More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0182 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0182  Na+/solute symporter  100 
 
 
478 aa  924    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0029  Na+/solute symporter  70.81 
 
 
488 aa  621  1e-176  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.080483 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0779  Na+/solute symporter  65.69 
 
 
482 aa  617  1e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2263  sodium/solute transporter family urea transporter  48.82 
 
 
474 aa  408  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2635  sodium/solute transporter family urea transporter  48.71 
 
 
476 aa  399  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.451328 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20424  urea transporter  25.44 
 
 
704 aa  135  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_768  predicted protein  27.31 
 
 
643 aa  129  9.000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.530084  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119678  predicted protein  25.05 
 
 
709 aa  127  5e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00418  urea transporter (Dur3), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04870)  27.83 
 
 
693 aa  119  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.798545 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  25.99 
 
 
492 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  24.38 
 
 
461 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND00530  urea transporter, putative  24.83 
 
 
674 aa  117  3e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.45321  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  26 
 
 
492 aa  117  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  25.77 
 
 
492 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  25.77 
 
 
492 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  25.77 
 
 
492 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  25.77 
 
 
492 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  25.77 
 
 
492 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  26.88 
 
 
483 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  25.53 
 
 
492 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  25.78 
 
 
492 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  26.24 
 
 
492 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  25.06 
 
 
488 aa  113  9e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07373  solute symporter family transporter (AFU_orthologue; AFUA_6G03200)  25.05 
 
 
699 aa  113  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  26.91 
 
 
482 aa  110  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02598  urea active transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17570)  22.31 
 
 
680 aa  110  5e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.811341 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  26.42 
 
 
492 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1604  Na+/solute symporter  25.12 
 
 
556 aa  107  4e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0772243 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  25.64 
 
 
492 aa  107  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  26.34 
 
 
487 aa  106  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  26.57 
 
 
492 aa  106  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  25.93 
 
 
483 aa  105  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  25.93 
 
 
492 aa  105  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  25.75 
 
 
482 aa  104  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  25.17 
 
 
493 aa  103  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  25.17 
 
 
493 aa  103  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52351  urea active transport protein  25.23 
 
 
724 aa  103  6e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0516586  normal  0.828998 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  25.17 
 
 
493 aa  103  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  25.17 
 
 
492 aa  103  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  25.17 
 
 
492 aa  103  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  25.29 
 
 
492 aa  103  8e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0718  Na+/solute symporter  26.28 
 
 
486 aa  102  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01880  Na+/proline symporter  27.7 
 
 
587 aa  102  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55023  urea permease  23.9 
 
 
659 aa  102  2e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.410596  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  24.71 
 
 
484 aa  101  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1156  sodium/proline symporter  26.09 
 
 
486 aa  100  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.307204  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2541  sodium/pantothenate symporter  25.88 
 
 
487 aa  100  6e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000222476  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  24.76 
 
 
485 aa  100  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  28.84 
 
 
487 aa  99.8  9e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07557  conserved hypothetical protein  26.65 
 
 
692 aa  99.8  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.314115  hitchhiker  0.00246133 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0248  Na+/solute symporter  24.89 
 
 
500 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0552  sodium/pantothenate symporter  25.49 
 
 
482 aa  96.3  1e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30460  Na+/proline symporter  24.72 
 
 
554 aa  95.1  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0720305  normal  0.147602 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0463  sodium/solute symporter transmembrane protein  24.36 
 
 
479 aa  95.5  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3463  proline/sodium symporter  25.29 
 
 
495 aa  95.5  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  25.64 
 
 
479 aa  95.5  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0089  Na+/solute symporter  25.46 
 
 
496 aa  94.7  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000762337  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  25.49 
 
 
513 aa  93.6  7e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0309  Na+/solute symporter  25.72 
 
 
510 aa  93.6  7e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5240  Na+/solute symporter  24.34 
 
 
460 aa  92.8  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0436  Na+/solute symporter  24.88 
 
 
478 aa  92.4  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0375  Na+/solute symporter  25 
 
 
478 aa  91.7  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.197469 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0122  Na+/solute symporter  24.04 
 
 
449 aa  91.7  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00309864  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  27.34 
 
 
509 aa  90.9  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32520  Urea active transport protein  24.25 
 
 
658 aa  90.1  8e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  26.2 
 
 
482 aa  89.7  9e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1588  sodium/proline symporter  27.69 
 
 
483 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000493204  unclonable  0.00000000000453194 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1326  Sodium/proline symporter  24.47 
 
 
488 aa  89.7  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0529188  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2865  sodium/proline symporter  27.69 
 
 
483 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.468907 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2770  sodium/proline symporter  27.69 
 
 
483 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000703765  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2790  sodium/proline symporter  27.69 
 
 
483 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276408  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  25.43 
 
 
493 aa  89.4  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0353  Na+/solute symporter  24.35 
 
 
479 aa  89  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606466  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  23.26 
 
 
506 aa  89  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0190  Na+/solute symporter  24.88 
 
 
471 aa  88.6  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0470055  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2845  Na+/solute symporter  24.56 
 
 
474 aa  88.6  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2710  Na+/solute symporter  25.21 
 
 
462 aa  88.6  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.308556  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  23.95 
 
 
493 aa  88.2  3e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  26.46 
 
 
483 aa  88.6  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0338  Na+/solute symporter  24.29 
 
 
479 aa  87  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1398  sodium/proline symporter  27.61 
 
 
483 aa  87  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0934266  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0355  Na+/solute symporter  25.45 
 
 
492 aa  87  6e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1451  sodium/proline symporter  27.61 
 
 
483 aa  86.7  9e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0423407  unclonable  0.000000000084673 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1463  sodium/proline symporter  27.38 
 
 
483 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.169082  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  25 
 
 
464 aa  84.7  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0864  hypothetical protein  23.64 
 
 
524 aa  85.1  0.000000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.983965  normal  0.0488094 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1264  sodium:proline symporter (proline permease)  23.67 
 
 
639 aa  84.3  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57505  urea transport protein  22.04 
 
 
668 aa  84.3  0.000000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20443  normal  0.667471 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4898  solute/sodium symporter (SSS) family protein  23.5 
 
 
489 aa  84  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1520  Sodium/proline symporter  26 
 
 
483 aa  84  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  25.78 
 
 
474 aa  83.2  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2469  sodium/proline symporter  25.88 
 
 
497 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00121427  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0686  Na+/solute symporter  27 
 
 
507 aa  82.8  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.663287  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1786  Na+/solute symporter  28.82 
 
 
483 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.483787  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1675  sodium/proline permease  22.58 
 
 
489 aa  82.4  0.00000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  26.2 
 
 
488 aa  82  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  27.06 
 
 
483 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29213  urea transport protein  22.27 
 
 
668 aa  82  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0581449 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1242  sodium/proline symporter  22.81 
 
 
491 aa  81.6  0.00000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1494  sodium/proline permease  22.81 
 
 
489 aa  81.6  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.858456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>