More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3013 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0083  sodium/proline symporter  84.31 
 
 		 498 aa  775    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0149  Sodium/proline symporter  85.54 
 
 		 498 aa  833    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4283  sodium/proline symporter  84.74 
 
 		 498 aa  806    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4147  sodium/proline symporter  75.56 
 
 		 497 aa  775    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3847  sodium/proline symporter  84.91 
 
 		 498 aa  821    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3940  sodium/proline symporter  85.51 
 
 		 498 aa  824    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0764  sodium/proline symporter  86.55 
 
 		 498 aa  844    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3013  sodium/proline symporter  100 
 
 		 498 aa  998    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01675  proline/sodium symporter  73.15 
 
 		 504 aa  756    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.068924  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4423  sodium/proline symporter  84.54 
 
 		 498 aa  806    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4055  sodium/proline symporter  85.31 
 
 		 498 aa  823    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4236  sodium/proline symporter  84.34 
 
 		 498 aa  805    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0117  sodium/proline symporter  84.54 
 
 		 498 aa  806    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0492  sodium/proline symporter  66.53 
 
 		 498 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3463  proline/sodium symporter  62.89 
 
 		 495 aa  598  1e-169  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1653  sodium/proline symporter  60.44 
 
 		 511 aa  587  1e-166  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02712  proline/sodium symporter  60.16 
 
 		 493 aa  586  1e-166  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.076903  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1415  SSS family Na(+)/proline symporter  58.16 
 
 		 499 aa  546  1e-154  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.631202 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  54.9 
 
 		 492 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  53.56 
 
 		 492 aa  535  1e-151  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  53.77 
 
 		 492 aa  536  1e-151  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  53.77 
 
 		 487 aa  535  1e-151  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  53.77 
 
 		 492 aa  535  1e-151  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  53.56 
 
 		 493 aa  532  1e-150  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  53.56 
 
 		 493 aa  533  1e-150  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  53.56 
 
 		 493 aa  533  1e-150  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  53.56 
 
 		 492 aa  531  1e-150  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  53.56 
 
 		 492 aa  533  1e-150  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  53.36 
 
 		 492 aa  528  1e-149  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1576  Sodium/proline symporter  57.55 
 
 		 499 aa  530  1e-149  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.84214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1939  sodium/proline symporter  57.64 
 
 		 498 aa  528  1e-148  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  54.45 
 
 		 492 aa  520  1e-146  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  55.33 
 
 		 492 aa  521  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  54.45 
 
 		 492 aa  519  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  55.69 
 
 		 484 aa  520  1e-146  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  54.45 
 
 		 492 aa  520  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  54.03 
 
 		 492 aa  518  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  55.51 
 
 		 492 aa  520  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  54.45 
 
 		 492 aa  519  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2670  sodium/proline symporter  53.28 
 
 		 541 aa  519  1e-146  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  54.45 
 
 		 492 aa  519  1e-146  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  54.9 
 
 		 492 aa  520  1e-146  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  54.9 
 
 		 492 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  56.21 
 
 		 488 aa  514  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  55.6 
 
 		 485 aa  514  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1440  proline permease  51.3 
 
 		 511 aa  496  1e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0406998  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1248  Sodium/proline symporter  54.56 
 
 		 496 aa  495  1e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.126391  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1957  high affinity proline permease  50.7 
 
 		 512 aa  487  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1991  high affinity proline permease  50.7 
 
 		 512 aa  487  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1860  sodium/proline symporter  52.65 
 
 		 496 aa  486  1e-136  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0914218  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1156  sodium/proline symporter  50.91 
 
 		 486 aa  476  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.307204  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  50 
 
 		 493 aa  455  1e-127  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  47.85 
 
 		 482 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1326  Sodium/proline symporter  49.69 
 
 		 488 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0529188  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1675  sodium/proline permease  49.67 
 
 		 489 aa  449  1e-125  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1229  sodium/proline symporter  47.14 
 
 		 504 aa  451  1e-125  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1854  sodium/proline permease  49.67 
 
 		 489 aa  449  1e-125  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.794377  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  48.56 
 
 		 483 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1242  sodium/proline symporter  51.58 
 
 		 491 aa  447  1.0000000000000001e-124  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1494  sodium/proline permease  49.46 
 
 		 489 aa  447  1.0000000000000001e-124  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.858456  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  48.96 
 
 		 493 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  50.62 
 
 		 483 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0416  sodium/proline symporter  46.29 
 
 		 495 aa  435  1e-121  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.292846  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  49.48 
 
 		 488 aa  437  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1520  Sodium/proline symporter  48.58 
 
 		 483 aa  433  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2608  sodium/proline symporter  47.74 
 
 		 483 aa  434  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0498264  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1334  sodium/proline symporter  46.48 
 
 		 499 aa  430  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04170  sodium/proline symporter  47.38 
 
 		 499 aa  429  1e-119  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0302673 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1250  sodium/proline symporter  47.98 
 
 		 496 aa  430  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  49.02 
 
 		 482 aa  428  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54150  sodium/proline symporter PutP  48.19 
 
 		 506 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0453  Sodium/proline symporter  47.17 
 
 		 494 aa  422  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1731  sodium/proline symporter  46.56 
 
 		 496 aa  425  1e-117  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.253035  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4210  sodium/proline symporter  47.34 
 
 		 494 aa  424  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4018  sodium/proline symporter  47.95 
 
 		 494 aa  422  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2686  sodium/proline symporter  47.65 
 
 		 486 aa  425  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4736  sodium/proline symporter PutP  47.39 
 
 		 506 aa  423  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4946  sodium/proline symporter  47.66 
 
 		 492 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1081  sodium/proline symporter  48.99 
 
 		 498 aa  421  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000772394  unclonable  0.00000000000701401 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4818  sodium/proline symporter  47.86 
 
 		 492 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.88778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0507  Na+/solute symporter  48.99 
 
 		 519 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.550362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0522  sodium/proline symporter  47.25 
 
 		 492 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550728  normal  0.0854838 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2770  sodium/proline symporter  47.23 
 
 		 483 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000703765  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2865  sodium/proline symporter  47.23 
 
 		 483 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.468907 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07840  sodium/ prolin symporter  49.33 
 
 		 544 aa  419  1e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1398  sodium/proline symporter  48.93 
 
 		 483 aa  421  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0934266  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1463  sodium/proline symporter  47.56 
 
 		 483 aa  421  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.169082  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1588  sodium/proline symporter  47.23 
 
 		 483 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000493204  unclonable  0.00000000000453194 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2790  sodium/proline symporter  47.23 
 
 		 483 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276408  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5016  proline permease  48 
 
 		 495 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4995  sodium/proline symporter  47.45 
 
 		 492 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2469  sodium/proline symporter  48.39 
 
 		 497 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00121427  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1451  sodium/proline symporter  46.95 
 
 		 483 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0423407  unclonable  0.000000000084673 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3085  sodium/proline symporter  47.66 
 
 		 484 aa  415  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.198592 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2930  sodium/proline symporter  47.13 
 
 		 494 aa  412  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0527151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1542  sodium/proline symporter  46.76 
 
 		 502 aa  412  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.13082 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0491  sodium/proline symporter  46.09 
 
 		 495 aa  414  1e-114  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2265  sodium/proline symporter  46.93 
 
 		 494 aa  410  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2367  sodium/proline symporter  46.93 
 
 		 494 aa  410  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0234397  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2039  proline permease  46.93 
 
 		 494 aa  410  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.241899 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>