More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0779 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0779  Na+/solute symporter  100 
 
 
482 aa  952    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0182  Na+/solute symporter  65.69 
 
 
478 aa  614  9.999999999999999e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0029  Na+/solute symporter  63.64 
 
 
488 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.080483 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2263  sodium/solute transporter family urea transporter  49.25 
 
 
474 aa  421  1e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2635  sodium/solute transporter family urea transporter  48 
 
 
476 aa  414  1e-114  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.451328 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119678  predicted protein  25 
 
 
709 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20424  urea transporter  25.33 
 
 
704 aa  128  3e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_768  predicted protein  25.81 
 
 
643 aa  118  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.530084  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07373  solute symporter family transporter (AFU_orthologue; AFUA_6G03200)  25.41 
 
 
699 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00418  urea transporter (Dur3), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04870)  25.17 
 
 
693 aa  109  9.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.798545 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52351  urea active transport protein  25.47 
 
 
724 aa  107  4e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0516586  normal  0.828998 
 
 
-
 
NC_006686  CND00530  urea transporter, putative  23.78 
 
 
674 aa  106  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.45321  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2541  sodium/pantothenate symporter  26.19 
 
 
487 aa  105  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000222476  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  26 
 
 
483 aa  105  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02598  urea active transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17570)  22.33 
 
 
680 aa  105  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.811341 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  26 
 
 
461 aa  103  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1379  sodium/panthothenate symporter  27 
 
 
492 aa  103  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0385274  normal  0.372154 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5240  Na+/solute symporter  24.32 
 
 
460 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01880  Na+/proline symporter  26.35 
 
 
587 aa  101  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1604  Na+/solute symporter  25.45 
 
 
556 aa  100  5e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0772243 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  25.77 
 
 
506 aa  100  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0552  sodium/pantothenate symporter  24.63 
 
 
482 aa  99.4  1e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55023  urea permease  26 
 
 
659 aa  97.8  4e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.410596  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  24.32 
 
 
492 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07557  conserved hypothetical protein  24.03 
 
 
692 aa  95.9  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.314115  hitchhiker  0.00246133 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  25.21 
 
 
492 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  25.81 
 
 
492 aa  95.9  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  25.05 
 
 
492 aa  95.1  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  24.12 
 
 
492 aa  94.7  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  25.05 
 
 
492 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  25.05 
 
 
492 aa  95.1  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  24.12 
 
 
492 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  25.86 
 
 
488 aa  95.1  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  25 
 
 
492 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  23.58 
 
 
493 aa  94.4  4e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  25.58 
 
 
492 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32520  Urea active transport protein  24.94 
 
 
658 aa  93.2  9e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0718  Na+/solute symporter  25.64 
 
 
486 aa  92.8  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1675  sodium/proline permease  23.2 
 
 
489 aa  92.8  1e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  26.11 
 
 
482 aa  92.8  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1494  sodium/proline permease  23.2 
 
 
489 aa  92.8  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.858456  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1156  sodium/proline symporter  25.94 
 
 
486 aa  91.7  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.307204  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1854  sodium/proline permease  23.2 
 
 
489 aa  92  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.794377  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4529  Na+/solute symporter  26.44 
 
 
525 aa  91.3  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1714  sodium/panthothenate symporter  26.8 
 
 
483 aa  90.9  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000601067 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3641  sodium/panthothenate symporter  27.71 
 
 
483 aa  90.5  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000698464  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0122  Na+/solute symporter  24.32 
 
 
449 aa  90.5  6e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00309864  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  26.91 
 
 
483 aa  90.5  6e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  26.68 
 
 
482 aa  90.5  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03116  sodium/panthothenate symporter  27.71 
 
 
483 aa  90.5  7e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.735141  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03067  hypothetical protein  27.71 
 
 
483 aa  90.5  7e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.647307  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0448  sodium/pantothenate symporter  27.71 
 
 
483 aa  90.5  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.293948  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3742  sodium/panthothenate symporter  27.71 
 
 
483 aa  90.5  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150129  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0448  sodium/panthothenate symporter  27.71 
 
 
483 aa  90.5  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.024979  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4575  sodium/panthothenate symporter  27.71 
 
 
483 aa  90.5  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000690231  normal  0.130163 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3450  sodium/panthothenate symporter  27.71 
 
 
483 aa  90.5  7e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000724112  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  25 
 
 
493 aa  90.1  8e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  24.3 
 
 
485 aa  89.7  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3553  sodium/panthothenate symporter  27.23 
 
 
483 aa  89  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000280994  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2874  sodium/panthothenate symporter  25.18 
 
 
495 aa  88.2  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  27.94 
 
 
479 aa  87.8  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3742  sodium/panthothenate symporter  27.92 
 
 
483 aa  87.8  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.133198 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3321  sodium/panthothenate symporter  26.21 
 
 
494 aa  87.4  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  24.94 
 
 
482 aa  87.4  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3645  sodium/panthothenate symporter  27.68 
 
 
483 aa  87  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00060524 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3573  sodium/panthothenate symporter  27.68 
 
 
483 aa  87  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0131777  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0375  Na+/solute symporter  25.24 
 
 
478 aa  87  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.197469 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3680  sodium/panthothenate symporter  27.92 
 
 
483 aa  87.4  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.433126 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3574  sodium/panthothenate symporter  27.68 
 
 
483 aa  87  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  24.3 
 
 
492 aa  87  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  24.07 
 
 
492 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4898  solute/sodium symporter (SSS) family protein  26.73 
 
 
489 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  24.53 
 
 
492 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  24.07 
 
 
487 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3940  sodium/proline symporter  24.15 
 
 
498 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30460  Na+/proline symporter  23.28 
 
 
554 aa  86.3  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0720305  normal  0.147602 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0463  sodium/solute symporter transmembrane protein  26.34 
 
 
479 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3567  sodium/panthothenate symporter  27.9 
 
 
477 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  24.19 
 
 
492 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4055  sodium/proline symporter  24.15 
 
 
498 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  24.07 
 
 
492 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0190  Na+/solute symporter  26 
 
 
471 aa  85.1  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0470055  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1250  sodium/proline symporter  25.05 
 
 
496 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  23.83 
 
 
493 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  23.83 
 
 
493 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  23.83 
 
 
493 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  23.83 
 
 
492 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  26.57 
 
 
487 aa  84.3  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  23.83 
 
 
492 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1242  sodium/proline symporter  22.55 
 
 
491 aa  84.3  0.000000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0355  Na+/solute symporter  26.73 
 
 
492 aa  84  0.000000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1786  Na+/solute symporter  27.84 
 
 
483 aa  83.6  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.483787  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3847  sodium/proline symporter  24.39 
 
 
498 aa  84  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0248  Na+/solute symporter  23.56 
 
 
500 aa  84  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3311  sodium/panthothenate symporter  27.62 
 
 
479 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3560  sodium/panthothenate symporter  27.62 
 
 
479 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000874922 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3346  sodium/panthothenate symporter  27.75 
 
 
479 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000197319  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3607  sodium/panthothenate symporter  27.75 
 
 
479 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.258245  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3261  sodium/panthothenate symporter  27.62 
 
 
479 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0182263  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3570  sodium/panthothenate symporter  27.62 
 
 
477 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>