000701401 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  23 
 
 		 482 aa  72  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2608  sodium/proline symporter  25.97 
 
 		 483 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0498264  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  24.94 
 
 		 485 aa  71.6  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4843  SSS sodium solute transporter superfamily  22.86 
 
 		 544 aa  71.6  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.81 
 
 		 526 aa  71.2  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1463  sodium/proline symporter  27.18 
 
 		 483 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.169082  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4898  solute/sodium symporter (SSS) family protein  23.06 
 
 		 489 aa  70.9  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3490  sodium/proline symporter  23.17 
 
 		 498 aa  70.9  0.00000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.753009  normal  0.0181041 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6588  SSS sodium solute transporter superfamily  22.08 
 
 		 529 aa  70.5  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2763  Na+/solute symporter  28.47 
 
 		 472 aa  70.5  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  22.97 
 
 		 492 aa  70.5  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  24.9 
 
 		 483 aa  70.5  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  22.53 
 
 		 492 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1250  sodium/proline symporter  23.62 
 
 		 496 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07840  sodium/ prolin symporter  23.66 
 
 		 544 aa  70.1  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4206  Na+/solute symporter  22.91 
 
 		 490 aa  70.1  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153775  normal  0.0109856 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>