224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2033 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2033  Na+/solute symporter  100 
 
 		 625 aa  1243    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2441  Na+/solute symporter  46.57 
 
 		 625 aa  560  1e-158  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231666  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0129  Na+/solute symporter  45.22 
 
 		 596 aa  553  1e-156  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0303  Na+/solute symporter  44.59 
 
 		 596 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2072  Na+/solute symporter  32.18 
 
 		 609 aa  269  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0164847 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2288  Na+/solute symporter  32.97 
 
 		 593 aa  259  8e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.175475 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0565  Na+/solute symporter  32.27 
 
 		 594 aa  248  2e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.426275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1526  Na+/solute symporter  26.46 
 
 		 586 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1178  sodium:solute symporter family protein  26.68 
 
 		 585 aa  150  7e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.107894 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1358  Na+/solute symporter  27.24 
 
 		 587 aa  142  9.999999999999999e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00027915  normal  0.0566975 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1384  sodium:solute symporter family protein  24.66 
 
 		 588 aa  140  7e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1324  Na+/solute symporter  26.3 
 
 		 603 aa  137  6.0000000000000005e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1083  Na+/solute symporter  25.89 
 
 		 588 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0991073  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1011  Na+/proline symporter  26.19 
 
 		 583 aa  131  3e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18811  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  26.76 
 
 		 583 aa  130  6e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0257597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2672  Na+/solute symporter  23.8 
 
 		 599 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0961  Na+/solute symporter  25.42 
 
 		 587 aa  127  8.000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1120  Na+/solute symporter  27.61 
 
 		 587 aa  124  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.13754  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1755  hypothetical protein  26.09 
 
 		 577 aa  120  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16021  Na+/proline symporter  25.52 
 
 		 587 aa  117  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2062  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  25.31 
 
 		 584 aa  114  7.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0638  Na+/solute symporter  24.1 
 
 		 538 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0610  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  25.6 
 
 		 587 aa  107  4e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.922091  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13128  sodium/glucose cotransporter  23 
 
 		 575 aa  102  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.194229  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  27.22 
 
 		 530 aa  97.8  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  23.72 
 
 		 523 aa  94.4  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2245  Na+/solute symporter  23.13 
 
 		 609 aa  93.6  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04421  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  24.59 
 
 		 589 aa  92.8  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.75 
 
 		 526 aa  92  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.15 
 
 		 533 aa  91.3  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.25 
 
 		 567 aa  89  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.25 
 
 		 565 aa  88.2  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  23.86 
 
 		 537 aa  83.6  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  25.77 
 
 		 520 aa  82  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1671  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.87 
 
 		 593 aa  81.3  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302135 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6118  SSS sodium solute transporter superfamily  22.09 
 
 		 562 aa  80.1  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  26.45 
 
 		 598 aa  79.3  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.11 
 
 		 542 aa  78.2  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  25.26 
 
 		 520 aa  77.8  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0993  SSS sodium solute transporter superfamily  24.25 
 
 		 569 aa  76.6  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0554078  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3621  SSS sodium solute transporter superfamily  24.34 
 
 		 596 aa  76.6  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.434287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  22.72 
 
 		 557 aa  75.9  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3541  Na+/solute symporter  23.88 
 
 		 597 aa  74.3  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165749  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0171  SSS sodium solute transporter superfamily  26 
 
 		 520 aa  73.9  0.000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0745729 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04060  SSS sodium solute transporter  23.31 
 
 		 565 aa  73.6  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.4 
 
 		 548 aa  73.2  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1859  SSS sodium solute transporter superfamily  23.15 
 
 		 551 aa  72.8  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.33 
 
 		 519 aa  72  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  23.17 
 
 		 520 aa  70.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.12 
 
 		 523 aa  70.9  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  22.04 
 
 		 557 aa  70.5  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  21.88 
 
 		 520 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3709  SSS sodium solute transporter superfamily  22.69 
 
 		 564 aa  68.6  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174317  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1939  sodium/proline symporter  25.31 
 
 		 498 aa  66.6  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1952  Na+/solute symporter  24.37 
 
 		 638 aa  65.9  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1860  sodium/proline symporter  24.46 
 
 		 496 aa  65.9  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0914218  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  23.53 
 
 		 506 aa  64.7  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  25.5 
 
 		 497 aa  65.1  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  20.85 
 
 		 551 aa  64.3  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0672  Na+/solute symporter  21.68 
 
 		 633 aa  63.9  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  25.37 
 
 		 483 aa  63.5  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0355  Na+/solute symporter  23.43 
 
 		 492 aa  63.2  0.00000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4407  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.43 
 
 		 613 aa  63.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0343463  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  23.91 
 
 		 492 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14290  SSS sodium solute transporter  22.17 
 
 		 566 aa  62.4  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  23.21 
 
 		 474 aa  62  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.99 
 
 		 522 aa  62.4  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07840  sodium/ prolin symporter  24.49 
 
 		 544 aa  61.6  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1248  Sodium/proline symporter  23.17 
 
 		 496 aa  61.2  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.126391  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5244  SSS sodium solute transporter superfamily  22.14 
 
 		 545 aa  60.8  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  21.53 
 
 		 526 aa  60.5  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0592432  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  21.78 
 
 		 482 aa  60.5  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0864  hypothetical protein  25.69 
 
 		 524 aa  60.1  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.983965  normal  0.0488094 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  23.05 
 
 		 492 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  23.2 
 
 		 492 aa  59.7  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  23.09 
 
 		 492 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  23.09 
 
 		 492 aa  59.3  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  22.7 
 
 		 492 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6588  SSS sodium solute transporter superfamily  23.24 
 
 		 529 aa  59.3  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  23.09 
 
 		 492 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  32.58 
 
 		 520 aa  59.3  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  23.67 
 
 		 487 aa  59.3  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  23.09 
 
 		 492 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  21.78 
 
 		 483 aa  59.7  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  23.09 
 
 		 492 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0195  sodium:solute symporter family protein  26.38 
 
 		 468 aa  58.5  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  23.68 
 
 		 487 aa  58.9  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  22.89 
 
 		 492 aa  58.5  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  23.52 
 
 		 493 aa  58.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  23.52 
 
 		 492 aa  58.5  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0375  Na+/solute symporter  20.24 
 
 		 478 aa  58.2  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197469 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  23.49 
 
 		 488 aa  57.8  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  21.96 
 
 		 482 aa  57.8  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  23.68 
 
 		 492 aa  57.4  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1264  sodium:proline symporter (proline permease)  24.14 
 
 		 639 aa  57.4  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0769  Na+/solute symporter  22.45 
 
 		 487 aa  57.8  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00939685 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  23.68 
 
 		 492 aa  57.8  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  23.68 
 
 		 493 aa  57.4  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  23.68 
 
 		 493 aa  57.4  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  23.68 
 
 		 492 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>