80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_32520 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009046  PICST_32520  Urea active transport protein  100 
 
 
658 aa  1326    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00418  urea transporter (Dur3), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04870)  37.34 
 
 
693 aa  411  1e-113  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.798545 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52351  urea active transport protein  36.38 
 
 
724 aa  409  1e-113  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0516586  normal  0.828998 
 
 
-
 
NC_006686  CND00530  urea transporter, putative  34.21 
 
 
674 aa  395  1e-108  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.45321  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07373  solute symporter family transporter (AFU_orthologue; AFUA_6G03200)  36.57 
 
 
699 aa  378  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119678  predicted protein  34.78 
 
 
709 aa  377  1e-103  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02598  urea active transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17570)  34.48 
 
 
680 aa  345  1e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.811341 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20424  urea transporter  33.03 
 
 
704 aa  331  2e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55023  urea permease  32.12 
 
 
659 aa  328  2.0000000000000001e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.410596  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_768  predicted protein  33.33 
 
 
643 aa  320  3.9999999999999996e-86  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.530084  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29213  urea transport protein  31.27 
 
 
668 aa  299  1e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0581449 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07557  conserved hypothetical protein  33.51 
 
 
692 aa  288  2e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.314115  hitchhiker  0.00246133 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57505  urea transport protein  30.06 
 
 
668 aa  287  4e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20443  normal  0.667471 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49064  urea transport protein  30.72 
 
 
679 aa  283  7.000000000000001e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.427526  normal  0.0261396 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2263  sodium/solute transporter family urea transporter  24.84 
 
 
474 aa  102  3e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2635  sodium/solute transporter family urea transporter  25.5 
 
 
476 aa  101  4e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.451328 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0779  Na+/solute symporter  25.75 
 
 
482 aa  89.4  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0182  Na+/solute symporter  24.6 
 
 
478 aa  82  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01880  Na+/proline symporter  21.78 
 
 
587 aa  79.7  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0029  Na+/solute symporter  24.03 
 
 
488 aa  68.6  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.080483 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1604  Na+/solute symporter  22.53 
 
 
556 aa  68.6  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0772243 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  24.22 
 
 
483 aa  65.1  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  25.91 
 
 
476 aa  63.5  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0248  Na+/solute symporter  21.74 
 
 
500 aa  61.6  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30460  Na+/proline symporter  20.19 
 
 
554 aa  61.2  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0720305  normal  0.147602 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  26.39 
 
 
492 aa  58.5  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  20.82 
 
 
567 aa  57.8  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3072  SSS sodium solute transporter superfamily  22.92 
 
 
539 aa  57  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00704051  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  22.62 
 
 
482 aa  55.5  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2710  Na+/solute symporter  23.32 
 
 
462 aa  55.1  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.308556  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  26.19 
 
 
492 aa  54.7  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  25.93 
 
 
492 aa  54.3  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  25.93 
 
 
492 aa  54.3  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  25.93 
 
 
492 aa  54.3  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  25.93 
 
 
492 aa  54.3  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  25.93 
 
 
492 aa  54.3  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  25.93 
 
 
492 aa  54.3  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  25.93 
 
 
492 aa  54.3  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  24.15 
 
 
474 aa  53.9  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1671  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.14 
 
 
593 aa  53.9  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0302135 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04060  SSS sodium solute transporter  24.62 
 
 
565 aa  52.8  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.78 
 
 
526 aa  53.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0592432  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.17 
 
 
548 aa  53.1  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0993  SSS sodium solute transporter superfamily  24.47 
 
 
569 aa  52  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0554078  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  24.44 
 
 
493 aa  52  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5244  SSS sodium solute transporter superfamily  24.04 
 
 
545 aa  51.6  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0422  Na+/solute symporter  22.34 
 
 
476 aa  51.2  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273483  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0309  Na+/solute symporter  24.13 
 
 
510 aa  50.4  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14290  SSS sodium solute transporter  25.59 
 
 
566 aa  50.1  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  23.03 
 
 
492 aa  50.4  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.56 
 
 
561 aa  49.3  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  24.35 
 
 
492 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  23.92 
 
 
492 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  23.92 
 
 
492 aa  48.5  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  23.92 
 
 
492 aa  48.5  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  22.77 
 
 
537 aa  48.5  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  23.92 
 
 
492 aa  48.5  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  25.2 
 
 
492 aa  48.5  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  23.92 
 
 
493 aa  48.1  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  23.92 
 
 
493 aa  48.1  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  23.92 
 
 
493 aa  48.1  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3116  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.14 
 
 
522 aa  48.1  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  22.66 
 
 
482 aa  48.1  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4728  SSS sodium solute transporter superfamily  22.53 
 
 
549 aa  48.1  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  hitchhiker  0.00040203 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0686  Na+/solute symporter  22.34 
 
 
507 aa  48.1  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.663287  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  24.35 
 
 
492 aa  48.1  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  21.04 
 
 
464 aa  47.8  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  24.94 
 
 
488 aa  47.8  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  21.92 
 
 
485 aa  47.4  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2774  SSS sodium solute transporter superfamily  32.43 
 
 
529 aa  47  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00224729  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  23.59 
 
 
487 aa  46.6  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6118  SSS sodium solute transporter superfamily  21.73 
 
 
562 aa  46.2  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  23.04 
 
 
484 aa  46.2  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4898  solute/sodium symporter (SSS) family protein  25.08 
 
 
489 aa  45.8  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0453  Sodium/proline symporter  22.34 
 
 
494 aa  46.2  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2048  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  21.9 
 
 
550 aa  45.4  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  22.54 
 
 
506 aa  45.4  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2416  Na+/solute symporter  30.53 
 
 
575 aa  44.7  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.664159  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0552  sodium/pantothenate symporter  21.8 
 
 
482 aa  44.7  0.006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1952  Na+/solute symporter  21.24 
 
 
638 aa  43.9  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>