More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_04421 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1011  Na+/proline symporter  66.49 
 
 
583 aa  784    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0610  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  75.82 
 
 
587 aa  764    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.922091  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2062  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  76.86 
 
 
584 aa  796    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039516  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16021  Na+/proline symporter  71.87 
 
 
587 aa  824    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18811  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  66.49 
 
 
583 aa  784    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0257597  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04421  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  100 
 
 
589 aa  1138    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1755  hypothetical protein  58.5 
 
 
577 aa  594  1e-168  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1324  Na+/solute symporter  50.42 
 
 
603 aa  563  1.0000000000000001e-159  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2672  Na+/solute symporter  36.54 
 
 
599 aa  363  4e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1526  Na+/solute symporter  35.99 
 
 
586 aa  329  7e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13128  sodium/glucose cotransporter  32.45 
 
 
575 aa  323  6e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.194229  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1384  sodium:solute symporter family protein  35.28 
 
 
588 aa  312  9e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0961  Na+/solute symporter  33.8 
 
 
587 aa  309  9e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1178  sodium:solute symporter family protein  34.02 
 
 
585 aa  307  3e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.107894 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2245  Na+/solute symporter  39.12 
 
 
609 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1358  Na+/solute symporter  34.62 
 
 
587 aa  297  4e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00027915  normal  0.0566975 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1083  Na+/solute symporter  33.74 
 
 
588 aa  296  7e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0991073  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1120  Na+/solute symporter  33.28 
 
 
587 aa  293  6e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.13754  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0638  Na+/solute symporter  31.31 
 
 
538 aa  177  6e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0129  Na+/solute symporter  27.57 
 
 
596 aa  162  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0303  Na+/solute symporter  25.72 
 
 
596 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2072  Na+/solute symporter  27.54 
 
 
609 aa  144  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0164847 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2441  Na+/solute symporter  26.55 
 
 
625 aa  139  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231666  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  29.76 
 
 
592 aa  139  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2288  Na+/solute symporter  26.79 
 
 
593 aa  136  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.175475 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0565  Na+/solute symporter  27.43 
 
 
594 aa  132  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.426275  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  27.88 
 
 
523 aa  126  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2033  Na+/solute symporter  25.56 
 
 
625 aa  125  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  29.03 
 
 
509 aa  124  7e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1859  SSS sodium solute transporter superfamily  26.53 
 
 
551 aa  123  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  29.93 
 
 
557 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6588  SSS sodium solute transporter superfamily  24.49 
 
 
529 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3541  Na+/solute symporter  26 
 
 
597 aa  112  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165749  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3985  SSS sodium solute transporter superfamily  24.66 
 
 
527 aa  110  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000567258  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  29.11 
 
 
557 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  27.1 
 
 
551 aa  107  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  27.03 
 
 
520 aa  108  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.12 
 
 
565 aa  107  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  24.84 
 
 
483 aa  104  6e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2893  Na+/solute symporter  27.41 
 
 
604 aa  103  7e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  25.18 
 
 
537 aa  103  8e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.7 
 
 
533 aa  103  8e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.48 
 
 
542 aa  103  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  26.1 
 
 
520 aa  102  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  29.28 
 
 
479 aa  102  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  26.79 
 
 
460 aa  102  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  26.26 
 
 
487 aa  102  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.3 
 
 
526 aa  101  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0592432  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.65 
 
 
526 aa  101  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.97 
 
 
522 aa  100  8e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03377  sodium:solute symporter family protein  26 
 
 
523 aa  99.8  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  27.1 
 
 
530 aa  100  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  25.77 
 
 
474 aa  99.4  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.13 
 
 
567 aa  99  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.2 
 
 
522 aa  99.4  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  26.44 
 
 
461 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2927  Na+/solute symporter  29.15 
 
 
491 aa  98.6  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  25 
 
 
476 aa  98.2  4e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  26.8 
 
 
483 aa  97.8  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3587  Na+/solute symporter  22.08 
 
 
556 aa  97.4  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  27.07 
 
 
483 aa  96.7  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1660  Na+/solute symporter  28.26 
 
 
489 aa  96.3  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.139174  normal  0.613212 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3355  Na+/solute symporter  27.13 
 
 
517 aa  94.4  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  26.3 
 
 
482 aa  94  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2774  SSS sodium solute transporter superfamily  25.35 
 
 
529 aa  93.6  9e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00224729  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.75 
 
 
523 aa  92.8  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  26.14 
 
 
461 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1248  Sodium/proline symporter  27.56 
 
 
496 aa  91.7  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.126391  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  28.53 
 
 
500 aa  91.3  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  24.89 
 
 
482 aa  91.7  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  25.22 
 
 
461 aa  90.9  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  25.32 
 
 
483 aa  91.3  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04816  alkaline phosphatase synthesis sensor protein phoR  25.1 
 
 
513 aa  90.9  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.43 
 
 
520 aa  89.7  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.94 
 
 
520 aa  89  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1152  SSS sodium solute transporter superfamily  24.45 
 
 
562 aa  89  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0742973  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  25.18 
 
 
520 aa  89  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.18 
 
 
519 aa  89  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  26.61 
 
 
598 aa  88.2  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0672  Na+/solute symporter  26.05 
 
 
633 aa  88.6  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3490  sodium/proline symporter  27.88 
 
 
498 aa  88.6  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.753009  normal  0.0181041 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0350  Na+/solute symporter  24.03 
 
 
489 aa  88.2  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.82 
 
 
522 aa  87  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4604  sodium/proline symporter  28.11 
 
 
520 aa  85.9  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1264  sodium:proline symporter (proline permease)  23.46 
 
 
639 aa  85.9  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2466  SSS sodium solute transporter superfamily  23.67 
 
 
509 aa  86.3  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4963400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1860  sodium/proline symporter  28.27 
 
 
496 aa  85.9  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0914218  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  25.27 
 
 
463 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  23.95 
 
 
513 aa  84.7  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  25.27 
 
 
486 aa  84.7  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  25.05 
 
 
463 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03563  predicted transporter  23.77 
 
 
571 aa  84.3  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0024  SSS sodium solute transporter superfamily  23.77 
 
 
571 aa  84.3  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0609  sodium/solute symporter  25.94 
 
 
513 aa  84.3  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.952879  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03506  hypothetical protein  23.77 
 
 
571 aa  84.3  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4187  putative symporter YidK  23.77 
 
 
571 aa  84  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5111  putative symporter YidK  23.38 
 
 
571 aa  84  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.393136 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.44 
 
 
548 aa  83.6  0.000000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4044  putative symporter YidK  23.38 
 
 
571 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.978949 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0182  Na+/solute symporter  26.26 
 
 
478 aa  83.6  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>