277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1604 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1604  Na+/solute symporter  100 
 
 
556 aa  1100    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0772243 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01880  Na+/proline symporter  58.06 
 
 
587 aa  616  1e-175  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30460  Na+/proline symporter  59.08 
 
 
554 aa  615  1e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0720305  normal  0.147602 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2263  sodium/solute transporter family urea transporter  27.3 
 
 
474 aa  126  1e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2635  sodium/solute transporter family urea transporter  26.29 
 
 
476 aa  119  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.451328 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0248  Na+/solute symporter  24.71 
 
 
500 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0686  Na+/solute symporter  27.98 
 
 
507 aa  101  4e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.663287  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0182  Na+/solute symporter  25.12 
 
 
478 aa  93.2  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07373  solute symporter family transporter (AFU_orthologue; AFUA_6G03200)  22.75 
 
 
699 aa  91.7  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4206  Na+/solute symporter  23.61 
 
 
490 aa  88.2  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153775  normal  0.0109856 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  28.67 
 
 
472 aa  87  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00530  urea transporter, putative  22.75 
 
 
674 aa  84.7  0.000000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.45321  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07557  conserved hypothetical protein  24.04 
 
 
692 aa  84  0.000000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.314115  hitchhiker  0.00246133 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0779  Na+/solute symporter  25.45 
 
 
482 aa  84  0.000000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57505  urea transport protein  24.38 
 
 
668 aa  83.2  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20443  normal  0.667471 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52351  urea active transport protein  25.94 
 
 
724 aa  81.6  0.00000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0516586  normal  0.828998 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0029  Na+/solute symporter  25.48 
 
 
488 aa  80.9  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.080483 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3641  sodium/panthothenate symporter  25.11 
 
 
483 aa  80.1  0.00000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000698464  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00418  urea transporter (Dur3), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04870)  28.29 
 
 
693 aa  79.3  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.798545 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03116  sodium/panthothenate symporter  25.11 
 
 
483 aa  80.1  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.735141  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0448  sodium/pantothenate symporter  25.11 
 
 
483 aa  80.1  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.293948  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3553  sodium/panthothenate symporter  24.89 
 
 
483 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000280994  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0448  sodium/panthothenate symporter  25.11 
 
 
483 aa  80.1  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.024979  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3680  sodium/panthothenate symporter  26.68 
 
 
483 aa  79.7  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.433126 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3742  sodium/panthothenate symporter  26.68 
 
 
483 aa  79.7  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.133198 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03067  hypothetical protein  25.11 
 
 
483 aa  80.1  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.647307  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4575  sodium/panthothenate symporter  25.11 
 
 
483 aa  80.1  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000690231  normal  0.130163 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3450  sodium/panthothenate symporter  25.11 
 
 
483 aa  80.1  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000724112  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3573  sodium/panthothenate symporter  26.68 
 
 
483 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0131777  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3742  sodium/panthothenate symporter  25.11 
 
 
483 aa  80.1  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150129  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119678  predicted protein  27.13 
 
 
709 aa  80.1  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3574  sodium/panthothenate symporter  26.68 
 
 
483 aa  79.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  29.66 
 
 
484 aa  79  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20424  urea transporter  22.73 
 
 
704 aa  78.2  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29213  urea transport protein  25.17 
 
 
668 aa  78.6  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0581449 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3645  sodium/panthothenate symporter  26.43 
 
 
483 aa  78.2  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00060524 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  28.54 
 
 
476 aa  77  0.0000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02598  urea active transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17570)  25.81 
 
 
680 aa  76.3  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.811341 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0455  sodium/panthothenate symporter  24.82 
 
 
484 aa  76.6  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1786  Na+/solute symporter  29.08 
 
 
483 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.483787  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1209  sodium/panthothenate symporter  24.82 
 
 
484 aa  76.6  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00169799  normal  0.818802 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0389  sodium/panthothenate symporter  24.82 
 
 
484 aa  76.6  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00229851  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2541  sodium/pantothenate symporter  25.42 
 
 
487 aa  76.6  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000222476  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4420  sodium/panthothenate symporter  24.2 
 
 
481 aa  75.9  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0607009  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4843  SSS sodium solute transporter superfamily  25.88 
 
 
544 aa  75.5  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3844  sodium/panthothenate symporter  22.28 
 
 
483 aa  75.1  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325661  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49064  urea transport protein  25.11 
 
 
679 aa  73.9  0.000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.427526  normal  0.0261396 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1714  sodium/panthothenate symporter  24.42 
 
 
483 aa  73.6  0.000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000601067 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  23.42 
 
 
513 aa  72.8  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  26.1 
 
 
485 aa  72.8  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  25.35 
 
 
483 aa  72.4  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1250  sodium/proline symporter  25.08 
 
 
496 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  24.14 
 
 
483 aa  72.8  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3686  sodium/panthothenate symporter  22.4 
 
 
483 aa  72  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.925299  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  22.5 
 
 
518 aa  71.2  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0422  Na+/solute symporter  24.68 
 
 
476 aa  71.2  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273483  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2710  Na+/solute symporter  24.06 
 
 
462 aa  71.2  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.308556  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02712  proline/sodium symporter  26.05 
 
 
493 aa  70.5  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.076903  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32520  Urea active transport protein  21.46 
 
 
658 aa  70.5  0.00000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2608  sodium/proline symporter  25.2 
 
 
483 aa  70.5  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0498264  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  25.71 
 
 
482 aa  68.9  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  23.01 
 
 
497 aa  69.3  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2686  sodium/proline symporter  25.11 
 
 
486 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0240  sodium/panthothenate symporter  23.37 
 
 
483 aa  69.3  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  24.81 
 
 
488 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0244  sodium/panthothenate symporter  23.37 
 
 
483 aa  68.6  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3490  sodium/proline symporter  24.22 
 
 
498 aa  67.4  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.753009  normal  0.0181041 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1520  Sodium/proline symporter  24.7 
 
 
483 aa  66.6  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  25.98 
 
 
462 aa  66.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1623  Na+/solute symporter  26.27 
 
 
466 aa  66.2  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_768  predicted protein  21.7 
 
 
643 aa  65.9  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.530084  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1081  sodium/proline symporter  25.59 
 
 
498 aa  65.1  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000772394  unclonable  0.00000000000701401 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  24.83 
 
 
459 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  23.66 
 
 
461 aa  64.3  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  22.6 
 
 
474 aa  64.3  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  24.3 
 
 
483 aa  63.9  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2877  sodium/panthothenate symporter  24.7 
 
 
481 aa  64.3  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510653 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  23.85 
 
 
482 aa  63.9  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  23.06 
 
 
492 aa  63.9  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0171  sodium/proline symporter  24.17 
 
 
496 aa  63.5  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  25.48 
 
 
492 aa  63.5  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  23.63 
 
 
493 aa  63.5  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  25.48 
 
 
492 aa  63.5  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  23.63 
 
 
493 aa  63.5  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  25.48 
 
 
492 aa  63.5  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  23.63 
 
 
492 aa  63.5  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  25.48 
 
 
492 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  25.48 
 
 
492 aa  63.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  23.63 
 
 
493 aa  63.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  25.48 
 
 
492 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  25.48 
 
 
492 aa  63.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  23.63 
 
 
492 aa  63.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  25.48 
 
 
492 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  23.82 
 
 
487 aa  63.5  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1620  Na+/solute symporter  24.46 
 
 
460 aa  62.4  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0163738 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0695  Na+/solute symporter  21.7 
 
 
492 aa  62  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.921144  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  23.27 
 
 
492 aa  61.6  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  23.66 
 
 
461 aa  61.6  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  23.82 
 
 
492 aa  61.6  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  22.58 
 
 
461 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>