More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2672 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2672  Na+/solute symporter  100 
 
 		 599 aa  1201    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1384  sodium:solute symporter family protein  46.48 
 
 		 588 aa  521  1e-146  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1526  Na+/solute symporter  45.9 
 
 		 586 aa  520  1e-146  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1178  sodium:solute symporter family protein  45.75 
 
 		 585 aa  506  9.999999999999999e-143  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.107894 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1083  Na+/solute symporter  46.15 
 
 		 588 aa  508  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0991073  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1120  Na+/solute symporter  45.34 
 
 		 587 aa  496  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.13754  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1358  Na+/solute symporter  45.63 
 
 		 587 aa  493  9.999999999999999e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00027915  normal  0.0566975 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0961  Na+/solute symporter  44.97 
 
 		 587 aa  494  9.999999999999999e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2245  Na+/solute symporter  46.35 
 
 		 609 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13128  sodium/glucose cotransporter  40.86 
 
 		 575 aa  442  1e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.194229  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1324  Na+/solute symporter  37.42 
 
 		 603 aa  380  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1755  hypothetical protein  38.49 
 
 		 577 aa  368  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18811  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  34.72 
 
 		 583 aa  324  2e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0257597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16021  Na+/proline symporter  34.98 
 
 		 587 aa  319  9e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1011  Na+/proline symporter  34 
 
 		 583 aa  317  6e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2062  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  35.97 
 
 		 584 aa  316  6e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04421  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  36.64 
 
 		 589 aa  299  1e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0610  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  37.35 
 
 		 587 aa  289  8e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.922091  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0638  Na+/solute symporter  29.14 
 
 		 538 aa  190  7e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2072  Na+/solute symporter  24.41 
 
 		 609 aa  150  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0164847 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0129  Na+/solute symporter  26.63 
 
 		 596 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0565  Na+/solute symporter  25.09 
 
 		 594 aa  137  8e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.426275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3541  Na+/solute symporter  27.72 
 
 		 597 aa  133  9e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165749  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2033  Na+/solute symporter  23.8 
 
 		 625 aa  129  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2288  Na+/solute symporter  24.87 
 
 		 593 aa  129  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.175475 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0303  Na+/solute symporter  23.67 
 
 		 596 aa  127  5e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3587  Na+/solute symporter  25.18 
 
 		 556 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  25 
 
 		 523 aa  114  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  25.61 
 
 		 483 aa  113  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  25.41 
 
 		 461 aa  111  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.86 
 
 		 526 aa  110  7.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0672  Na+/solute symporter  23.65 
 
 		 633 aa  109  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  22.95 
 
 		 520 aa  106  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.19 
 
 		 565 aa  106  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  27.17 
 
 		 592 aa  105  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.83 
 
 		 522 aa  105  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  25.17 
 
 		 461 aa  104  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2441  Na+/solute symporter  21.71 
 
 		 625 aa  103  7e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231666  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.94 
 
 		 522 aa  101  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  25.77 
 
 		 483 aa  100  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.96 
 
 		 520 aa  100  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2416  Na+/solute symporter  26.04 
 
 		 575 aa  100  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.664159  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3355  Na+/solute symporter  26.67 
 
 		 517 aa  98.6  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  24.36 
 
 		 479 aa  98.6  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  22.84 
 
 		 537 aa  98.2  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2774  SSS sodium solute transporter superfamily  23.67 
 
 		 529 aa  97.8  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00224729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.78 
 
 		 520 aa  97.1  7e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6588  SSS sodium solute transporter superfamily  26.33 
 
 		 529 aa  97.1  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.04 
 
 		 519 aa  96.3  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  23.35 
 
 		 520 aa  96.3  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  24.16 
 
 		 476 aa  95.5  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1952  Na+/solute symporter  22.29 
 
 		 638 aa  95.1  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.97 
 
 		 567 aa  95.5  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.64 
 
 		 542 aa  94.7  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  25.44 
 
 		 509 aa  94.7  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2608  SSS sodium solute transporter superfamily  24.47 
 
 		 570 aa  94.4  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  24.61 
 
 		 520 aa  93.6  8e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.6 
 
 		 533 aa  91.3  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.38 
 
 		 548 aa  90.9  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  21.02 
 
 		 472 aa  88.2  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5244  SSS sodium solute transporter superfamily  22.91 
 
 		 545 aa  88.2  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  23.45 
 
 		 557 aa  87.8  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  26.11 
 
 		 530 aa  87.4  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02564  hypothetical protein  25.26 
 
 		 581 aa  87.4  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6961  Na+/solute symporter  26.1 
 
 		 533 aa  86.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.931741  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04816  alkaline phosphatase synthesis sensor protein phoR  24.14 
 
 		 513 aa  86.3  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.54 
 
 		 523 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0416  sodium/proline symporter  24.64 
 
 		 495 aa  84  0.000000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.292846  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4728  SSS sodium solute transporter superfamily  21.94 
 
 		 549 aa  83.6  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  hitchhiker  0.00040203 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  23.75 
 
 		 487 aa  83.6  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  24.15 
 
 		 459 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2732  SSS sodium solute transporter superfamily  24.29 
 
 		 561 aa  82.8  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.91 
 
 		 522 aa  82.8  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  23.39 
 
 		 551 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2893  Na+/solute symporter  24.32 
 
 		 604 aa  82  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  23.96 
 
 		 493 aa  82  0.00000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1859  SSS sodium solute transporter superfamily  24.17 
 
 		 551 aa  81.6  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  30.16 
 
 		 500 aa  81.3  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  24.31 
 
 		 557 aa  80.9  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  23.32 
 
 		 484 aa  80.5  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  23.43 
 
 		 492 aa  80.5  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  26.67 
 
 		 497 aa  80.5  0.00000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02712  proline/sodium symporter  21.98 
 
 		 493 aa  79.7  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.076903  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  21.99 
 
 		 492 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05410  Sodium:solute symporter  22.82 
 
 		 542 aa  79.7  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000184365  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  21.99 
 
 		 492 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  24.12 
 
 		 483 aa  79.3  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000913  sodium-solute symporter putative  22.43 
 
 		 590 aa  79.3  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  21.99 
 
 		 492 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  21.12 
 
 		 526 aa  79  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0592432  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2048  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.14 
 
 		 550 aa  78.6  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  22.62 
 
 		 492 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  22.62 
 
 		 492 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  22.62 
 
 		 492 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3635  SSS sodium solute transporter superfamily  22.43 
 
 		 565 aa  77.8  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.85975  normal  0.450055 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.39 
 
 		 561 aa  77.4  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  23.95 
 
 		 488 aa  77  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1242  sodium/proline symporter  22.97 
 
 		 491 aa  77  0.0000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  22.18 
 
 		 492 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  23.11 
 
 		 488 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>