More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0491 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  100 
 
 		 509 aa  1004    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  42.37 
 
 		 520 aa  376  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  41.71 
 
 		 522 aa  377  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  41.48 
 
 		 520 aa  374  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  41.41 
 
 		 522 aa  361  1e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4728  SSS sodium solute transporter superfamily  40.88 
 
 		 549 aa  358  9.999999999999999e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  hitchhiker  0.00040203 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  40.46 
 
 		 592 aa  358  1.9999999999999998e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  42.2 
 
 		 520 aa  356  6.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  42.41 
 
 		 520 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5244  SSS sodium solute transporter superfamily  39.56 
 
 		 545 aa  352  1e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  38.7 
 
 		 523 aa  350  5e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  40 
 
 		 520 aa  346  6e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  39.7 
 
 		 522 aa  345  1e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3116  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  39.66 
 
 		 522 aa  339  8e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  40.85 
 
 		 519 aa  336  7.999999999999999e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1927  SSS sodium solute transporter superfamily  39.22 
 
 		 568 aa  327  3e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0029053  normal  0.303256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1152  SSS sodium solute transporter superfamily  37.59 
 
 		 562 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0742973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5697  SSS sodium solute transporter superfamily  44.01 
 
 		 536 aa  324  2e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.479819 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3072  SSS sodium solute transporter superfamily  39.85 
 
 		 539 aa  323  4e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00704051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  37.43 
 
 		 548 aa  320  3e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  41.97 
 
 		 551 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  37.34 
 
 		 561 aa  310  4e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  41.93 
 
 		 561 aa  310  5e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3635  SSS sodium solute transporter superfamily  40.3 
 
 		 565 aa  302  9e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.85975  normal  0.450055 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  37.71 
 
 		 523 aa  299  9e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  41.07 
 
 		 533 aa  297  3e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  36.31 
 
 		 526 aa  289  7e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2732  SSS sodium solute transporter superfamily  41.2 
 
 		 561 aa  288  2e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0087  putative symporter YidK  35.44 
 
 		 529 aa  279  7e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0338  putative symporter YidK  35.25 
 
 		 562 aa  278  1e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000369581  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0970  SSS sodium solute transporter superfamily  44.3 
 
 		 765 aa  277  4e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000363528  normal  0.258421 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4044  putative symporter YidK  35.67 
 
 		 571 aa  277  4e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.978949 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5111  putative symporter YidK  35.87 
 
 		 571 aa  276  4e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.393136 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03563  predicted transporter  35.48 
 
 		 571 aa  276  5e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0024  SSS sodium solute transporter superfamily  35.48 
 
 		 571 aa  276  5e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03506  hypothetical protein  35.48 
 
 		 571 aa  276  5e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4187  putative symporter YidK  35.48 
 
 		 571 aa  276  9e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0610  putative symporter YidK  34.16 
 
 		 551 aa  274  3e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.266517  normal  0.0320256 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  34.65 
 
 		 565 aa  273  6e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  38.67 
 
 		 557 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  39.61 
 
 		 557 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  33.6 
 
 		 598 aa  248  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1283  putative symporter YidK  35.81 
 
 		 531 aa  241  2e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1859  SSS sodium solute transporter superfamily  34.77 
 
 		 551 aa  236  6e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3270  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  35 
 
 		 474 aa  232  1e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.291687  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2201  putative symporter YidK  30.84 
 
 		 530 aa  231  2e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5643  putative symporter YidK  30.88 
 
 		 532 aa  230  5e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0528726  normal  0.86029 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4019  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  34.73 
 
 		 474 aa  229  9e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000206243 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0578  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  32.77 
 
 		 473 aa  226  7e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.493945  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.57 
 
 		 526 aa  224  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0592432  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2774  SSS sodium solute transporter superfamily  29.04 
 
 		 529 aa  202  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00224729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3621  SSS sodium solute transporter superfamily  29.31 
 
 		 596 aa  192  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.434287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.97 
 
 		 486 aa  186  8e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4098  Na+/solute symporter  32.07 
 
 		 486 aa  176  8e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0584341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.83 
 
 		 542 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04060  SSS sodium solute transporter  28.41 
 
 		 565 aa  173  7.999999999999999e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  26.7 
 
 		 537 aa  169  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3709  SSS sodium solute transporter superfamily  28.5 
 
 		 564 aa  160  5e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174317  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.22 
 
 		 567 aa  160  5e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6118  SSS sodium solute transporter superfamily  27.66 
 
 		 562 aa  156  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4407  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.17 
 
 		 613 aa  156  8e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0343463  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1671  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.61 
 
 		 593 aa  155  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302135 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0993  SSS sodium solute transporter superfamily  25.74 
 
 		 569 aa  153  8.999999999999999e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0554078  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  28.88 
 
 		 530 aa  144  5e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0609  sodium/solute symporter  27.58 
 
 		 513 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.952879  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  28.37 
 
 		 483 aa  136  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02564  hypothetical protein  24.27 
 
 		 581 aa  134  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3355  Na+/solute symporter  29.6 
 
 		 517 aa  134  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2048  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.83 
 
 		 550 aa  134  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3022  SSS sodium solute transporter superfamily  27.66 
 
 		 883 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.61129  normal  0.844759 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  30.18 
 
 		 487 aa  131  4.0000000000000003e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14290  SSS sodium solute transporter  25.74 
 
 		 566 aa  130  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0171  SSS sodium solute transporter superfamily  28.1 
 
 		 520 aa  130  8.000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0745729 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0176  sodium:solute transporter  27.21 
 
 		 505 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04816  alkaline phosphatase synthesis sensor protein phoR  27.17 
 
 		 513 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0179  sodium/solute symporter family protein  27.21 
 
 		 505 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3985  SSS sodium solute transporter superfamily  25.96 
 
 		 527 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000567258  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2466  SSS sodium solute transporter superfamily  27.31 
 
 		 509 aa  127  7e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4963400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.53 
 
 		 526 aa  125  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495731  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1193  sodium-glucose/galactose cotransporter  27.73 
 
 		 498 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0641857  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0990  SSS sodium solute transporter superfamily  24.89 
 
 		 560 aa  124  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4170  Na+/solute symporter  25.32 
 
 		 526 aa  124  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0688566  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6961  Na+/solute symporter  27.62 
 
 		 533 aa  124  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.931741  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03377  sodium:solute symporter family protein  27.4 
 
 		 523 aa  124  5e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1238  sodium-glucose/galactose cotransporter  27.54 
 
 		 498 aa  124  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.425742 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1223  sodium-glucose/galactose cotransporter  27.54 
 
 		 498 aa  124  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.532882 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1203  sodium-glucose/galactose cotransporter  27.54 
 
 		 498 aa  124  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.410205 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0525  SSS sodium solute transporter superfamily  27.7 
 
 		 522 aa  121  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.692758  unclonable  0.0000000000137784 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0297  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.42 
 
 		 510 aa  119  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.977217  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0304  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.42 
 
 		 510 aa  119  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2815  SSS sodium solute transporter superfamily  25.43 
 
 		 527 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000913  sodium-solute symporter putative  26.32 
 
 		 590 aa  118  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1817  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.6 
 
 		 484 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3321  sodium/panthothenate symporter  27.14 
 
 		 494 aa  117  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1893  Na+/myo-inositol cotransporter  33.66 
 
 		 234 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0549999  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13128  sodium/glucose cotransporter  25 
 
 		 575 aa  115  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.194229  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6588  SSS sodium solute transporter superfamily  25.12 
 
 		 529 aa  114  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0610  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  31.59 
 
 		 587 aa  114  6e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.922091  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  25.39 
 
 		 486 aa  113  7.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3587  Na+/solute symporter  25.52 
 
 		 556 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>