More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1526 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0961  Na+/solute symporter  79.56 
 
 
587 aa  924    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1526  Na+/solute symporter  100 
 
 
586 aa  1168    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1358  Na+/solute symporter  74.96 
 
 
587 aa  876    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00027915  normal  0.0566975 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1178  sodium:solute symporter family protein  83.11 
 
 
585 aa  986    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.107894 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1384  sodium:solute symporter family protein  85.37 
 
 
588 aa  1015    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1083  Na+/solute symporter  79.42 
 
 
588 aa  941    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0991073  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1120  Na+/solute symporter  74.96 
 
 
587 aa  883    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.13754  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2245  Na+/solute symporter  49.91 
 
 
609 aa  525  1e-147  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2672  Na+/solute symporter  45.9 
 
 
599 aa  520  1e-146  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13128  sodium/glucose cotransporter  43.12 
 
 
575 aa  432  1e-119  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.194229  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1324  Na+/solute symporter  37.99 
 
 
603 aa  358  9.999999999999999e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1755  hypothetical protein  38.74 
 
 
577 aa  337  2.9999999999999997e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2062  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  36.28 
 
 
584 aa  280  4e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039516  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16021  Na+/proline symporter  32.44 
 
 
587 aa  279  9e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1011  Na+/proline symporter  33.1 
 
 
583 aa  276  6e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18811  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  33.27 
 
 
583 aa  276  6e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0257597  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04421  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  35.19 
 
 
589 aa  270  7e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0610  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  34.47 
 
 
587 aa  257  5e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.922091  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0638  Na+/solute symporter  29.35 
 
 
538 aa  177  7e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0129  Na+/solute symporter  26.97 
 
 
596 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2033  Na+/solute symporter  26.46 
 
 
625 aa  154  5.9999999999999996e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2441  Na+/solute symporter  26.34 
 
 
625 aa  144  5e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231666  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0303  Na+/solute symporter  25.59 
 
 
596 aa  143  8e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2072  Na+/solute symporter  26.59 
 
 
609 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0164847 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0565  Na+/solute symporter  27.4 
 
 
594 aa  136  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.426275  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2288  Na+/solute symporter  27.08 
 
 
593 aa  134  6e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.175475 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3541  Na+/solute symporter  27.36 
 
 
597 aa  127  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165749  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  27.29 
 
 
461 aa  118  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  27.47 
 
 
461 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  25.55 
 
 
523 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2893  Na+/solute symporter  25.37 
 
 
604 aa  106  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26 
 
 
526 aa  105  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.21 
 
 
522 aa  104  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3587  Na+/solute symporter  23.67 
 
 
556 aa  103  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  25.51 
 
 
520 aa  102  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0289  Na+/solute symporter  25.97 
 
 
590 aa  99.4  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0322805  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  23.81 
 
 
520 aa  97.8  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.17 
 
 
520 aa  97.4  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  26.74 
 
 
479 aa  95.9  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  24.94 
 
 
520 aa  94  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.76 
 
 
520 aa  92.4  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2608  SSS sodium solute transporter superfamily  26.4 
 
 
570 aa  92  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.04 
 
 
519 aa  92  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.63 
 
 
533 aa  91.7  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.01 
 
 
542 aa  90.9  6e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.41 
 
 
523 aa  90.1  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  23.58 
 
 
483 aa  90.1  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  24.81 
 
 
592 aa  89.7  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  24.27 
 
 
482 aa  88.6  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.33 
 
 
548 aa  88.6  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3085  sodium/proline symporter  27 
 
 
484 aa  88.2  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.198592 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.47 
 
 
522 aa  88.2  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  24.56 
 
 
483 aa  88.2  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  24.43 
 
 
537 aa  87.4  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6961  Na+/solute symporter  25.89 
 
 
533 aa  87  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.931741  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  26.61 
 
 
497 aa  86.3  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1653  sodium/proline symporter  23.43 
 
 
511 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  26.41 
 
 
509 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5244  SSS sodium solute transporter superfamily  23.47 
 
 
545 aa  85.5  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.66 
 
 
526 aa  85.9  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0592432  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  27.46 
 
 
461 aa  86.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  25.43 
 
 
518 aa  85.9  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2416  Na+/solute symporter  25.29 
 
 
575 aa  84.7  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.664159  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1398  sodium/proline symporter  23.97 
 
 
483 aa  83.6  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0934266  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.63 
 
 
522 aa  83.2  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  26.39 
 
 
476 aa  83.2  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  23.98 
 
 
483 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  25.17 
 
 
459 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000913  sodium-solute symporter putative  24.35 
 
 
590 aa  82.8  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1463  sodium/proline symporter  24.75 
 
 
483 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.169082  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2686  sodium/proline symporter  24.61 
 
 
486 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3621  SSS sodium solute transporter superfamily  22.03 
 
 
596 aa  82  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.434287  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  24.75 
 
 
530 aa  82  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3355  Na+/solute symporter  25.4 
 
 
517 aa  81.6  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  26.29 
 
 
463 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1451  sodium/proline symporter  23.76 
 
 
483 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0423407  unclonable  0.000000000084673 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  26.07 
 
 
463 aa  80.9  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0297  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.61 
 
 
510 aa  80.9  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.977217  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1588  sodium/proline symporter  23.58 
 
 
483 aa  80.5  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000493204  unclonable  0.00000000000453194 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0304  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.61 
 
 
510 aa  80.9  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2790  sodium/proline symporter  23.58 
 
 
483 aa  80.5  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276408  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2770  sodium/proline symporter  23.58 
 
 
483 aa  80.5  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000703765  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  23.43 
 
 
488 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1152  SSS sodium solute transporter superfamily  23.64 
 
 
562 aa  79.3  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0742973  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1520  Sodium/proline symporter  23.23 
 
 
483 aa  79  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2865  sodium/proline symporter  23.38 
 
 
483 aa  79  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.468907 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  24.24 
 
 
551 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0525  SSS sodium solute transporter superfamily  24.54 
 
 
522 aa  79.3  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.692758  unclonable  0.0000000000137784 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02712  proline/sodium symporter  24.02 
 
 
493 aa  78.6  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.076903  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3463  proline/sodium symporter  25.11 
 
 
495 aa  78.2  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04060  SSS sodium solute transporter  21.96 
 
 
565 aa  78.2  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  23.31 
 
 
493 aa  78.2  0.0000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  23.33 
 
 
472 aa  77.8  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  25.06 
 
 
492 aa  77.8  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  21.68 
 
 
567 aa  77.8  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0672  Na+/solute symporter  22.05 
 
 
633 aa  77.8  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2774  SSS sodium solute transporter superfamily  24.47 
 
 
529 aa  77.4  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00224729  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.93 
 
 
561 aa  77.4  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  25.52 
 
 
460 aa  77  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4728  SSS sodium solute transporter superfamily  24.2 
 
 
549 aa  77  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  hitchhiker  0.00040203 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>